6qug

GHK tagged MBP-Nup98(1-29)

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltodextrin-binding protein,Nucleoporin, putative

Tetrahymena thermophila (strain SB210)

UniProt A0A376KDN7

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
10 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 PHOSPHATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
11 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
12 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
2 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
3 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
4 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 PHOSPHATE ION × 2 water × 1 与蛋白数一致
5 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
6 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
7 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
8 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
9 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 PHOSPHATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A376KDN7_ECOLX
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 4–369; UniProt 27–392 作者链 B; PDB构建体 4–369; UniProt 27–392 作者链 C; PDB构建体 4–369; UniProt 27–392 作者链 D; PDB构建体 4–369; UniProt 27–392 作者链 E; PDB构建体 4–369; UniProt 27–392 作者链 F; PDB构建体 4–369; UniProt 27–392 作者链 G; PDB构建体 4–369; UniProt 27–392 作者链 H; PDB构建体 4–369; UniProt 27–392 作者链 I; PDB构建体 4–369; UniProt 27–392 作者链 J; PDB构建体 4–369; UniProt 27–392 作者链 K; PDB构建体 4–369; UniProt 27–392 作者链 L; PDB构建体 4–369; UniProt 27–392

Maltodextrin-binding protein,Nucleoporin, putative

Tetrahymena thermophila (strain SB210)

UniProt I7MHJ5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
10 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 PHOSPHATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
11 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
12 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
2 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
3 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
4 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 PHOSPHATE ION × 2 water × 1 与蛋白数一致
5 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
6 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
7 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
8 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
9 信息不足 单体 蛋白 1 其他聚合物 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 COPPER (II) ION × 1 PHOSPHATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 I7MHJ5_TETTS
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 374–402; UniProt 1–29 作者链 B; PDB构建体 374–402; UniProt 1–29 作者链 C; PDB构建体 374–402; UniProt 1–29 作者链 D; PDB构建体 374–402; UniProt 1–29 作者链 E; PDB构建体 374–402; UniProt 1–29 作者链 F; PDB构建体 374–402; UniProt 1–29 作者链 G; PDB构建体 374–402; UniProt 1–29 作者链 H; PDB构建体 374–402; UniProt 1–29 作者链 I; PDB构建体 374–402; UniProt 1–29 作者链 J; PDB构建体 374–402; UniProt 1–29 作者链 K; PDB构建体 374–402; UniProt 1–29 作者链 L; PDB构建体 374–402; UniProt 1–29

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6qug
沉积日期 deposition_date2019-02-27
结构标题 titleGHK tagged MBP-Nup98(1-29)
关键词 keywordsMBP fusion Nup98, transport protein; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6qug__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6qug__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6qug__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)21.87 Å
Rg(电子密度)20.73 Å
总 Rg21.80 Å
原子数2883
残基数373
排除体积51604 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6qug__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 6qug__assembly_2__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 6qug__assembly_3__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 6qug__assembly_4__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
5 1 6qug__assembly_5__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
6 1 6qug__assembly_6__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
7 1 6qug__assembly_7__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
8 1 6qug__assembly_8__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
9 1 6qug__assembly_9__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
10 1 6qug__assembly_10__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
11 1 6qug__assembly_11__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
12 1 6qug__assembly_12__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (24 domains)

结构域编号 domain_idd6quga1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.94 — Periplasmic binding protein-like II
超家族 Superfamily superfamilyc.94.1 — Periplasmic binding protein-like II
家族 Family familyc.94.1.1 — Phosphate binding protein-like
结构域编号 domain_idd6quga2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd6qugb1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.94 — Periplasmic binding protein-like II
超家族 Superfamily superfamilyc.94.1 — Periplasmic binding protein-like II
家族 Family familyc.94.1.1 — Phosphate binding protein-like
结构域编号 domain_idd6qugb2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd6qugc1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.94 — Periplasmic binding protein-like II
超家族 Superfamily superfamilyc.94.1 — Periplasmic binding protein-like II
家族 Family familyc.94.1.1 — Phosphate binding protein-like
结构域编号 domain_idd6qugc2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd6qugd1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.94 — Periplasmic binding protein-like II
超家族 Superfamily superfamilyc.94.1 — Periplasmic binding protein-like II
家族 Family familyc.94.1.1 — Phosphate binding protein-like
结构域编号 domain_idd6qugd2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd6quge1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.94 — Periplasmic binding protein-like II
超家族 Superfamily superfamilyc.94.1 — Periplasmic binding protein-like II
家族 Family familyc.94.1.1 — Phosphate binding protein-like
结构域编号 domain_idd6quge2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd6qugf1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.94 — Periplasmic binding protein-like II
超家族 Superfamily superfamilyc.94.1 — Periplasmic binding protein-like II
家族 Family familyc.94.1.1 — Phosphate binding protein-like
结构域编号 domain_idd6qugf2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd6qugg1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.94 — Periplasmic binding protein-like II
超家族 Superfamily superfamilyc.94.1 — Periplasmic binding protein-like II
家族 Family familyc.94.1.1 — Phosphate binding protein-like
结构域编号 domain_idd6qugg2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd6qugh1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.94 — Periplasmic binding protein-like II
超家族 Superfamily superfamilyc.94.1 — Periplasmic binding protein-like II
家族 Family familyc.94.1.1 — Phosphate binding protein-like
结构域编号 domain_idd6qugh2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd6qugi1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.94 — Periplasmic binding protein-like II
超家族 Superfamily superfamilyc.94.1 — Periplasmic binding protein-like II
家族 Family familyc.94.1.1 — Phosphate binding protein-like
结构域编号 domain_idd6qugi2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd6qugj1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.94 — Periplasmic binding protein-like II
超家族 Superfamily superfamilyc.94.1 — Periplasmic binding protein-like II
家族 Family familyc.94.1.1 — Phosphate binding protein-like
结构域编号 domain_idd6qugj2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd6qugk1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.94 — Periplasmic binding protein-like II
超家族 Superfamily superfamilyc.94.1 — Periplasmic binding protein-like II
家族 Family familyc.94.1.1 — Phosphate binding protein-like
结构域编号 domain_idd6qugk2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd6qugl1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.94 — Periplasmic binding protein-like II
超家族 Superfamily superfamilyc.94.1 — Periplasmic binding protein-like II
家族 Family familyc.94.1.1 — Phosphate binding protein-like
结构域编号 domain_idd6qugl2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
▶

7. 引用文献 (1)