6r0y

Thermus thermophilus V/A-type ATPase/synthase, rotational state 3

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

V-type ATP synthase alpha chain

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	V-type ATP synthase beta chain × 3 （Q56404） V-type ATP synthase subunit D × 1 （O87880） V-type ATP synthase subunit F × 1 （P74903） V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM) × 2 （Q5SIT5） V-type ATP synthase subunit E × 2 （P74901） V-type ATP synthase subunit C × 1 （P74902） V-type ATP synthase subunit I × 1 （Q5SIT6） V-type ATP synthase, subunit K × 12 （Q5SIT7） MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	VATA_THET8
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–578； UniProt 1–578 作者链 B； PDB构建体 1–578； UniProt 1–578 作者链 C； PDB构建体 1–578； UniProt 1–578

V-type ATP synthase beta chain

物种未注明

UniProt Q56404

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	V-type ATP synthase alpha chain × 3 （Q56403） V-type ATP synthase subunit D × 1 （O87880） V-type ATP synthase subunit F × 1 （P74903） V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM) × 2 （Q5SIT5） V-type ATP synthase subunit E × 2 （P74901） V-type ATP synthase subunit C × 1 （P74902） V-type ATP synthase subunit I × 1 （Q5SIT6） V-type ATP synthase, subunit K × 12 （Q5SIT7） MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	VATB_THET8
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–478； UniProt 1–478 作者链 E； PDB构建体 1–478； UniProt 1–478 作者链 F； PDB构建体 1–478； UniProt 1–478

V-type ATP synthase subunit D

物种未注明

UniProt O87880

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	V-type ATP synthase alpha chain × 3 （Q56403） V-type ATP synthase beta chain × 3 （Q56404） V-type ATP synthase subunit F × 1 （P74903） V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM) × 2 （Q5SIT5） V-type ATP synthase subunit E × 2 （P74901） V-type ATP synthase subunit C × 1 （P74902） V-type ATP synthase subunit I × 1 （Q5SIT6） V-type ATP synthase, subunit K × 12 （Q5SIT7） MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	VATD_THET8
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–223； UniProt 1–223

V-type ATP synthase subunit F

物种未注明

UniProt P74903

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	V-type ATP synthase alpha chain × 3 （Q56403） V-type ATP synthase beta chain × 3 （Q56404） V-type ATP synthase subunit D × 1 （O87880） V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM) × 2 （Q5SIT5） V-type ATP synthase subunit E × 2 （P74901） V-type ATP synthase subunit C × 1 （P74902） V-type ATP synthase subunit I × 1 （Q5SIT6） V-type ATP synthase, subunit K × 12 （Q5SIT7） MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	VATF_THET8
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–104； UniProt 1–104

V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM)

物种未注明

UniProt Q5SIT5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	V-type ATP synthase alpha chain × 3 （Q56403） V-type ATP synthase beta chain × 3 （Q56404） V-type ATP synthase subunit D × 1 （O87880） V-type ATP synthase subunit F × 1 （P74903） V-type ATP synthase subunit E × 2 （P74901） V-type ATP synthase subunit C × 1 （P74902） V-type ATP synthase subunit I × 1 （Q5SIT6） V-type ATP synthase, subunit K × 12 （Q5SIT7） MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q5SIT5_THET8
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–120； UniProt 1–120 作者链 K； PDB构建体 1–120； UniProt 1–120

V-type ATP synthase subunit E

物种未注明

UniProt P74901

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	V-type ATP synthase alpha chain × 3 （Q56403） V-type ATP synthase beta chain × 3 （Q56404） V-type ATP synthase subunit D × 1 （O87880） V-type ATP synthase subunit F × 1 （P74903） V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM) × 2 （Q5SIT5） V-type ATP synthase subunit C × 1 （P74902） V-type ATP synthase subunit I × 1 （Q5SIT6） V-type ATP synthase, subunit K × 12 （Q5SIT7） MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	VATE_THET8
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–188； UniProt 1–188 作者链 L； PDB构建体 1–188； UniProt 1–188

V-type ATP synthase subunit C

物种未注明

UniProt P74902

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	V-type ATP synthase alpha chain × 3 （Q56403） V-type ATP synthase beta chain × 3 （Q56404） V-type ATP synthase subunit D × 1 （O87880） V-type ATP synthase subunit F × 1 （P74903） V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM) × 2 （Q5SIT5） V-type ATP synthase subunit E × 2 （P74901） V-type ATP synthase subunit I × 1 （Q5SIT6） V-type ATP synthase, subunit K × 12 （Q5SIT7） MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	VATC_THET8
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–323； UniProt 1–323

V-type ATP synthase subunit I

物种未注明

UniProt Q5SIT6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	V-type ATP synthase alpha chain × 3 （Q56403） V-type ATP synthase beta chain × 3 （Q56404） V-type ATP synthase subunit D × 1 （O87880） V-type ATP synthase subunit F × 1 （P74903） V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM) × 2 （Q5SIT5） V-type ATP synthase subunit E × 2 （P74901） V-type ATP synthase subunit C × 1 （P74902） V-type ATP synthase, subunit K × 12 （Q5SIT7） MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q5SIT6_THET8
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–652； UniProt 1–652

V-type ATP synthase, subunit K

物种未注明

UniProt Q5SIT7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	V-type ATP synthase alpha chain × 3 （Q56403） V-type ATP synthase beta chain × 3 （Q56404） V-type ATP synthase subunit D × 1 （O87880） V-type ATP synthase subunit F × 1 （P74903） V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM) × 2 （Q5SIT5） V-type ATP synthase subunit E × 2 （P74901） V-type ATP synthase subunit C × 1 （P74902） V-type ATP synthase subunit I × 1 （Q5SIT6） MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q5SIT7_THET8
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 P； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 Q； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 R； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 S； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 T； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 U； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 V； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 W； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 X； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 Y； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 Z； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6r0y
沉积日期 deposition_date	2019-03-13
结构标题 title	Thermus thermophilus V/A-type ATPase/synthase, rotational state 3
关键词 keywords	ATP hydrolysis/synthesis, proton translocation, rotary catalysis, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6r0y__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6r0y__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6r0y__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	71.35 Å
Rg（电子密度）	69.73 Å
总 Rg	68.90 Å
原子数	40169
残基数	5845
排除体积	701970 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6r0y__assembly_1__model_1`	26-meric （26）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	V-type ATP synthase alpha chain
分子量 formula_weight	63700.0 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.2.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	40169

MIQGVIQKIAGPAVIAKGMLGARMYDICKVGEEGLVGEIIRLDGDTAFVQVYEDTSGLKVGEPVVSTGLPLAVELGPGMLNGIYDGIQRPLERIREKTGIYITRGVVVHALDREKKWAWTPMVKPGDEVRGGMVLGTVPEFGFTHKILVPPDVRGRVKEVKPAGEYTVEEPVVVLEDGTELKMYHTWPVRRARPVQRKLDPNTPFLTGMRILDVLFPVAMGGTAAIPGPFGSGKTVTQQSLAKWSNADVVVYVGCGERGNEMTDVLVEFPELTDPKTGGPLMHRTVLIANTSNMPVAAREASIYVGVTIAEYFRDQGFSVALMADSTSRWAEALREISSRLEEMPAEEGYPPYLAARLAAFYERAGKVITLGGEEGAVTIVGAVSPPGGDMSEPVTQSTLRIVGAFWRLDASLAFRRHFPAINWNGSYSLFTSALDPWYRENVAEDYPELRDAISELLQREAGLQEIVQLVGPDALQDAERLVIEVGRIIREDFLQQNAYHEVDAYCSMKKAYGIMKMILAFYKEAEAAIKRGVSIDEILQLPVLERIGRARYVSEEEFPAYFEEAMKEIQGAFKALA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	V-type ATP synthase beta chain
分子量 formula_weight	53219.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,E,F

MDLLKKEYTGITYISGPLLFVENAKDLAYGAIVDIKDGTGRVRGGQVIEVSEEYAVIQVFEETTGLDLATTSVSLVEDVARLGVSKEMLGRRFNGIGKPIDGLPPITPEKRLPITGLPLNPVARRKPEQFIQTGISTIDVMNTLVRGQKLPIFSGSGLPANEIAAQIARQATVRPDLSGEGEKEEPFAVVFAAMGITQRELSYFIQEFERTGALSRSVLFLNKADDPTIERILTPRMALTVAEYLAFEHDYHVLVILTDMTNYCEALREIGAAREEIPGRRGYPGYMYTDLATIYERAGVVEGKKGSVTQIPILSMPDDDRTHPIPDLTGYITEGQIQLSRELHRKGIYPPIDPLPSLSRLMNNGVGKGKTREDHKQVSDQLYSAYANGVDIRKLVAIIGEDALTENDRRYLQFADAFERFFINQGQQNRSIEESLQIAWALLSMLPQGELKRISKDHIGKYYGQKLEEIWGAPQALD

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	V-type ATP synthase subunit D
分子量 formula_weight	24715.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MSQVSPTRMNLLQRRGQLRLAQKGVDLLKKKRDALVAEFFGLVREAMEARKALDQAAKEAYAALLLAQAFDGPEVVAGAALGVPPLEGVEAEVENVWGSKVPRLKATFPDGALLSPVGTPAYTLEASRAFRRYAEALIRVANTETRLKKIGEEIKKTTRRVNALEQVVIPGIRAQIRFIQQVLEQREREDTFRLKRIKGKIEAREAEEEGGRPNPQVEIGAGL

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	V-type ATP synthase subunit F
分子量 formula_weight	11294.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MAVIADPETAQGFRLAGLEGYGASSAEEAQSLLETLVERGGYALVAVDEALLPDPERAVERLMRGRDLPVLLPIAGLKEAFQGHDVEGYMRELVRKTIGFDIKL

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM)
分子量 formula_weight	13166.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,K

MTGGLVLNAISRAGGAMGGLGLIKSLAEKEKQLLERLEAAKKEAEERVKRAEAEAKALLEEAEAKAKALEAQYRERERAETEALLARYRERAEAEAKAVREKAMARLDEAVALVLKEVLP

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	V-type ATP synthase subunit E
分子量 formula_weight	20645.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,L

MSKLEAILSQEVEAEIQALLQEAEAKAEAVKREAEEKAKALLQARERALEAQYRAALRRAESAGELLVATARTQARGEVLEEVRRRVREALEALPQKPEWPEVVRKLALEALEALPGAKALVANPEDLPHLEALARERGVELQAEPALRLGVRAVGAEGKTQVENSLLARLDRAWDALSSKVAQALWG

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	V-type ATP synthase subunit C
分子量 formula_weight	35968.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MADDFAYLNARVRVRRGTLLKESFFQEALDLSFADFLRLLSETVYGGELAGQGLPDVDRAVLRTQAKLVGDLPRLVTGEAREAVRLLLLRNDLHNLQALLRAKATGRPFEEVLLLPGTLREEVWRQAYEAQDPAGMAQVLAVPGHPLARALRAVLRETQDLARVEALLAKRFFEDVAKAAKGLDQPALRDYLALEVDAENLRTAFKLQGSGLAPDAFFLKGGRFVDRVRFARLMEGDYAVLDELSGTPFSGLSGVRDLKALERGLRCVLLKEAKKGVQDPLGVGLVLAYVKEREWEAVRLRLLARRAYFGLPRAQVEEEVVCP

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	V-type ATP synthase subunit I
分子量 formula_weight	72204.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MIAPMEKLVLAGPKGRAKELLQSLQQAGVVHLETLRPEALSAYQLSPEERAELRRWEAVSAGAEHTLSLLGLEAEPARPFPEGLEAAEKALSPIQAHAEGLTRQKQELEEELALAQAYLEPLERLAALAHGLDKSPFLRVIPFLLTEKELPLVEEALRKALEDRYLLAHEAYAGGVAALVVVHRKEVDQAKAALSRAGVAELRLPGALGELPLSEAARRLKERAEAAPRELSEVRQHLAKLARESASTLQSLWTRAQDEVARLKALEELASGRFGFALLGYVPVKAKPKVEEALARHKESVVYAFEPVDEHHEADRIPVVLDNPPWAKPFELLVSFLNTPKYGTFDPTPVVPVFFPFWFGMIVGDIGYALLFYLVGRWLSGYVKRNEPLVIDLFALKLKPQVIGKLVHILNWMVFWTVVWGVIYGEFFGTFLEHLGVFGTPEHPGLIPILIHRIDTAKTANLLILLSVAFGVVLVFFGLALRAYLGLKHRHMAHFWEGVGYLGGLVGVLALAASYLGNLQAGWLQGLMYLGFGVFLLAVLMSRIWLMIPEIFTQAGHILSHIRIYAVGAAGGILAGLLTDVGFALAERLGLLGVLLGLLVAGVLHLLILLLTTLGHMLQPIRLLWVEFFTKFGFYEENGRPYRPFKSVREAQ

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	V-type ATP synthase, subunit K
分子量 formula_weight	9841.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z

MKKLLVTVLLAVFGALAFAAEEAAASGGLDRGLIAVGMGLAVGLAALGTGVAQARIGAAGVGAIAEDRSNFGTALIFLLLPETLVIFGLLIAFILNGRL

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 31 domains

CATH v4.4 (31 domains)

结构域编号 domain_id	6r0yA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	6r0yA03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	6r0yA04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1140 — Bovine Mitochondrial F1-ATPase, ATP Synthase Beta Chain; Chain D, domain3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bovine Mitochondrial F1-atpase; Atp Synthase Beta Chain; Chain D, domain 3

结构域编号 domain_id	6r0yB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	6r0yB03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	6r0yB04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1140 — Bovine Mitochondrial F1-ATPase, ATP Synthase Beta Chain; Chain D, domain3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bovine Mitochondrial F1-atpase; Atp Synthase Beta Chain; Chain D, domain 3

结构域编号 domain_id	6r0yC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	6r0yC03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	6r0yC04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1140 — Bovine Mitochondrial F1-ATPase, ATP Synthase Beta Chain; Chain D, domain3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bovine Mitochondrial F1-atpase; Atp Synthase Beta Chain; Chain D, domain 3

结构域编号 domain_id	6r0yD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	12240 —

结构域编号 domain_id	6r0yE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	12240 —

结构域编号 domain_id	6r0yF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	12240 —

结构域编号 domain_id	6r0yJ01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	620 — F1F0 ATP synthase subunit B, membrane domain

结构域编号 domain_id	6r0yJ02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	2320 — hypothetical protein PF0899 fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — ATP synthase, E subunit, C-terminal

结构域编号 domain_id	6r0yL01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	620 — F1F0 ATP synthase subunit B, membrane domain

结构域编号 domain_id	6r0yL02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	2320 — hypothetical protein PF0899 fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — ATP synthase, E subunit, C-terminal

结构域编号 domain_id	6r0yM01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	132 — Topoisomerase I; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — ATP synthase (C/AC39) subunit, domain 3

结构域编号 domain_id	6r0yM02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1690 — V-type ATP synthase subunit C fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — V-type ATP synthase subunit C domain

结构域编号 domain_id	6r0yM03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1690 — V-type ATP synthase subunit C fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — V-type ATP synthase subunit C domain

结构域编号 domain_id	6r0yO00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	6r0yP00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	6r0yQ00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	6r0yR00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	6r0yS00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	6r0yT00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	6r0yU00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	6r0yV00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	6r0yW00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	6r0yX00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	6r0yY00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	6r0yZ00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.90 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	23821

Thermus thermophilus V/A-type ATPase/synthase, rotational state 3

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

V-type ATP synthase alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type ATP synthase beta chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type ATP synthase subunit D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type ATP synthase subunit F

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type ATP synthase subunit E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type ATP synthase subunit C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type ATP synthase subunit I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type ATP synthase, subunit K

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6r0y__assembly_1__model_1

6r0y__assembly_1__model_1 | I(q)

6r0y__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment