6tqs

The crystal structure of the MSP domain of human MOSPD2 in complex with the conventional FFAT motif of ORP1.

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Motile sperm domain-containing protein 2

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Oxysterol-binding protein-related protein 1 × 1 （Q9BXW6） GLYCEROL × 3 trifluoroacetic acid × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Oxysterol-binding protein-related protein 1 × 1 （Q9BXW6） GLYCEROL × 1 trifluoroacetic acid × 1 water × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Oxysterol-binding protein-related protein 1 × 1 （Q9BXW6） GLYCEROL × 1 trifluoroacetic acid × 1 SULFATE ION × 1 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Oxysterol-binding protein-related protein 1 × 1 （Q9BXW6） trifluoroacetic acid × 1 water × 1	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Oxysterol-binding protein-related protein 1 × 1 （Q9BXW6） trifluoroacetic acid × 1 SULFATE ION × 2 water × 2	与蛋白数一致
6	蛋白单体	单体	蛋白 1	trifluoroacetic acid × 1 SULFATE ION × 1 PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MSPD2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–210； UniProt 282–490 作者链 B； PDB构建体 2–210； UniProt 282–490 作者链 C； PDB构建体 2–210； UniProt 282–490 作者链 D； PDB构建体 2–210； UniProt 282–490 作者链 E； PDB构建体 2–210； UniProt 282–490 作者链 F； PDB构建体 2–210； UniProt 282–490

Oxysterol-binding protein-related protein 1

物种未注明

UniProt Q9BXW6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Motile sperm domain-containing protein 2 × 1 （Q8NHP6） GLYCEROL × 3 trifluoroacetic acid × 1 SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Motile sperm domain-containing protein 2 × 1 （Q8NHP6） GLYCEROL × 1 trifluoroacetic acid × 1 water × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Motile sperm domain-containing protein 2 × 1 （Q8NHP6） GLYCEROL × 1 trifluoroacetic acid × 1 SULFATE ION × 1 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Motile sperm domain-containing protein 2 × 1 （Q8NHP6） trifluoroacetic acid × 1 water × 1	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Motile sperm domain-containing protein 2 × 1 （Q8NHP6） trifluoroacetic acid × 1 SULFATE ION × 2 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	OSBL1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 5–21； UniProt 469–485 作者链 H； PDB构建体 5–21； UniProt 469–485 作者链 I； PDB构建体 5–21； UniProt 469–485 作者链 J； PDB构建体 5–21； UniProt 469–485 作者链 K； PDB构建体 5–21； UniProt 469–485

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6tqs
沉积日期 deposition_date	2019-12-17
结构标题 title	The crystal structure of the MSP domain of human MOSPD2 in complex with the conventional FFAT motif of ORP1.
关键词 keywords	Membrane contact sites, FFAT motif, MSP domain, Endoplasmic reticulum, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6tqs__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6tqs__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6tqs__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	16.70 Å
Rg（电子密度）	15.36 Å
总 Rg	16.58 Å
原子数	1105
残基数	139
排除体积	19727 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6tqs__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6tqs__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`6tqs__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`6tqs__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`6tqs__assembly_5__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`6tqs__assembly_6__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Motile sperm domain-containing protein 2
分子量 formula_weight	24268.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	6821

MISNEEQTPLLKKINPTESTSKAEENEKVDSKVKAFKKPLSVFKGPLLHISPAEELYFGSTESGEKKTLIVLTNVTKNIVAFKVRTTAPEKYRVKPSNSSCDPGASVDIVVSPHGGLTVSAQDRFLIMAAEMEQSSGTGPAELTQFWKEVPRNKVMEHRLRCHTVESSKPNTLTLKDNAFNMSDKTSEDICLQLSRLLESNRKLEDQVQRHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Oxysterol-binding protein-related protein 1
分子量 formula_weight	2323.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H,I,J,K

GAMRSILSEDEFYDALSDSES

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	trifluoroacetic acid
分子量 formula_weight	114.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	DI(HYDROXYETHYL)ETHER
分子量 formula_weight	106.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	PENTAETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	238.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 9 Entity 9 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	270

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晶胞边长 a length_a	126.874 Å
晶胞边长 b length_b	126.874 Å
晶胞边长 c length_c	184.449 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	72

空间群 space_group	P 61 2 2
空间群编号 int_tables_number	178
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.250 Å
最低分辨率 resolution_low	70.640 Å
R 因子 r_factor	0.2190
R_work r_work	0.2169
R_free r_free	0.2600

The crystal structure of the MSP domain of human MOSPD2 in complex with the conventional FFAT motif of ORP1.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Motile sperm domain-containing protein 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Oxysterol-binding protein-related protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6tqs__assembly_1__model_1

6tqs__assembly_1__model_1 | I(q)

6tqs__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 water

7. 引用文献 (1)

The crystal structure of the MSP domain of human MOSPD2 in complex with the conventional FFAT motif of ORP1.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Motile sperm domain-containing protein 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Oxysterol-binding protein-related protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6tqs__assembly_1__model_1

6tqs__assembly_1__model_1 | I(q)

6tqs__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 water

7. 引用文献 (1)