Archaeoglobus fulgidus (strain ATCC 49558 / VC-16 / DSM 4304 / JCM 9628 / NBRC 100126)
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 同源多聚体 | 蛋白 2 DNA 4 | 5'-D(*AP*TP*TP*GP*TP*AP*CP*GP*TP*AP*CP*AP*AP*TP)-3' × 4 MAGNESIUM ION × 2 CHLORIDE ION × 2 BETA-MERCAPTOETHANOL × 6 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 GLYCEROL × 8 water × 6 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | PIWI_ARCFU |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 15–441； UniProt 1–427 |
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| 条目编号 entry_id | 6tuo |
| 沉积日期 deposition_date | 2020-01-07 |
| 结构标题 title | Crystal structure of Archaeoglobus fulgidus Argonaute protein with cognate DNA oligoduplex 5'-pATTGTACGTACAAT |
| 关键词 keywords | ARGONAUTE, PIWI DOMAIN, PROTEIN-DNA COMPLEX, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 35.09 Å |
| Rg（电子密度） | 34.98 Å |
| 总 Rg | 35.18 Å |
| 原子数 | 7828 |
| 残基数 | 866 |
| 排除体积 | 137280 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |