SAXSdb — 6suq

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TcdB2,TccC3,Genome polyprotein

Tobacco etch virus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	单体	蛋白 1	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	POLG_TEV
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2162–2397； UniProt 2038–2273

TcdB2,TccC3,Genome polyprotein

Tobacco etch virus

UniProt Q8GF97

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	单体	蛋白 1	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8GF97_PHOLU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1480–2159； UniProt 1–680

TcdB2,TccC3,Genome polyprotein

Tobacco etch virus

UniProt Q8GF99

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	单体	蛋白 1	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8GF99_PHOLU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1474； UniProt 1–1474

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6suq
沉积日期 deposition_date	2019-09-16
结构标题 title	Crystal Structure of TcdB2-TccC3-TEV
关键词 keywords	Toxins, Tc Toxins, TOXIN; TOXIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6suq__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6suq__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6suq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	44.35 Å
Rg（电子密度）	43.89 Å
总 Rg	44.19 Å
原子数	17025
残基数	2134
排除体积	298400 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6suq__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	TcdB2,TccC3,Genome polyprotein
分子量 formula_weight	272965.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.-.-,3.4.22.45,3.6.4.-,3.4.22.44,2.7.7.48
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	17025

MQNSQDFSITELSLPKGGGAITGMGEALTPTGPDGMAALSLPLPISAGRGYAPAFTLNYNSGAGNSPFGLGWDCNVMTIRRRTHFGVPHYDETDTFLGPEGEVLVVADQPRDESTLQGINLGATFTVTGYRSRLESHFSRLEYWQPKTTGKTDFWLIYSPDGQVHLLGKSPQARISNPSQTTQTAQWLLEASVSSRGEQIYYQYRAEDDTGCEADEITHHLQATAQRYLHIVYYGNRTASETLPGLDGSAPSQADWLFYLVFDYGERSNNLKTPPAFSTTGSWLCRQDRFSRYEYGFEIRTRRLCRQVLMYHHLQALDSKITEHNGPTLVSRLILNYDESAIASTLVFVRRVGHEQDGNVVTLPPLELAYQDFSPRHHAHWQPMDVLANFNAIQRWQLVDLKGEGLPGLLYQDKGAWWYRSAQRLGEIGSDAVTWEKMQPLSVIPSLQSNASLVDINGDGQLDWVITGPGLRGYHSQRPDGSWTRFTPLNALPVEYTHPRAQLADLMGAGLSDLVLIGPKSVRLYANTRDGFAKGKDVVQSGDITLPVPGADPRKLVAFSDVLGSGQAHLVEVSATKVTCWPNLGRGRFGQPITLPGFSQPATEFNPAQVYLADLDGSGPTDLIYVHTNRLDIFLNKSGNGFAEPVTLRFPEGLRFDHTCQLQMADVQGLGVASLILSVPHMSPHHWRCDLTNMKPWLLNEMNNNMGVHHTLRYRSSSQFWLDEKAAALTTGQTPVCYLPFPIHTLWQTETEDEISGNKLVTTLRYARGAWDGREREFRGFGYVEQTDSHQLAQGNAPERTPPALTKNWYATGLPVIDNALSTEYWRDDQAFAGFSPRFTTWQDNKDVPLTPEDDNSRYWFNRALKGQLLRSELYGLDDSTNKHVPYTVTEFRSQVRRLQHTDSRYPVLWSSVVESRNYHYERIASDPQCSQNITLSSDRFGQPLKQLSVQYPRRQQPAINLYPDTLPDKLLANSYDDQQRQLRLTYQQSSWHHLTNNTVRVLGLPDSTRSDIFTYGAENVPAGGLNLELLSDKNSLIADDKPREYLGQQKTAYTDGQNTTPLQTPTRQALIAFTETTVFNQSTLSAFNGSIPSDKLSTTLEQAGYQQTNYLFPRTGEDKVWVAHHGYTDYGTAAQFWRPQKQSNTQLTGKITLIWDANYCVVVQTRDAAGLTTSAKYDWRFLTPVQLTDINDNQHLITLDALGRPITLRFWGTENGKMTGYSSPEKASFSPPSDVNAAIELKKPLPVAQCQVYAPESWMPVLSQKTFNRLAEQDWQKLYNARIITEDGRICTLAYRRWVQSQKAIPQLISLLNNGPRLPPHSLTLTTDRYDHDPEQQIRQQVVFSDGFGRLLQAAARHEAGMARQRNEDGSLIINVQHTENRWAVTGRTEYDNKGQPIRTYQPYFLNDWRYVSNDSARQEKEAYADTHVYDPIGREIKVITAKGWFRRTLFTPWFTVNEDENDTAAEVKKVKMPGSRPMKNIDPKLYQKTPTVSVYDNRGLIIRNIDFHRTTANGDPDTRITRHQYDIHGHLNQSIDPRLYEAKQTNNTIKPNFLWQYDLTGNPLCTESIDAGRTVTLNDIEGRPLLTVTATGVIQTRQYETSSLPGRLLSVAEQTPEEKTSRITERLIWAGNTEAEKDHNLAGQCVRHYDTAGVTRLESLSLTGTVLSQSSQLLIDTQEANWTGDNETVWQNMLADDIYTTLSTFDATGALLTQTDAKGNIQRLAYDVAGQLNGSWLTLKGQTEQVIIKSLTYSAAGQKLREEHGNDVITEYSYEPETQRLIGIKTRRPSDTKVLQDLRYEYDPVGNVISIRNDAEATRFWHNQKVMPENTYTYDSLYQLISATGREMANIGQQSHQFPSPALPSDNNTYTNYTRTYTYDRGGNLTKIQHSSPATQNNYTTNITVSNRSNRAVLSTLTEDPAQVDALFDAGGHQNTLISGQNLNWNTRGELQQVTLVKRDKGANDDREWYRYSGDGRRMLKINEQQASNNAQTQRVTYLPNLELRLTQNSTATTEDLQVITVGEAGRAQVRVLHWESGKPEDIDNNQLRYSYDNLIGSSQLELDSEGQIISEEEYYPYGGTALWAARNQTEASYKTIRYSGKERDATGLYYYGYRYYQPWIGRWLSSDPAGTIDGLNLYRMVRNNPVTLLDPDGLMPEFGESLFKGPRDYNPISSTICHLTNESDGHTTSLYGIGFGPFIITNKHLFRRNNGTLLVQSLHGVFKVKNTTTLQQHLIDGRDMIIIRMPKDFPPFPQKLKFREPQREERICLVTTNFQTKSMSSMVSDTSCTFPSSDGIFWKHWIQTKDGQCGSPLVSTRDGFIVGIHSASNFTNTNNYFTSVPKNFMELLTNQEAQQWVSGWRLNADSVLWGGHKVFMVKPEEPFQPVKEATQLMNRRRRRLEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Tobacco etch virus
通用名 common_name	TEV
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	12227
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	6suqA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	180 — Shell
拓扑 Topology topology	10 — RHS repeat-associated core
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RHS repeat-associated core

▶

晶胞边长 a length_a	234.430 Å
晶胞边长 b length_b	234.430 Å
晶胞边长 c length_c	143.190 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 32 2 1
空间群编号 int_tables_number	154
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.700 Å
最低分辨率 resolution_low	47.730 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2690
R_free r_free	0.3020

Crystal Structure of TcdB2-TccC3-TEV

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TcdB2,TccC3,Genome polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

TcdB2,TccC3,Genome polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

TcdB2,TccC3,Genome polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6suq__assembly_1__model_1

6suq__assembly_1__model_1 | I(q)

6suq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal Structure of TcdB2-TccC3-TEV

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TcdB2,TccC3,Genome polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

TcdB2,TccC3,Genome polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

TcdB2,TccC3,Genome polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6suq__assembly_1__model_1

6suq__assembly_1__model_1 | I(q)

6suq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)