6t3i

Solution structure of the HRP2 IBD

Method: SOLUTION NMR

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hepatoma-derived growth factor-related protein 2

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HDGR2_HUMAN
Isoform	Q7Z4V5-4
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–84； UniProt 469–549

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6t3i
沉积日期 deposition_date	2019-10-11
结构标题 title	Solution structure of the HRP2 IBD
关键词 keywords	epigenetic reader, CELL CYCLE; CELL CYCLE
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6t3i__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6t3i__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6t3i__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	13.97 Å
Rg（电子密度）	12.52 Å
总 Rg	13.90 Å
原子数	1401
残基数	86
排除体积	12216 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6t3i__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	2	`6t3i__assembly_1__model_2`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	3	`6t3i__assembly_1__model_3`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	4	`6t3i__assembly_1__model_4`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	5	`6t3i__assembly_1__model_5`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	6	`6t3i__assembly_1__model_6`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	7	`6t3i__assembly_1__model_7`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	8	`6t3i__assembly_1__model_8`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	9	`6t3i__assembly_1__model_9`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	10	`6t3i__assembly_1__model_10`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	11	`6t3i__assembly_1__model_11`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	12	`6t3i__assembly_1__model_12`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	13	`6t3i__assembly_1__model_13`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	14	`6t3i__assembly_1__model_14`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	15	`6t3i__assembly_1__model_15`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	16	`6t3i__assembly_1__model_16`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	17	`6t3i__assembly_1__model_17`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	18	`6t3i__assembly_1__model_18`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	19	`6t3i__assembly_1__model_19`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	20	`6t3i__assembly_1__model_20`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	21	`6t3i__assembly_1__model_21`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	22	`6t3i__assembly_1__model_22`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	23	`6t3i__assembly_1__model_23`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	24	`6t3i__assembly_1__model_24`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	25	`6t3i__assembly_1__model_25`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	26	`6t3i__assembly_1__model_26`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	27	`6t3i__assembly_1__model_27`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	28	`6t3i__assembly_1__model_28`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	29	`6t3i__assembly_1__model_29`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	30	`6t3i__assembly_1__model_30`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d6t3ia1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.48 — N-cbl like
超家族 Superfamily superfamily	a.48.4 — HIV integrase-binding domain
家族 Family family	a.48.4.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6t3ia2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d6t3ia3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

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描述 description	Hepatoma-derived growth factor-related protein 2
分子量 formula_weight	9675.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	42030

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

Solution structure of the HRP2 IBD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hepatoma-derived growth factor-related protein 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6t3i__assembly_1__model_1

6t3i__assembly_1__model_1 | I(q)

6t3i__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

7. 引用文献 (1)

Solution structure of the HRP2 IBD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hepatoma-derived growth factor-related protein 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6t3i__assembly_1__model_1

6t3i__assembly_1__model_1 | I(q)

6t3i__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

7. 引用文献 (1)