6rx7

Structure of the KIV type 2 (KIV-2) domain of lipoprotein (a)

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Apolipoprotein(a)

Homo sapiens

UniProt P08519

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 GLYCEROL × 4 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 GLYCEROL × 3 SULFATE ION × 2 water × 1 与蛋白数一致
3 蛋白单体 单体 蛋白 1 GLYCEROL × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 APOA_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 16–111; UniProt 131–226 作者链 B; PDB构建体 16–111; UniProt 131–226 作者链 C; PDB构建体 16–111; UniProt 131–226

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6rx7
沉积日期 deposition_date2019-06-07
结构标题 titleStructure of the KIV type 2 (KIV-2) domain of lipoprotein (a)
关键词 keywordsLipoprotein (a), kringle IV type 2, KIV-2, Lp(a)., LIPID TRANSPORT; LIPID TRANSPORT
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6rx7__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6rx7__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6rx7__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)12.71 Å
Rg(电子密度)11.55 Å
总 Rg12.86 Å
原子数647
残基数79
排除体积11130 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6rx7__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 6rx7__assembly_2__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 6rx7__assembly_3__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd6rx7a_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd6rx7b_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd6rx7c1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd6rx7c2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id6rx7A00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4

7. 引用文献 (1)