6trc

Cryo- EM structure of the Thermosynechococcus elongatus photosystem I in the presence of cytochrome c6

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （P0A407） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （P0A415） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （P0A420） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （P0A423） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （P0A401） Photosystem I reaction center subunit VIII × 3 （P0A427） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （P0A429） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （P0A425） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （Q8DGB4） Photosystem I reaction center subunit XII × 3 （P0A403） Photosystem I 4.8K protein × 3 （Q8DKP6） CHLOROPHYLL A ISOMER × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 BETA-CAROTENE × 72 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 15 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 CALCIUM ION × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 water × 33	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAA_THEEB
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–755； UniProt 1–755 作者链 A； PDB构建体 1–755； UniProt 1–755 作者链 a； PDB构建体 1–755； UniProt 1–755

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

物种未注明

UniProt P0A407

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （P0A405） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （P0A415） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （P0A420） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （P0A423） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （P0A401） Photosystem I reaction center subunit VIII × 3 （P0A427） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （P0A429） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （P0A425） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （Q8DGB4） Photosystem I reaction center subunit XII × 3 （P0A403） Photosystem I 4.8K protein × 3 （Q8DKP6） CHLOROPHYLL A ISOMER × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 BETA-CAROTENE × 72 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 15 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 CALCIUM ION × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 water × 33	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAB_THEEB
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 2； PDB构建体 1–741； UniProt 1–741 作者链 B； PDB构建体 1–741； UniProt 1–741 作者链 b； PDB构建体 1–741； UniProt 1–741

Photosystem I iron-sulfur center

物种未注明

UniProt P0A415

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （P0A405） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （P0A407） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （P0A420） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （P0A423） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （P0A401） Photosystem I reaction center subunit VIII × 3 （P0A427） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （P0A429） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （P0A425） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （Q8DGB4） Photosystem I reaction center subunit XII × 3 （P0A403） Photosystem I 4.8K protein × 3 （Q8DKP6） CHLOROPHYLL A ISOMER × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 BETA-CAROTENE × 72 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 15 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 CALCIUM ION × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 water × 33	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAC_THEEB
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 3； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81 作者链 C； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81 作者链 c； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81

Photosystem I reaction center subunit II

物种未注明

UniProt P0A420

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （P0A405） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （P0A407） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （P0A415） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （P0A423） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （P0A401） Photosystem I reaction center subunit VIII × 3 （P0A427） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （P0A429） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （P0A425） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （Q8DGB4） Photosystem I reaction center subunit XII × 3 （P0A403） Photosystem I 4.8K protein × 3 （Q8DKP6） CHLOROPHYLL A ISOMER × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 BETA-CAROTENE × 72 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 15 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 CALCIUM ION × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 water × 33	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAD_THEEB
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 4； PDB构建体 1–139； UniProt 1–139 作者链 D； PDB构建体 1–139； UniProt 1–139 作者链 d； PDB构建体 1–139； UniProt 1–139

Photosystem I reaction center subunit IV

物种未注明

UniProt P0A423

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （P0A405） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （P0A407） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （P0A415） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （P0A420） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （P0A401） Photosystem I reaction center subunit VIII × 3 （P0A427） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （P0A429） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （P0A425） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （Q8DGB4） Photosystem I reaction center subunit XII × 3 （P0A403） Photosystem I 4.8K protein × 3 （Q8DKP6） CHLOROPHYLL A ISOMER × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 BETA-CAROTENE × 72 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 15 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 CALCIUM ION × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 water × 33	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAE_THEEB
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 5； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76 作者链 E； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76 作者链 e； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76

Photosystem I reaction center subunit III

物种未注明

UniProt P0A401

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （P0A405） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （P0A407） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （P0A415） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （P0A420） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （P0A423） Photosystem I reaction center subunit VIII × 3 （P0A427） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （P0A429） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （P0A425） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （Q8DGB4） Photosystem I reaction center subunit XII × 3 （P0A403） Photosystem I 4.8K protein × 3 （Q8DKP6） CHLOROPHYLL A ISOMER × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 BETA-CAROTENE × 72 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 15 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 CALCIUM ION × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 water × 33	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAF_THEEB
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 6； PDB构建体 1–141； UniProt 24–164 作者链 F； PDB构建体 1–141； UniProt 24–164 作者链 f； PDB构建体 1–141； UniProt 24–164

Photosystem I reaction center subunit VIII

物种未注明

UniProt P0A427

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （P0A405） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （P0A407） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （P0A415） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （P0A420） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （P0A423） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （P0A401） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （P0A429） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （P0A425） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （Q8DGB4） Photosystem I reaction center subunit XII × 3 （P0A403） Photosystem I 4.8K protein × 3 （Q8DKP6） CHLOROPHYLL A ISOMER × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 BETA-CAROTENE × 72 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 15 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 CALCIUM ION × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 water × 33	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAI_THEEB
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 7； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 I； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 i； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38

Photosystem I reaction center subunit IX

物种未注明

UniProt P0A429

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （P0A405） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （P0A407） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （P0A415） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （P0A420） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （P0A423） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （P0A401） Photosystem I reaction center subunit VIII × 3 （P0A427） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （P0A425） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （Q8DGB4） Photosystem I reaction center subunit XII × 3 （P0A403） Photosystem I 4.8K protein × 3 （Q8DKP6） CHLOROPHYLL A ISOMER × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 BETA-CAROTENE × 72 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 15 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 CALCIUM ION × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 water × 33	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAJ_THEEB
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 8； PDB构建体 1–41； UniProt 1–41 作者链 J； PDB构建体 1–41； UniProt 1–41 作者链 j； PDB构建体 1–41； UniProt 1–41

Photosystem I reaction center subunit PsaK

物种未注明

UniProt P0A425

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （P0A405） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （P0A407） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （P0A415） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （P0A420） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （P0A423） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （P0A401） Photosystem I reaction center subunit VIII × 3 （P0A427） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （P0A429） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （Q8DGB4） Photosystem I reaction center subunit XII × 3 （P0A403） Photosystem I 4.8K protein × 3 （Q8DKP6） CHLOROPHYLL A ISOMER × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 BETA-CAROTENE × 72 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 15 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 CALCIUM ION × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 water × 33	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAK_THEEB
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 9； PDB构建体 1–83； UniProt 1–83 作者链 K； PDB构建体 1–83； UniProt 1–83 作者链 k； PDB构建体 1–83； UniProt 1–83

Photosystem I reaction center subunit XI

物种未注明

UniProt Q8DGB4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （P0A405） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （P0A407） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （P0A415） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （P0A420） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （P0A423） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （P0A401） Photosystem I reaction center subunit VIII × 3 （P0A427） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （P0A429） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （P0A425） Photosystem I reaction center subunit XII × 3 （P0A403） Photosystem I 4.8K protein × 3 （Q8DKP6） CHLOROPHYLL A ISOMER × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 BETA-CAROTENE × 72 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 15 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 CALCIUM ION × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 water × 33	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAL_THEEB
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 0； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155 作者链 L； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155 作者链 l； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155

Photosystem I reaction center subunit XII

物种未注明

UniProt P0A403

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （P0A405） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （P0A407） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （P0A415） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （P0A420） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （P0A423） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （P0A401） Photosystem I reaction center subunit VIII × 3 （P0A427） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （P0A429） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （P0A425） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （Q8DGB4） Photosystem I 4.8K protein × 3 （Q8DKP6） CHLOROPHYLL A ISOMER × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 BETA-CAROTENE × 72 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 15 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 CALCIUM ION × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 water × 33	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAM_THEEB
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–31； UniProt 1–31 作者链 m； PDB构建体 1–31； UniProt 1–31 作者链 y； PDB构建体 1–31； UniProt 1–31

Photosystem I 4.8K protein

物种未注明

UniProt Q8DKP6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 36	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 （P0A405） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 （P0A407） Photosystem I iron-sulfur center × 3 （P0A415） Photosystem I reaction center subunit II × 3 （P0A420） Photosystem I reaction center subunit IV × 3 （P0A423） Photosystem I reaction center subunit III × 3 （P0A401） Photosystem I reaction center subunit VIII × 3 （P0A427） Photosystem I reaction center subunit IX × 3 （P0A429） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 （P0A425） Photosystem I reaction center subunit XI × 3 （Q8DGB4） Photosystem I reaction center subunit XII × 3 （P0A403） CHLOROPHYLL A ISOMER × 3 CHLOROPHYLL A × 288 PHYLLOQUINONE × 6 BETA-CAROTENE × 72 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 15 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 CALCIUM ION × 6 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 water × 33	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q8DKP6_THEEB
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–36； UniProt 4–39 作者链 x； PDB构建体 1–36； UniProt 4–39 作者链 z； PDB构建体 1–36； UniProt 4–39

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6trc
沉积日期 deposition_date	2019-12-18
结构标题 title	Cryo- EM structure of the Thermosynechococcus elongatus photosystem I in the presence of cytochrome c6
关键词 keywords	Photosystem I, P700, Cyanobacteria, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6trc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6trc__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6trc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	69.23 Å
Rg（电子密度）	68.69 Å
总 Rg	68.62 Å
原子数	74940
残基数	6843
排除体积	1409400 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6trc__assembly_1__model_1`	36-meric （36）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (21)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1
分子量 formula_weight	83267.8 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,a,1
原子数 atom_count	75591

MTISPPEREPKVRVVVDNDPVPTSFEKWAKPGHFDRTLARGPQTTTWIWNLHALAHDFDTHTSDLEDISRKIFSAHFGHLAVVFIWLSGMYFHGAKFSNYEAWLADPTGIKPSAQVVWPIVGQGILNGDVGGGFHGIQITSGLFQLWRASGITNEFQLYCTAIGGLVMAGLMLFAGWFHYHKRAPKLEWFQNVESMLNHHLAGLLGLGSLAWAGHQIHVSLPINKLLDAGVAAKDIPLPHEFILNPSLMAELYPKVDWGFFSGVIPFFTFNWAAYSDFLTFNGGLNPVTGGLWLSDTAHHHLAIAVLFIIAGHMYRTNWGIGHSLKEILEAHKGPFTGAGHKGLYEVLTTSWHAQLAINLAMMGSLSIIVAQHMYAMPPYPYLATDYPTQLSLFTHHMWIGGFLVVGGAAHGAIFMVRDYDPAMNQNNVLDRVLRHRDAIISHLNWVCIFLGFHSFGLYVHNDTMRAFGRPQDMFSDTGIQLQPVFAQWVQNLHTLAPGGTAPNAAATASVAFGGDVVAVGGKVAMMPIVLGTADFMVHHIHAFTIHVTVLILLKGVLFARSSRLIPDKANLGFRFPCDGPGRGGTCQVSGWDHVFLGLFWMYNCISVVIFHFSWKMQSDVWGTVAPDGTVSHITGGNFAQSAITINGWLRDFLWAQASQVIGSYGSALSAYGLLFLGAHFIWAFSLMFLFSGRGYWQELIESIVWAHNKLKVAPAIQPRALSIIQGRAVGVAHYLLGGIATTWAFFLARIISVG

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2
分子量 formula_weight	83123.6 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,b,2

MATKFPKFSQDLAQDPTTRRIWYAIAMAHDFESHDGMTEENLYQKIFASHFGHLAIIFLWVSGSLFHVAWQGNFEQWVQDPVNTRPIAHAIWDPQFGKAAVDAFTQAGASNPVDIAYSGVYHWWYTIGMRTNGDLYQGAIFLLILASLALFAGWLHLQPKFRPSLSWFKNAESRLNHHLAGLFGVSSLAWAGHLIHVAIPESRGQHVGWDNFLSTMPHPAGLAPFFTGNWGVYAQNPDTASHVFGTAQGAGTAILTFLGGFHPQTESLWLTDMAHHHLAIAVLFIVAGHMYRTQFGIGHSIKEMMDAKDFFGTKVEGPFNMPHQGIYETYNNSLHFQLGWHLACLGVITSLVAQHMYSLPPYAFIAQDHTTMAALYTHHQYIAGFLMVGAFAHGAIFLVRDYDPAQNKGNVLDRVLQHKEAIISHLSWVSLFLGFHTLGLYVHNDVVVAFGTPEKQILIEPVFAQFIQAAHGKLLYGFDTLLSNPDSIASTAWPNYGNVWLPGWLDAINSGTNSLFLTIGPGDFLVHHAIALGLHTTTLILVKGALDARGSKLMPDKKDFGYAFPCDGPGRGGTCDISAWDAFYLAMFWMLNTIGWVTFYWHWKHLGVWEGNVAQFNESSTYLMGWLRDYLWLNSSQLINGYNPFGTNNLSVWAWMFLFGHLVWATGFMFLISWRGYWQELIETLVWAHERTPLANLVRWKDKPVALSIVQARLVGLAHFSVGYILTYAAFLIASTAAKFG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Photosystem I iron-sulfur center
分子量 formula_weight	8809.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,c,3

MAHTVKIYDTCIGCTQCVRACPTDVLEMVPWDGCKAGQIASSPRTEDCVGCKRCETACPTDFLSIRVYLGAETTRSMGLAY

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit II
分子量 formula_weight	15389.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,d,4

MTTLTGQPPLYGGSTGGLLSAADTEEKYAITWTSPKEQVFEMPTAGAAVMREGENLVYFARKEQCLALAAQQLRPRKINDYKIYRIFPDGETVLIHPKDGVFPEKVNKGREAVNSVPRSIGQNPNPSQLKFTGKKPYDP

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit IV
分子量 formula_weight	8399.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,e,5

MVQRGSKVKILRPESYWYNEVGTVASVDQTPGVKYPVIVRFDKVNYTGYSGSASGVNTNNFALHEVQEVAPPKKGK

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit III
分子量 formula_weight	15129.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,f,6

DVAGLVPCKDSPAFQKRAAAAVNTTADPASGQKRFERYSQALCGEDGLPHLVVDGRLSRAGDFLIPSVLFLYIAGWIGWVGRAYLIAVRNSGEANEKEIIIDVPLAIKCMLTGFAWPLAALKELASGELTAKDNEITVSPR

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit VIII
分子量 formula_weight	4325.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,i,7

MMGSYAASFLPWIFIPVVCWLMPTVVMGLLFLYIEGEA

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit IX
分子量 formula_weight	4798.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,j,8

MKHFLTYLSTAPVLAAIWMTITAGILIEFNRFYPDLLFHPL

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit PsaK
分子量 formula_weight	8484.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,k,9

MVLATLPDTTWTPSVGLVVILCNLFAIALGRYAIQSRGKGPGLPIALPALFEGFGLPELLATTSFGHLLAAGVVSGLQYAGAL

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit XI
分子量 formula_weight	16287.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,l,0

MAEELVKPYNGDPFVGHLSTPISDSGLVKTFIGNLPAYRQGLSPILRGLEVGMAHGYFLIGPWVKLGPLRDSDVANLGGLISGIALILVATACLAAYGLVSFQKGGSSSDPLKTSEGWSQFTAGFFVGAMGSAFVAFFLLENFLVVDGIMTGLFN

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit XII
分子量 formula_weight	3426.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,m,y

MALTDTQVYVALVIALLPAVLAFRLSTELYK

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Photosystem I 4.8K protein
分子量 formula_weight	4104.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X,x,z

MATKSAKPTYAFRTFWAVLLLAINFLVAAYYFGILK

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A ISOMER
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	288

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	PHYLLOQUINONE
分子量 formula_weight	450.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	BETA-CAROTENE
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	72

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	15

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	9

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 21 Entity 21 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	651

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 25 domains

SCOP 2.08 (22 domains)

结构域编号 domain_id	d6trc0_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.31 — Photosystem I reaction center subunit XI, PsaL
超家族 Superfamily superfamily	f.31.1 — Photosystem I reaction center subunit XI, PsaL
家族 Family family	f.31.1.1 — Photosystem I reaction center subunit XI, PsaL

结构域编号 domain_id	d6trc1_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.29 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
超家族 Superfamily superfamily	f.29.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
家族 Family family	f.29.1.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB

结构域编号 domain_id	d6trc2_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.29 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
超家族 Superfamily superfamily	f.29.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
家族 Family family	f.29.1.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB

结构域编号 domain_id	d6trc3_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.1 — 4Fe-4S ferredoxins
家族 Family family	d.58.1.2 — 7-Fe ferredoxin

结构域编号 domain_id	d6trc4_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.187 — Photosystem I subunit PsaD
超家族 Superfamily superfamily	d.187.1 — Photosystem I subunit PsaD
家族 Family family	d.187.1.1 — Photosystem I subunit PsaD

结构域编号 domain_id	d6trc5_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.34.4 — Electron transport accessory proteins
家族 Family family	b.34.4.2 — Photosystem I accessory protein E (PsaE)

结构域编号 domain_id	d6trc6_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.16 — Subunit III of photosystem I reaction centre, PsaF
家族 Family family	f.23.16.1 — Subunit III of photosystem I reaction centre, PsaF

结构域编号 domain_id	d6trc7_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.17 — Subunit VIII of photosystem I reaction centre, PsaI
家族 Family family	f.23.17.1 — Subunit VIII of photosystem I reaction centre, PsaI

结构域编号 domain_id	d6trc8_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.18 — Subunit IX of photosystem I reaction centre, PsaJ
家族 Family family	f.23.18.1 — Subunit IX of photosystem I reaction centre, PsaJ

结构域编号 domain_id	d6trca_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.29 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
超家族 Superfamily superfamily	f.29.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
家族 Family family	f.29.1.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB

结构域编号 domain_id	d6trcb_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.29 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
超家族 Superfamily superfamily	f.29.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
家族 Family family	f.29.1.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB

结构域编号 domain_id	d6trcc_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.1 — 4Fe-4S ferredoxins
家族 Family family	d.58.1.2 — 7-Fe ferredoxin

结构域编号 domain_id	d6trcd_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.187 — Photosystem I subunit PsaD
超家族 Superfamily superfamily	d.187.1 — Photosystem I subunit PsaD
家族 Family family	d.187.1.1 — Photosystem I subunit PsaD

结构域编号 domain_id	d6trce_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.34.4 — Electron transport accessory proteins
家族 Family family	b.34.4.2 — Photosystem I accessory protein E (PsaE)

结构域编号 domain_id	d6trcf_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.16 — Subunit III of photosystem I reaction centre, PsaF
家族 Family family	f.23.16.1 — Subunit III of photosystem I reaction centre, PsaF

结构域编号 domain_id	d6trci_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.17 — Subunit VIII of photosystem I reaction centre, PsaI
家族 Family family	f.23.17.1 — Subunit VIII of photosystem I reaction centre, PsaI

结构域编号 domain_id	d6trcj_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.18 — Subunit IX of photosystem I reaction centre, PsaJ
家族 Family family	f.23.18.1 — Subunit IX of photosystem I reaction centre, PsaJ

结构域编号 domain_id	d6trcl_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.31 — Photosystem I reaction center subunit XI, PsaL
超家族 Superfamily superfamily	f.31.1 — Photosystem I reaction center subunit XI, PsaL
家族 Family family	f.31.1.1 — Photosystem I reaction center subunit XI, PsaL

结构域编号 domain_id	d6trcm_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.19 — Subunit XII of photosystem I reaction centre, PsaM
家族 Family family	f.23.19.1 — Subunit XII of photosystem I reaction centre, PsaM

结构域编号 domain_id	d6trcx_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.20 — Subunit PsaX of photosystem I reaction centre
家族 Family family	f.23.20.1 — Subunit PsaX of photosystem I reaction centre

结构域编号 domain_id	d6trcy_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.19 — Subunit XII of photosystem I reaction centre, PsaM
家族 Family family	f.23.19.1 — Subunit XII of photosystem I reaction centre, PsaM

结构域编号 domain_id	d6trcz_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.20 — Subunit PsaX of photosystem I reaction centre
家族 Family family	f.23.20.1 — Subunit PsaX of photosystem I reaction centre

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	6trc001
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1240 — Photosystem 1 Reaction Centre Subunit Xi; Chain: L;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI

结构域编号 domain_id	6trcL01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1240 — Photosystem 1 Reaction Centre Subunit Xi; Chain: L;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI

结构域编号 domain_id	6trcl01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1240 — Photosystem 1 Reaction Centre Subunit Xi; Chain: L;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	2.98 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	175999

Cryo- EM structure of the Thermosynechococcus elongatus photosystem I in the presence of cytochrome c6

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I iron-sulfur center

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit II

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit IV

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit III

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit VIII

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit IX

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit PsaK

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit XI

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体