SAXSdb — 6tbl

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MMS19 nucleotide excision repair protein homolog

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MIP18 family protein galla-2 × 1 （Q9VTC4） Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein Ciao1 × 1 （Q7K1Y4） POTASSIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 2 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MIP18 family protein galla-2 × 1 （Q9VTC4） Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein Ciao1 × 1 （Q7K1Y4） POTASSIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MMS19_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 5–125； UniProt 911–1031 作者链 B； PDB构建体 5–125； UniProt 911–1031

MIP18 family protein galla-2

Drosophila melanogaster

UniProt Q9VTC4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MMS19 nucleotide excision repair protein homolog × 1 （Q9D071） Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein Ciao1 × 1 （Q7K1Y4） POTASSIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 2 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MMS19 nucleotide excision repair protein homolog × 1 （Q9D071） Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein Ciao1 × 1 （Q7K1Y4） POTASSIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GALL2_DROME
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 5–159； UniProt 2–156 作者链 D； PDB构建体 5–159； UniProt 2–156

Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein Ciao1

Drosophila melanogaster

UniProt Q7K1Y4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MMS19 nucleotide excision repair protein homolog × 1 （Q9D071） MIP18 family protein galla-2 × 1 （Q9VTC4） POTASSIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 2 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MMS19 nucleotide excision repair protein homolog × 1 （Q9D071） MIP18 family protein galla-2 × 1 （Q9VTC4） POTASSIUM ION × 1 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CIAO1_DROME
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 5–338； UniProt 2–335 作者链 F； PDB构建体 5–338； UniProt 2–335

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6tbl
沉积日期 deposition_date	2019-11-01
结构标题 title	Crystal structure of MMS19(CTD)-CIAO1-CIAO2B CIA targeting complex
关键词 keywords	Fe-S cluster, Fe-S, CIA, CIA targeting complex, BIOSYNTHETIC PROTEIN; BIOSYNTHETIC PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6tbl__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6tbl__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6tbl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	26.77 Å
Rg（电子密度）	26.15 Å
总 Rg	27.04 Å
原子数	4708
残基数	603
排除体积	83577 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6tbl__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6tbl__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	MMS19 nucleotide excision repair protein homolog
分子量 formula_weight	13570.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	9476

GGGRELPTLLSLLLEALSCPDSVVQLSTLSCLQPLLLEAPQIMSLHVDTLVTKFLNLSSSYSMAVRIAALQCMHALTRLPTSVLLPYKSQVIRALAKPLDDKKRLVRKEAVSARGEWFLLGSPGS

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	MIP18 family protein galla-2
分子量 formula_weight	17806.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

GGGRPTEIENINPNVYDRIKERVLTANEEDENVPDPFDKREIFDLIRNINDPEHPLTLEELHVVQEDLIRINDSQNSVHISFTPTIPHCSMATLIGLSIRVKLLRSLPPRFKVTVEITPGTHASELAVNKQLADKERVAAALENNHLAEVINQCIAAKG

来源 Source

来源生物 organism	Drosophila melanogaster
通用名 common_name	Fruit fly
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7227
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein Ciao1
分子量 formula_weight	37283.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

GGGRGRLILEHTLQGHKGRIWGVAWHPKGNVFASCGEDKAIRIWSLTGNTWSTKTILSDGHKRTIREIRWSPCGQYLASASFDATTAIWSKSSGEFECNATLEGHENEVKSVSWSRSGGLLATCSRDKSVWIWEVAGDDEFECAAVLNPHTQDVKRVVWHPTKDILASASYDNTIKMFAEEPIDNDWDCTATLTSHTSTVWGIDFDADGERLVSCSDDTTIKIWRAYHPGNTAGVATPDQQTVWKCVCTVSGQHSRAIYDVSWCKLTGLIATACGDDGIRIFKESSDSKPDEPTFEQITAEEGAHDQDVNSVQWNPVVAGQLISCSDDGTIKIWKVTE

来源 Source

来源生物 organism	Drosophila melanogaster
通用名 common_name	Fruit fly
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7227
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	10

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d6tble_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.69.4 — WD40 repeat-like
家族 Family family	b.69.4.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6tblf1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.69.4 — WD40 repeat-like
家族 Family family	b.69.4.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6tblf2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	6tblA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich Repeat Variant
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Leucine-rich Repeat Variant

结构域编号 domain_id	6tblB01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich Repeat Variant
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Leucine-rich Repeat Variant

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晶胞边长 a length_a	144.070 Å
晶胞边长 b length_b	144.070 Å
晶胞边长 c length_c	166.430 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 4 21 2
空间群编号 int_tables_number	90
晶系 crystal_system	tetragonal

分辨率 resolution	2.650 Å
最低分辨率 resolution_low	19.990 Å
R 因子 r_factor	0.1999
R_work r_work	0.1977
R_free r_free	0.2422

Crystal structure of MMS19(CTD)-CIAO1-CIAO2B CIA targeting complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MMS19 nucleotide excision repair protein homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

MIP18 family protein galla-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein Ciao1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6tbl__assembly_1__model_1

6tbl__assembly_1__model_1 | I(q)

6tbl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of MMS19(CTD)-CIAO1-CIAO2B CIA targeting complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MMS19 nucleotide excision repair protein homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

MIP18 family protein galla-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein Ciao1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6tbl__assembly_1__model_1

6tbl__assembly_1__model_1 | I(q)

6tbl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)