6u4r

Crystal structure of Equine Serum Albumin complex with ketoprofen

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Serum albumin

物种未注明

UniProt P35747

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 25–607 未记录 9KL (2S)-2-[3-(benzenecarbonyl)phenyl]propanoic acid × 3 KNA nonanoic acid × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 3 UNL UNKNOWN LIGAND × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;298 K;1 ul of 35 mg/ml protein in 10 mM Tris pH 7.5 and 150 mM NaCl buffer was mixed with 1 ul of the well condition (0.2 M Li2SO4, 0.1 M Tris:HCl, 2.0 M (NH4)2SO4 final pH 7.4) and equilibrated against well solution in 15 Well Crystallization Plate (Qiagen). Crystals were soaked with 3mM ketoprofen. 分辨率 2.45 Å R-free 0.233

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ALBU_HORSE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–583; UniProt 25–607

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

暂无 SAXS 图

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

暂无 P(r) 图
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6u4r
沉积日期 deposition_date2019-08-26
结构标题 titleCrystal structure of Equine Serum Albumin complex with ketoprofen
关键词 keywordsAlbumin, Ketoprofen, NSAID, SA, ESA, Center for Structural Genomics of Infectious Diseases, CSGID, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

该条目暂无 SAXS 数据。

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

该条目暂无 P(r) 分析数据。

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd6u4ra1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.126 — Serum albumin-like
超家族 Superfamily superfamilya.126.1 — Serum albumin-like
家族 Family familya.126.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd6u4ra2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.126 — Serum albumin-like
超家族 Superfamily superfamilya.126.1 — Serum albumin-like
家族 Family familya.126.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd6u4ra3
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.126 — Serum albumin-like
超家族 Superfamily superfamilya.126.1 — Serum albumin-like
家族 Family familya.126.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id6u4rA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id6u4rA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id6u4rA03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id6u4rA04
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id6u4rA05
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id6u4rA06
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (0)