SAXSdb — 6u0j

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase

Escherichia coli (strain K12)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Acyl carrier protein × 1 （B1XA04） 1,2-ETHANEDIOL × 7 SULFATE ION × 1 N-[2-(acetylamino)ethyl]-N~3~-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alaninamide × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FABD_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–312； UniProt 1–309

Acyl carrier protein

Escherichia coli (strain K12 / DH10B)

UniProt B1XA04

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase × 1 （P0AAI9） 1,2-ETHANEDIOL × 7 SULFATE ION × 1 N-[2-(acetylamino)ethyl]-N~3~-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alaninamide × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACP_ECODH
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–78； UniProt 1–78

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6u0j
沉积日期 deposition_date	2019-08-14
结构标题 title	Crosslinked Crystal Structure of Malonyl-CoA Acyl Carrier Protein Transacylase, FabD, and Acyl Carrier Protein, AcpP
关键词 keywords	MAT, AT, transferase, acyl transferase, alpha-beta hydrolase fold, AcpP, ACP, CP; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6u0j__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6u0j__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6u0j__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	22.03 Å
Rg（电子密度）	21.00 Å
总 Rg	21.83 Å
原子数	2893
残基数	382
排除体积	51613 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6u0j__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase
分子量 formula_weight	32741.4 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.1.39
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3281

GSHMTQFAFVFPGQGSQTVGMLADMAASYPIVEETFAEASAALGYDLWALTQQGPAEELNKTWQTQPALLTASVALYRVWQQQGGKAPAMMAGHCLGEYSALVCAGVIDFADAVRLVEMRGKFMQEAVPEGTGAMAAIIGLDDASIAKACEEAAEGQVVSPVNFNSPGQVVIAGHKEAVERAGAACKAAGAKRALPLPVSVPSHCALMKPAADKLAVELAKITFNAPTVPVVNNVDVKCETNGDAIRDALVRQLYNPVQWTKSVEYMAAQGVEHLYEVGPGKVLTGLTKRIVDTLTASALNEPSAMAAALEL

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli (strain K12)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Acyl carrier protein
分子量 formula_weight	9561.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MSTIEERVKKIIGEQLGVKQEEVTNNASFVEDLGADSLDTVELVMALEEEFDTEIPDEEAEKITTVQAAIDYINGHQASHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli (strain K12 / DH10B)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	316385
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	N-[2-(acetylamino)ethyl]-N~3~-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alaninamide
分子量 formula_weight	383.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	350

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d6u0jb_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.28 — Acyl carrier protein-like
超家族 Superfamily superfamily	a.28.1 — ACP-like
家族 Family family	a.28.1.0 — automated matches

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晶胞边长 a length_a	73.150 Å
晶胞边长 b length_b	56.846 Å
晶胞边长 c length_c	99.874 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	97.84 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	44.727 Å
R 因子 r_factor	0.1865
R_work r_work	0.1846
R_free r_free	0.2213

Crosslinked Crystal Structure of Malonyl-CoA Acyl Carrier Protein Transacylase, FabD, and Acyl Carrier Protein, AcpP

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Acyl carrier protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6u0j__assembly_1__model_1

6u0j__assembly_1__model_1 | I(q)

6u0j__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

Crosslinked Crystal Structure of Malonyl-CoA Acyl Carrier Protein Transacylase, FabD, and Acyl Carrier Protein, AcpP

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Acyl carrier protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6u0j__assembly_1__model_1

6u0j__assembly_1__model_1 | I(q)

6u0j__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

7. 引用文献 (1)