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6s4t

LXRbeta ligand binding domain in comlpex with small molecule inhibitors

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 65.7 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Oxysterols receptor LXR-beta

Homo sapiens

UniProt P55055

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 216–460 未记录 KVB 2-[4-[[3-[3-(phenylmethyl)-8-(trifluoromethyl)quinolin-4-yl]phenoxy]methyl]phenyl]ethanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；100 mM Bis-Tris pH 6.5, 2 M sodium formate and 100 mM NaCl 分辨率 2.00 Å R-free 0.238

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6S4T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1P8D X-Ray Crystal Structure of LXR Ligand Binding Domain with 24(S),25-epoxycholesterol 提交 2003-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 214–461（248 aa） 片段：Liver X Receptor beta ligand binding domain (residues 214-461)
未记录 CO1 17-[3-(3,3-DIMETHYL-OXIRANYL)-1-METHYL-PROPYL]-10,13-DIMETHYL-2,3,4,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17-TETRADECAHYDRO-1H-CYC LOPENTA[A]PHENANTHREN-3-OL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；10-12% PEG3350-8000, 0.2M NaCl , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.277
1P8D X-Ray Crystal Structure of LXR Ligand Binding Domain with 24(S),25-epoxycholesterol 提交 2003-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 214–461（248 aa） 片段：Liver X Receptor beta ligand binding domain (residues 214-461)
未记录 CO1 17-[3-(3,3-DIMETHYL-OXIRANYL)-1-METHYL-PROPYL]-10,13-DIMETHYL-2,3,4,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17-TETRADECAHYDRO-1H-CYC LOPENTA[A]PHENANTHREN-3-OL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；10-12% PEG3350-8000, 0.2M NaCl , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.277
1P8D X-Ray Crystal Structure of LXR Ligand Binding Domain with 24(S),25-epoxycholesterol 提交 2003-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 214–461（248 aa） 片段：Liver X Receptor beta ligand binding domain (residues 214-461)
链 B 214–461（248 aa） 片段：Liver X Receptor beta ligand binding domain (residues 214-461)
未记录 CO1 17-[3-(3,3-DIMETHYL-OXIRANYL)-1-METHYL-PROPYL]-10,13-DIMETHYL-2,3,4,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17-TETRADECAHYDRO-1H-CYC LOPENTA[A]PHENANTHREN-3-OL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；10-12% PEG3350-8000, 0.2M NaCl , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.277
1PQ6 HUMAN LXR BETA HORMONE RECEPTOR / GW3965 COMPLEX 提交 2003-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-461
链 B 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-461
未记录 965 [3-(3-{[2-chloro-3-(trifluoromethyl)benzyl](2,2-diphenylethyl)amino}propoxy)phenyl]acetic acid × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；isopropanol, PEG 4000, HEPES, glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.40 Å R-free 0.262
1PQ6 HUMAN LXR BETA HORMONE RECEPTOR / GW3965 COMPLEX 提交 2003-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-461
链 D 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-461
未记录 965 [3-(3-{[2-chloro-3-(trifluoromethyl)benzyl](2,2-diphenylethyl)amino}propoxy)phenyl]acetic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；isopropanol, PEG 4000, HEPES, glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.40 Å R-free 0.262
1PQ6 HUMAN LXR BETA HORMONE RECEPTOR / GW3965 COMPLEX 提交 2003-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-461
链 C 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-461
链 D 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-461
未记录 965 [3-(3-{[2-chloro-3-(trifluoromethyl)benzyl](2,2-diphenylethyl)amino}propoxy)phenyl]acetic acid × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；isopropanol, PEG 4000, HEPES, glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.40 Å R-free 0.262
1PQ9 HUMAN LXR BETA HORMONE RECEPTOR COMPLEXED WITH T0901317 COMPLEX 提交 2003-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-461
链 B 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-461
未记录 BNS benzenesulfonic acid × 2 44B 1,1,1,3,3,3-HEXAFLUORO-2-{4-[(2,2,2-TRIFLUOROETHYL)AMINO]PHENYL}PROPAN-2-OL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；isopropanol, peg 4000, hepes, glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.10 Å R-free 0.254
1PQ9 HUMAN LXR BETA HORMONE RECEPTOR COMPLEXED WITH T0901317 COMPLEX 提交 2003-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-461
链 D 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-461
未记录 BNS benzenesulfonic acid × 2 44B 1,1,1,3,3,3-HEXAFLUORO-2-{4-[(2,2,2-TRIFLUOROETHYL)AMINO]PHENYL}PROPAN-2-OL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；isopropanol, peg 4000, hepes, glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.10 Å R-free 0.254
1PQ9 HUMAN LXR BETA HORMONE RECEPTOR COMPLEXED WITH T0901317 COMPLEX 提交 2003-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-461
链 B 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-461
链 C 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-461
链 D 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-461
未记录 BNS benzenesulfonic acid × 4 44B 1,1,1,3,3,3-HEXAFLUORO-2-{4-[(2,2,2-TRIFLUOROETHYL)AMINO]PHENYL}PROPAN-2-OL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；isopropanol, peg 4000, hepes, glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.10 Å R-free 0.254
1PQ9 HUMAN LXR BETA HORMONE RECEPTOR COMPLEXED WITH T0901317 COMPLEX 提交 2003-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-461
链 D 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-461
未记录 BNS benzenesulfonic acid × 2 44B 1,1,1,3,3,3-HEXAFLUORO-2-{4-[(2,2,2-TRIFLUOROETHYL)AMINO]PHENYL}PROPAN-2-OL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；isopropanol, peg 4000, hepes, glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.10 Å R-free 0.254
1PQC HUMAN LXR BETA HORMONE RECEPTOR COMPLEXED WITH T0901317 提交 2003-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-261
链 B 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-261
未记录 444 N-(2,2,2-TRIFLUOROETHYL)-N-{4-[2,2,2-TRIFLUORO-1-HYDROXY-1-(TRIFLUOROMETHYL)ETHYL]PHENYL}BENZENESULFONAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；isopropanol, peg 4000, hepes, glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.80 Å R-free 0.262
1PQC HUMAN LXR BETA HORMONE RECEPTOR COMPLEXED WITH T0901317 提交 2003-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-261
链 D 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-261
未记录 444 N-(2,2,2-TRIFLUOROETHYL)-N-{4-[2,2,2-TRIFLUORO-1-HYDROXY-1-(TRIFLUOROMETHYL)ETHYL]PHENYL}BENZENESULFONAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；isopropanol, peg 4000, hepes, glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.80 Å R-free 0.262
1PQC HUMAN LXR BETA HORMONE RECEPTOR COMPLEXED WITH T0901317 提交 2003-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-261
链 B 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-261
链 C 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-261
链 D 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding domain, residues 213-261
未记录 444 N-(2,2,2-TRIFLUOROETHYL)-N-{4-[2,2,2-TRIFLUORO-1-HYDROXY-1-(TRIFLUOROMETHYL)ETHYL]PHENYL}BENZENESULFONAMIDE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；isopropanol, peg 4000, hepes, glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.80 Å R-free 0.262
1UPV Crystal structure of the human Liver X receptor beta ligand binding domain in complex with a synthetic agonist 提交 2003-10-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 209–461（253 aa） 片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 209-461
未记录 444 N-(2,2,2-TRIFLUOROETHYL)-N-{4-[2,2,2-TRIFLUORO-1-HYDROXY-1-(TRIFLUOROMETHYL)ETHYL]PHENYL}BENZENESULFONAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；RESERVOIR: 25% MPD, 10% PEG4K, 100 MM HEPES PH 7.5, 10 MM D PROTEIN: 4-8 MG/ML IN 20 MM TRIS PH 8.0, 100 MM NACL, 10 MM
分辨率 2.10 Å R-free 0.274
1UPW Crystal structure of the human Liver X receptor beta ligand binding domain in complex with a synthetic agonist 提交 2003-10-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 209–461（253 aa） 片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 209-461
未记录 444 N-(2,2,2-TRIFLUOROETHYL)-N-{4-[2,2,2-TRIFLUORO-1-HYDROXY-1-(TRIFLUOROMETHYL)ETHYL]PHENYL}BENZENESULFONAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；RESERVOIR: 25% MPD, 10% PEG4K, 100 MM HEPES PH 7.5, 10 MM D PROTEIN: 4-8 MG/ML IN 20 MM TRIS PH 8.0, 100 MM NACL, 10 MM
分辨率 2.40 Å R-free 0.295
3KFC Complex Structure of LXR with an agonist 提交 2009-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding Domain
链 B 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding Domain
未记录 61X 4-{3-[3-(methylsulfonyl)phenoxy]phenyl}-8-(trifluoromethyl)quinoline × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；292 K；0.1 M Hepes, 15% PEG4K, 5.33% iso-propanol, 6.4% glycerol, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.40 Å R-free 0.284
3KFC Complex Structure of LXR with an agonist 提交 2009-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding Domain
链 D 213–461（249 aa） 片段：Ligand binding Domain
未记录 61X 4-{3-[3-(methylsulfonyl)phenoxy]phenyl}-8-(trifluoromethyl)quinoline × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；292 K；0.1 M Hepes, 15% PEG4K, 5.33% iso-propanol, 6.4% glycerol, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.40 Å R-free 0.284
3L0E X-ray crystal structure of a Potent Liver X Receptor Modulator 提交 2009-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 213–461（249 aa） 片段：UNP residues 213-461
突变：C238S, C326S, R361S, R362S, Q445A, K447A, K448A G58 N-(2-chloro-6-fluorobenzyl)-1-methyl-N-{[3'-(methylsulfonyl)biphenyl-4-yl]methyl}-1H-imidazole-4-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；1:1 (v/v) ratio of the protein complex and PEG 2K MME 20%, 0.2mM MgCl2, 0.1mM TRIS HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.237
3L0E X-ray crystal structure of a Potent Liver X Receptor Modulator 提交 2009-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 213–461（249 aa） 片段：UNP residues 213-461
突变：C238S, C326S, R361S, R362S, Q445A, K447A, K448A G58 N-(2-chloro-6-fluorobenzyl)-1-methyl-N-{[3'-(methylsulfonyl)biphenyl-4-yl]methyl}-1H-imidazole-4-sulfonamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；1:1 (v/v) ratio of the protein complex and PEG 2K MME 20%, 0.2mM MgCl2, 0.1mM TRIS HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.237
4DK7 Crystal structure of LXR ligand binding domain in complex with full agonist 1 提交 2012-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 218–460（243 aa） 片段：UNP residues 218-460
链 C 218–460（243 aa） 片段：UNP residues 218-460
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 0KS N-[4-(1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-hydroxypropan-2-yl)phenyl]-N-methylbenzenesulfonamide × 2 ACT ACETATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；0.1 M Tris pH 8, 12% PEG 10000, 0.2 M calcium acetate, 0.005 M DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 2.45 Å R-free 0.270
4DK8 Crystal structure of LXR ligand binding domain in complex with partial agonist 5 提交 2012-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 218–460（243 aa） 片段：UNP residues 218-460
链 C 218–460（243 aa） 片段：UNP residues 218-460
未记录 0KT N-methyl-N-(4-{(1S)-2,2,2-trifluoro-1-hydroxy-1-[1-(2-methoxyethyl)-1H-pyrrol-2-yl]ethyl}phenyl)benzenesulfonamide × 2 ACT ACETATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；0.1 M Tris, 12% PEG 10000, 0.2 M calcium acetate, 0.005 M DTT, pH 8, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 2.75 Å R-free 0.278
4RAK Crystal structure of nuclear receptor subfamily 1, group h, member 2 (lxrb) complexed with partial agonist 提交 2014-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 213–460（248 aa） 片段：UNP residues 213-460
链 B 213–460（248 aa） 片段：UNP residues 213-460
未记录 BU1 1,4-BUTANEDIOL × 3 652 2-{2-[2-(2-chlorophenyl)propan-2-yl]-1-[3'-(methylsulfonyl)biphenyl-4-yl]-1H-imidazol-4-yl}propan-2-ol × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.04 Å R-free 0.271
4RAK Crystal structure of nuclear receptor subfamily 1, group h, member 2 (lxrb) complexed with partial agonist 提交 2014-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 213–460（248 aa） 片段：UNP residues 213-460
链 B 213–460（248 aa） 片段：UNP residues 213-460
未记录 BU1 1,4-BUTANEDIOL × 6 652 2-{2-[2-(2-chlorophenyl)propan-2-yl]-1-[3'-(methylsulfonyl)biphenyl-4-yl]-1H-imidazol-4-yl}propan-2-ol × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.04 Å R-free 0.271
5HJP Identification of LXRbeta selective agonists for the treatment of Alzheimer's Disease 提交 2016-01-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 216–460（245 aa）
突变：Q258A,R260G,D261S,R263S 668 2-chloro-4-{1'-[(2R)-2-hydroxy-3-methyl-2-(trifluoromethyl)butanoyl]-4,4'-bipiperidin-1-yl}-N,N-dimethylbenzamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；16% to 22% PEG3350, 0.2M K-Na Tartrate
分辨率 2.60 Å R-free 0.283
5HJP Identification of LXRbeta selective agonists for the treatment of Alzheimer's Disease 提交 2016-01-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 216–460（245 aa）
突变：Q258A,R260G,D261S,R263S 668 2-chloro-4-{1'-[(2R)-2-hydroxy-3-methyl-2-(trifluoromethyl)butanoyl]-4,4'-bipiperidin-1-yl}-N,N-dimethylbenzamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；16% to 22% PEG3350, 0.2M K-Na Tartrate
分辨率 2.60 Å R-free 0.283
5I4V Discovery of novel, orally efficacious Liver X Receptor (LXR) beta agonists 提交 2016-02-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 210–460（251 aa）
突变：Q259A, R261G, D262S, R264S,Q259A, R261G, D262S, R264S,Q259A, R261G, D262S, R264S,Q259A, R261G, D262S, R264S 67S {2-[(2R)-4-[4-(hydroxymethyl)-3-(methylsulfonyl)phenyl]-2-(propan-2-yl)piperazin-1-yl]-4-(trifluoromethyl)pyrimidin-5-yl}methanol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；1uL of scLXRbeta-LBD/scRXRbeta-LBD @ 10 mg protein/ml in 20 mM Tris-HCl pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM DTT containing 1mM ligand and less than 2%(v/v) DMSO was mixed with 1uL of reservoir solution (0.2M LiCl, 16-20%(w/v) PEG3350, 7-10%(v/v) ethylene glycol, 0.01M Strontium chloride) on a circular, silanized glass cover slide and inverted and sealed with silicon grease over a well of 200uL of reservoir solution. Crystallization plates were incubated at 23 deg C for 2-5 days before rods would appear measuring 50 to 100um long.
分辨率 2.61 Å R-free 0.248
5I4V Discovery of novel, orally efficacious Liver X Receptor (LXR) beta agonists 提交 2016-02-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 210–460（251 aa）
突变：Q259A, R261G, D262S, R264S,Q259A, R261G, D262S, R264S,Q259A, R261G, D262S, R264S,Q259A, R261G, D262S, R264S 67S {2-[(2R)-4-[4-(hydroxymethyl)-3-(methylsulfonyl)phenyl]-2-(propan-2-yl)piperazin-1-yl]-4-(trifluoromethyl)pyrimidin-5-yl}methanol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；1uL of scLXRbeta-LBD/scRXRbeta-LBD @ 10 mg protein/ml in 20 mM Tris-HCl pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM DTT containing 1mM ligand and less than 2%(v/v) DMSO was mixed with 1uL of reservoir solution (0.2M LiCl, 16-20%(w/v) PEG3350, 7-10%(v/v) ethylene glycol, 0.01M Strontium chloride) on a circular, silanized glass cover slide and inverted and sealed with silicon grease over a well of 200uL of reservoir solution. Crystallization plates were incubated at 23 deg C for 2-5 days before rods would appear measuring 50 to 100um long.
分辨率 2.61 Å R-free 0.248
5JY3 CRYSTAL STRUCTURE OF LXRbeta (NUCLEAR RECEPTOR SUBFAMILY 1, GROUP H, MEMBER 2) COMPLEXED WITH BMS-852927 提交 2016-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 213–460（248 aa） 片段：UNP residues 213-460
链 B 213–460（248 aa） 片段：UNP residues 213-460
未记录 6OX 2-[2-[2-[2,6-bis(chloranyl)phenyl]propan-2-yl]-1-[2-fluoranyl-4-[3-fluoranyl-4-(hydroxymethyl)-5-methylsulfonyl-phenyl] phenyl]imidazol-4-yl]propan-2-ol × 2 BU1 1,4-BUTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K
分辨率 2.40 Å R-free 0.268
5JY3 CRYSTAL STRUCTURE OF LXRbeta (NUCLEAR RECEPTOR SUBFAMILY 1, GROUP H, MEMBER 2) COMPLEXED WITH BMS-852927 提交 2016-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 213–460（248 aa） 片段：UNP residues 213-460
链 D 213–460（248 aa） 片段：UNP residues 213-460
未记录 6OX 2-[2-[2-[2,6-bis(chloranyl)phenyl]propan-2-yl]-1-[2-fluoranyl-4-[3-fluoranyl-4-(hydroxymethyl)-5-methylsulfonyl-phenyl] phenyl]imidazol-4-yl]propan-2-ol × 2 BU1 1,4-BUTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K
分辨率 2.40 Å R-free 0.268
5KYA Brain penetrant liver X receptor (LXR) modulators based on a 2,4,5,6-tetrahydropyrrolo[3,4-c]pyrazole core 提交 2016-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 209–460（252 aa）
突变：G213H, E214M, Q259A, R261G, D262S, R264S 6Y4 [2-[(6~{R})-2-(3-methylsulfonylphenyl)-6-propan-2-yl-4,6-dihydropyrrolo[3,4-c]pyrazol-5-yl]-4-(trifluoromethyl)pyrimidin-5-yl]methanol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；1uL of scLXRbeta-LBD/scRXRbeta-LBD @ 10 mg protein/ml in 20 mM Tris-HCl pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM DTT containing 1mM ligand and less than 2%(v/v) DMSO was mixed with 1uL of reservoir solution (0.2M LiCl, 16-20%(w/v) PEG3350, 7-10%(v/v) ethylene glycol, 0.01M Strontium chloride) on a circular, silanized glass cover slide and inverted and sealed with silicon grease over a well of 200uL of reservoir solution. Crystallization plates were incubated at 23 deg C for 2-5 days before rods would appear measuring 50 to 100um long.
分辨率 2.60 Å R-free 0.249
5KYA Brain penetrant liver X receptor (LXR) modulators based on a 2,4,5,6-tetrahydropyrrolo[3,4-c]pyrazole core 提交 2016-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 209–460（252 aa）
突变：G213H, E214M, Q259A, R261G, D262S, R264S 6Y4 [2-[(6~{R})-2-(3-methylsulfonylphenyl)-6-propan-2-yl-4,6-dihydropyrrolo[3,4-c]pyrazol-5-yl]-4-(trifluoromethyl)pyrimidin-5-yl]methanol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；1uL of scLXRbeta-LBD/scRXRbeta-LBD @ 10 mg protein/ml in 20 mM Tris-HCl pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM DTT containing 1mM ligand and less than 2%(v/v) DMSO was mixed with 1uL of reservoir solution (0.2M LiCl, 16-20%(w/v) PEG3350, 7-10%(v/v) ethylene glycol, 0.01M Strontium chloride) on a circular, silanized glass cover slide and inverted and sealed with silicon grease over a well of 200uL of reservoir solution. Crystallization plates were incubated at 23 deg C for 2-5 days before rods would appear measuring 50 to 100um long.
分辨率 2.60 Å R-free 0.249
5KYJ Brain penetrant liver X receptor (LXR) modulators based on a 2,4,5,6-tetrahydropyrrolo[3,4-c]pyrazole core 提交 2016-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 210–460（251 aa）
突变：G213H, E214M, Q259A, R261G, D262S, R264S 6Y8 (6~{R})-5-(5-fluoranyl-2-methoxy-pyrimidin-4-yl)-2-(3-methylsulfonylphenyl)-6-propan-2-yl-4,6-dihydropyrrolo[3,4-c]pyrazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；1uL of scLXRbeta-LBD/scRXRbeta-LBD @ 10 mg protein/ml in 20 mM Tris-HCl pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM DTT containing 1mM ligand and less than 2%(v/v) DMSO was mixed with 1uL of reservoir solution (0.2M LiCl, 16-20%(w/v) PEG3350, 7-10%(v/v) ethylene glycol, 0.01M Strontium chloride) on a circular, silanized glass cover slide and inverted and sealed with silicon grease over a well of 200uL of reservoir solution. Crystallization plates were incubated at 23 deg C for 2-5 days before rods would appear measuring 50 to 100um long.
分辨率 2.80 Å R-free 0.253
5KYJ Brain penetrant liver X receptor (LXR) modulators based on a 2,4,5,6-tetrahydropyrrolo[3,4-c]pyrazole core 提交 2016-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 210–460（251 aa）
突变：G213H, E214M, Q259A, R261G, D262S, R264S 6Y8 (6~{R})-5-(5-fluoranyl-2-methoxy-pyrimidin-4-yl)-2-(3-methylsulfonylphenyl)-6-propan-2-yl-4,6-dihydropyrrolo[3,4-c]pyrazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；1uL of scLXRbeta-LBD/scRXRbeta-LBD @ 10 mg protein/ml in 20 mM Tris-HCl pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM DTT containing 1mM ligand and less than 2%(v/v) DMSO was mixed with 1uL of reservoir solution (0.2M LiCl, 16-20%(w/v) PEG3350, 7-10%(v/v) ethylene glycol, 0.01M Strontium chloride) on a circular, silanized glass cover slide and inverted and sealed with silicon grease over a well of 200uL of reservoir solution. Crystallization plates were incubated at 23 deg C for 2-5 days before rods would appear measuring 50 to 100um long.
分辨率 2.80 Å R-free 0.253
6JIO Human LXR-beta in complex with a ligand 提交 2019-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 214–460（247 aa）
链 C 214–460（247 aa）
突变：Q259A, R261G, D262S, R264S 突变：Q259A, R261G, D262S, R264S BQ3 tert-butyl 7-amino-3,4-dihydroisoquinoline-2(1H)-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；281 K；22% PEG 3350, 0.1 M Tris HCl pH 8.5
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
6JIO Human LXR-beta in complex with a ligand 提交 2019-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 214–460（247 aa）
链 D 214–460（247 aa）
突变：Q259A, R261G, D262S, R264S 突变：Q259A, R261G, D262S, R264S BQ3 tert-butyl 7-amino-3,4-dihydroisoquinoline-2(1H)-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；281 K；22% PEG 3350, 0.1 M Tris HCl pH 8.5
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
6K9G Human LXR-beta in complex with an agonist 提交 2019-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 214–460（247 aa）
链 C 214–460（247 aa）
突变：Q259A, R261G, D262S, R264S 突变：Q259A, R261G, D262S, R264S D3R ~{tert}-butyl (2'~{R},3~{R})-2'-[3-[4-(hydroxymethyl)-3-methylsulfonyl-phenyl]phenyl]-2-oxidanylidene-spiro[1~{H}-indole-3,3'-pyrrolidine]-1'-carboxylate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；281 K；22% PEG 3350, 0.1M Tris HCl pH 8.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
6K9G Human LXR-beta in complex with an agonist 提交 2019-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 214–460（247 aa）
链 D 214–460（247 aa）
突变：Q259A, R261G, D262S, R264S 突变：Q259A, R261G, D262S, R264S D3R ~{tert}-butyl (2'~{R},3~{R})-2'-[3-[4-(hydroxymethyl)-3-methylsulfonyl-phenyl]phenyl]-2-oxidanylidene-spiro[1~{H}-indole-3,3'-pyrrolidine]-1'-carboxylate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；281 K；22% PEG 3350, 0.1M Tris HCl pH 8.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
6K9H Human LXR-beta in complex with an agonist 提交 2019-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 214–460（247 aa）
链 B 214–460（247 aa）
突变：Q259A, R261G, D262S, R264S 突变：Q259A, R261G, D262S, R264S D40 ~{tert}-butyl (2'~{S},3~{S})-2-oxidanylidene-2'-phenyl-spiro[1~{H}-indole-3,3'-pyrrolidine]-1'-carboxylate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；22% PEG 3350, 0.1 M Tris HCl, pH 8.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.287
6K9M Human LXR-beta in complex with an agonist 提交 2019-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 214–460（247 aa）
链 C 214–460（247 aa）
突变：Q259A, R261G, D262S, R264S 突变：Q259A, R261G, D262S, R264S D43 ~{tert}-butyl (2'~{S},3~{S})-2-oxidanylidene-2'-propan-2-yl-spiro[1~{H}-indole-3,3'-pyrrolidine]-1'-carboxylate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；22% PEG3350, 0.1 M Tris HCl, pH8.5
分辨率 2.90 Å R-free 0.280
6K9M Human LXR-beta in complex with an agonist 提交 2019-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 214–460（247 aa）
链 D 214–460（247 aa）
突变：Q259A, R261G, D262S, R264S 突变：Q259A, R261G, D262S, R264S D43 ~{tert}-butyl (2'~{S},3~{S})-2-oxidanylidene-2'-propan-2-yl-spiro[1~{H}-indole-3,3'-pyrrolidine]-1'-carboxylate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；22% PEG3350, 0.1 M Tris HCl, pH8.5
分辨率 2.90 Å R-free 0.280
6S4N LXRbeta ligand binding domain in comlpex with small molecule inhibitors 提交 2019-06-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 216–460（245 aa）
未记录 KUW 2-[5-chloranyl-6-[4-[[1,1,3-tris(oxidanylidene)-5-phenyl-2-propan-2-yl-1,2-thiazol-4-yl]amino]piperidin-1-yl]pyridin-3-yl]ethanoic acid × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 18% PEG6000
分辨率 1.90 Å R-free 0.245
6S4N LXRbeta ligand binding domain in comlpex with small molecule inhibitors 提交 2019-06-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 216–460（245 aa）
未记录 KUW 2-[5-chloranyl-6-[4-[[1,1,3-tris(oxidanylidene)-5-phenyl-2-propan-2-yl-1,2-thiazol-4-yl]amino]piperidin-1-yl]pyridin-3-yl]ethanoic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 18% PEG6000
分辨率 1.90 Å R-free 0.245
6S4N LXRbeta ligand binding domain in comlpex with small molecule inhibitors 提交 2019-06-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 216–460（245 aa）
未记录 KUW 2-[5-chloranyl-6-[4-[[1,1,3-tris(oxidanylidene)-5-phenyl-2-propan-2-yl-1,2-thiazol-4-yl]amino]piperidin-1-yl]pyridin-3-yl]ethanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 18% PEG6000
分辨率 1.90 Å R-free 0.245
6S4N LXRbeta ligand binding domain in comlpex with small molecule inhibitors 提交 2019-06-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 216–460（245 aa）
未记录 KUW 2-[5-chloranyl-6-[4-[[1,1,3-tris(oxidanylidene)-5-phenyl-2-propan-2-yl-1,2-thiazol-4-yl]amino]piperidin-1-yl]pyridin-3-yl]ethanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 18% PEG6000
分辨率 1.90 Å R-free 0.245
6S4U LXRbeta ligand binding domain in comlpex with small molecule inhibitors 提交 2019-06-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 216–460（245 aa）
未记录 KVK 6-[4-[[3-oxidanyl-1,1-bis(oxidanylidene)-5-phenyl-2-propan-2-yl-3~{H}-1,2-thiazol-4-yl]amino]butyl]pyridine-2-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；Unknown.
分辨率 2.81 Å R-free 0.280
6S4U LXRbeta ligand binding domain in comlpex with small molecule inhibitors 提交 2019-06-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 216–460（245 aa）
未记录 KVK 6-[4-[[3-oxidanyl-1,1-bis(oxidanylidene)-5-phenyl-2-propan-2-yl-3~{H}-1,2-thiazol-4-yl]amino]butyl]pyridine-2-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；Unknown.
分辨率 2.81 Å R-free 0.280
6S4U LXRbeta ligand binding domain in comlpex with small molecule inhibitors 提交 2019-06-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 216–460（245 aa）
未记录 KVK 6-[4-[[3-oxidanyl-1,1-bis(oxidanylidene)-5-phenyl-2-propan-2-yl-3~{H}-1,2-thiazol-4-yl]amino]butyl]pyridine-2-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；Unknown.
分辨率 2.81 Å R-free 0.280
6S5K LXRbeta ligand binding domain in complex with small molecule inhibitors 提交 2019-07-01 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 216–460（245 aa）
未记录 KWE 3-(4-phenylbutylamino)-1,4-bis(phenylmethyl)pyrrole-2,5-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；100 mM PIPES pH 7 and 17% PEG4000
分辨率 1.60 Å R-free 0.214

共 23 个其他 PDB 条目、48 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NR1H2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–245； UniProt 216–460

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6s4t

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6s4t
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6s4t
沉积日期 deposition_date2019-06-28
结构标题 titleLXRbeta ligand binding domain in comlpex with small molecule inhibitors
关键词 keywordsliver X receptor beta LXRb LXR beta Nuclear hormone receptor receptor ligand binding domain, nuclear protein; NUCLEAR PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier19.88 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron18.46 Å
零角强度 I(0) i013490200.00
分子量 molecular_weight28454.0 kDa
排除体积 excluded_volume36035 ų
包络体积 envelope_volume41846 ų
水化壳体积 shell_volume18977 ų
包络直径 envelope_diameter68.0 Å
壳层 Rg shell_rg24.80 Å
包络 Rg envelope_rg18.92 Å
形状 Rg shape_rg18.44 Å
总 Rg total_rg19.51 Å
总原子数 total_atoms2010
残基数 n_residues238
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax65.7 Å
Rg (实空间) rg_real19.82 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.48 Å
I(0) (实空间) i0_real1.3490e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.7480e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal19.82 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal13490000.0000
解质量估计 total_estimate0.6459
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary25.0 Å
偏度 Skewness skewness0.315
峰度 Kurtosis kurtosis-0.161
角度范围 angular_range— – 0.4000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha2966000.0000
实空间数据点数 n_real_points72
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.795; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.338; Positv: 1.000; Valcen: 0.995; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd6s4ta_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.123 — Nuclear receptor ligand-binding domain
超家族 Superfamily superfamilya.123.1 — Nuclear receptor ligand-binding domain
家族 Family familya.123.1.1 — Nuclear receptor ligand-binding domain

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id6s4tA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology565 — Retinoid X Receptor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Retinoid X Receptor
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)