6qfs

Chargeless variant of the Cellulose-binding domain from Cellulomonas fimi

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Exoglucanase/xylanase

Cellulomonas fimi

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	ACETATE ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 1 FORMIC ACID × 2 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白单体	单体	蛋白 1	1,2-ETHANEDIOL × 3 FORMIC ACID × 2 3-PYRIDINIUM-1-YLPROPANE-1-SULFONATE × 1 water × 1	与蛋白数一致
3	蛋白单体	单体	蛋白 1	ACETATE ION × 4 1,2-ETHANEDIOL × 5 FORMIC ACID × 4 water × 1	与蛋白数一致
4	蛋白单体	单体	蛋白 1	ACETATE ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 2 FORMIC ACID × 3 3-PYRIDINIUM-1-YLPROPANE-1-SULFONATE × 1 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 2-{2-[2-2-(METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 1 water × 1	与蛋白数一致
5	蛋白单体	单体	蛋白 1	1,2-ETHANEDIOL × 2 FORMIC ACID × 3 3-PYRIDINIUM-1-YLPROPANE-1-SULFONATE × 1 2-{2-[2-2-(METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 1 water × 1	与蛋白数一致
6	蛋白单体	单体	蛋白 1	1,2-ETHANEDIOL × 1 FORMIC ACID × 5 3-PYRIDINIUM-1-YLPROPANE-1-SULFONATE × 1 GLYCEROL × 1 water × 1	与蛋白数一致
7	蛋白单体	单体	蛋白 1	ACETATE ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 2 FORMIC ACID × 4 water × 1	与蛋白数一致
8	蛋白单体	单体	蛋白 1	ACETATE ION × 1 FORMIC ACID × 2 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GUX_CELFI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–106； UniProt 380–484 作者链 B； PDB构建体 2–106； UniProt 380–484 作者链 C； PDB构建体 2–106； UniProt 380–484 作者链 D； PDB构建体 2–106； UniProt 380–484 作者链 E； PDB构建体 2–106； UniProt 380–484 作者链 F； PDB构建体 2–106； UniProt 380–484 作者链 G； PDB构建体 2–106； UniProt 380–484 作者链 H； PDB构建体 2–106； UniProt 380–484

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6qfs
沉积日期 deposition_date	2019-01-10
结构标题 title	Chargeless variant of the Cellulose-binding domain from Cellulomonas fimi
关键词 keywords	EXG, cellulose-binding, uncharged, Exoglucanase, xylanase, SUGAR BINDING PROTEIN; SUGAR BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6qfs__assembly_7__model_1

Assembly 7 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6qfs__assembly_7__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6qfs__assembly_7__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	14.57 Å
Rg（电子密度）	13.34 Å
总 Rg	14.51 Å
原子数	786
残基数	106
排除体积	13650 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6qfs__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6qfs__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`6qfs__assembly_3__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`6qfs__assembly_4__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`6qfs__assembly_5__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`6qfs__assembly_6__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
7	1	`6qfs__assembly_7__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
8	1	`6qfs__assembly_8__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Exoglucanase/xylanase
分子量 formula_weight	10786.6 kDa
EC 编号 ec_number	3.2.1.91,3.2.1.8
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H
原子数 atom_count	6683

AAGCQVLWGVNQWNTGFTANVTVQNTSSAPVQGWTLTFSFPSGQQVTQAWSSTVTQSGSAVTVQNAPWNGSIPAGGTAQFGFNGSWTGTNAAPTAFSLNGTPCTVG

来源 Source

来源生物 organism	Cellulomonas fimi
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1708
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	ACETATE ION
分子量 formula_weight	59.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	FORMIC ACID
分子量 formula_weight	46.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	25

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	3-PYRIDINIUM-1-YLPROPANE-1-SULFONATE
分子量 formula_weight	201.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	DI(HYDROXYETHYL)ETHER
分子量 formula_weight	106.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	2-{2-[2-2-(METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL
分子量 formula_weight	208.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 9 Entity 9 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	213

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

结构域编号 domain_id	d6qfsa_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f
超家族 Superfamily superfamily	b.2.2 — Carbohydrate-binding domain
家族 Family family	b.2.2.1 — Cellulose-binding domain family II

结构域编号 domain_id	d6qfsb1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f
超家族 Superfamily superfamily	b.2.2 — Carbohydrate-binding domain
家族 Family family	b.2.2.1 — Cellulose-binding domain family II

结构域编号 domain_id	d6qfsb2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d6qfsc_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f
超家族 Superfamily superfamily	b.2.2 — Carbohydrate-binding domain
家族 Family family	b.2.2.1 — Cellulose-binding domain family II

结构域编号 domain_id	d6qfsd1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f
超家族 Superfamily superfamily	b.2.2 — Carbohydrate-binding domain
家族 Family family	b.2.2.1 — Cellulose-binding domain family II

结构域编号 domain_id	d6qfsd2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d6qfse_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f
超家族 Superfamily superfamily	b.2.2 — Carbohydrate-binding domain
家族 Family family	b.2.2.1 — Cellulose-binding domain family II

结构域编号 domain_id	d6qfsf_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f
超家族 Superfamily superfamily	b.2.2 — Carbohydrate-binding domain
家族 Family family	b.2.2.1 — Cellulose-binding domain family II

结构域编号 domain_id	d6qfsg1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f
超家族 Superfamily superfamily	b.2.2 — Carbohydrate-binding domain
家族 Family family	b.2.2.1 — Cellulose-binding domain family II

结构域编号 domain_id	d6qfsg2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d6qfsh1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f
超家族 Superfamily superfamily	b.2.2 — Carbohydrate-binding domain
家族 Family family	b.2.2.1 — Cellulose-binding domain family II

结构域编号 domain_id	d6qfsh2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	6qfsA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	290 —

结构域编号 domain_id	6qfsB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	290 —

结构域编号 domain_id	6qfsC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	290 —

结构域编号 domain_id	6qfsD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	290 —

结构域编号 domain_id	6qfsE00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	290 —

结构域编号 domain_id	6qfsF00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	290 —

结构域编号 domain_id	6qfsG00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	290 —

结构域编号 domain_id	6qfsH00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	290 —

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晶胞边长 a length_a	137.382 Å
晶胞边长 b length_b	137.382 Å
晶胞边长 c length_c	148.548 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	48

空间群 space_group	P 32 2 1
空间群编号 int_tables_number	154
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.200 Å
最低分辨率 resolution_low	63.005 Å
R 因子 r_factor	0.1782
R_work r_work	0.1769
R_free r_free	0.2020

Chargeless variant of the Cellulose-binding domain from Cellulomonas fimi

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Exoglucanase/xylanase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6qfs__assembly_7__model_1

6qfs__assembly_7__model_1 | I(q)

6qfs__assembly_7__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)

Chargeless variant of the Cellulose-binding domain from Cellulomonas fimi

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Exoglucanase/xylanase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6qfs__assembly_7__model_1

6qfs__assembly_7__model_1 | I(q)

6qfs__assembly_7__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)