6q9u

HDMX (14-111; C17S) COMPLEXED WITH COMPOUND 12 AT 2.4A; Structural states of Hdm2 and HdmX: X-ray elucidation of adaptations and binding interactions for different chemical compound classes

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein Mdm4

Homo sapiens

UniProt O15151

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 ;4-[(4~{S})-5-(5-chloranyl-2-oxidanylidene-1~{H}-pyridin-3-yl)-2-[2-(dimethylamino)-4-methoxy-pyrimidin-5-yl]-6-oxidanylidene-3-propan-2-yl-4~{H}-pyrrolo[3,4-c]pyrazol-4-yl]benzenecarbonitrile ; × 1 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MDM4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–100; UniProt 14–111

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6q9u
沉积日期 deposition_date2018-12-18
结构标题 titleHDMX (14-111; C17S) COMPLEXED WITH COMPOUND 12 AT 2.4A; Structural states of Hdm2 and HdmX: X-ray elucidation of adaptations and binding interactions for different chemical compound classes
关键词 keywordsHDMX, MDM4, APOPTOSIS; APOPTOSIS
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6q9u__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6q9u__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6q9u__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)14.22 Å
Rg(电子密度)12.80 Å
总 Rg14.20 Å
原子数747
残基数86
排除体积13534 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6q9u__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd6q9ua_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.42 — SWIB/MDM2 domain
超家族 Superfamily superfamilya.42.1 — SWIB/MDM2 domain
家族 Family familya.42.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id6q9uA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology245 — MDM2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — SWIB/MDM2 domain
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7. 引用文献 (1)