SAXSdb — 6qj3

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Condensin complex subunit 1,Condensin complex subunit 1,Ycs4

Chaetomium thermophilum

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Condensin complex subunit 2 × 1 （G0SBJ6） Brn1 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G0SB82_CHATD
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–1098； UniProt 3–1219

Condensin complex subunit 2

Chaetomium thermophilum (strain DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719)

UniProt G0SBJ6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Condensin complex subunit 1,Condensin complex subunit 1,Ycs4 × 1 （G0SB82） Brn1 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G0SBJ6_CHATD
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 4–197； UniProt 225–418

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6qj3
沉积日期 deposition_date	2019-01-22
结构标题 title	Crystal structure of the C. thermophilum condensin Ycs4-Brn1 subcomplex
关键词 keywords	condensin SMC complex ATPase chromosome condensation loop extrusion, CELL CYCLE; CELL CYCLE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6qj3__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6qj3__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6qj3__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	43.46 Å
Rg（电子密度）	43.62 Å
总 Rg	43.41 Å
原子数	7700
残基数	1025
排除体积	137380 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6qj3__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Condensin complex subunit 1,Condensin complex subunit 1,Ycs4
分子量 formula_weight	130546.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	7700

MTVNWDINEALKNYMSDPSTIQTPEADSALVDCENDPESLLDNGLINSVLNPIVDAVAESPDAITRSHIFDSLQFLLKYTSYLSTHALSKLFDLITSGLGAEADVVHHDLESDEQELIPAHKQLLEMYGFLLQWTLTAAEAKAAEKSSTTVPARGRGKPKSKTGPGQDGTWDSVRQLETALSTMCKVLRLKLGKIFITTSERDTFIGLLTRPVYMILESEQRVKNTSIRMHAFKVLCMAVKHHGHGYAAQVSIVQNLTYFEHLSEPMAEFLHILAEQYDYPQLADEVLRELSNKEFNSNDTKGPKSVSAFMIRLSELAPRLVIKQVTLLAKQLDSESYTLRCALIEVFGNMLAYLSKSEERGENHKSQMNAFFDVLEERFLDINPYCRCRTIQVYIKLCELDQKFPKRRQRAAELACRSLMDKSSHVRRNAIKLLATLIRTHPFTALHGAQLARKDWQERLERVEAELNVLKPPPEAAGLEGDKANTSADQGLLDDATQVDSPKKRLEDMTEEEKIEAVRKAQEQAATSEAIEKLTLTKRYYTEALKFIDVLHEATPVICQLLGSKNKSEVIEAMDYFEIGDAYNIEQNKIGIRKMLRLIWTKGSSDEGKGVQTHLIECYKRLFFEAPDSFSPNDAANYIARNMISLTFGATPAELTSLEQLLHLMMKQGMIPDLVIAKLWQVYGVQRREISKKQRRGAIIVLGMLATASPEIVVGEMETMLRIGLGAHGRADLQLAKYTCIALRRINPTSRQTEKGSTTTFSRLPNDHAVLVKLAAITEVPTDNKEWYGVAEQAINAIYALSKHPDVLCSEIIRRKTRAVFARSTSKESVIGLSQLLFIVGHVAIKQIVHLELCELDFKRRKQEKDKEKAQQQEQEDNELDMIGGTTEDDFTEAMAHIRERELLFGPQSLLAQFGPMVSEICANNTVYKDRNLQQAATLCLAKLMCVSSEYCEANLPLLITIMERSPDPTVRSNAVIALGDMAVCFNHLIDENTDFLYRRLADPQPMVKRTCLMTLTFLILAGQVKVKGQLGEMAKCLEDEDKRIADLARMFFTELSTKDNAVYNHFVDMFSLLSADERIDEEAFRRIVRFLLGFVEKDKXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

来源 Source

来源生物 organism	Chaetomium thermophilum
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	209285
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Condensin complex subunit 2
分子量 formula_weight	21686.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

GHMEDGTVRKKPKKKTQRSSEATLAPSFASLQLKKLELEFAVDPFFKKASADFDEGGAKGLLLNHLMIDSQGRIVFDSSDDAEDVAEASAKPSREADDERPDSEDADADGDISMTDRDASAPGQVETQPEEEDEDVEIDVAALGAKYFPDLSILDSLDVCPSLKTFDLGDPSGSLYIPFLKVPDDWRHDQEKEKTPG

来源 Source

来源生物 organism	Chaetomium thermophilum (strain DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	759272
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Brn1
分子量 formula_weight	1720.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

来源 Source

来源生物 organism	Chaetomium thermophilum
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	209285
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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晶胞边长 a length_a	86.615 Å
晶胞边长 b length_b	81.760 Å
晶胞边长 c length_c	132.878 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	93.15 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.300 Å
最低分辨率 resolution_low	45.110 Å
R 因子 r_factor	0.2343
R_work r_work	0.2305
R_free r_free	0.2841

Crystal structure of the C. thermophilum condensin Ycs4-Brn1 subcomplex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Condensin complex subunit 1,Condensin complex subunit 1,Ycs4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Condensin complex subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6qj3__assembly_1__model_1

6qj3__assembly_1__model_1 | I(q)

6qj3__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the C. thermophilum condensin Ycs4-Brn1 subcomplex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Condensin complex subunit 1,Condensin complex subunit 1,Ycs4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Condensin complex subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6qj3__assembly_1__model_1

6qj3__assembly_1__model_1 | I(q)

6qj3__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)