6uew

Rubisco / CsoS2 N-peptide complex responsible for alpha-carboxysome cargo loading

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ribulose bisphosphate carboxylase large chain, CsoS2 N-peptide fusion

Halothiobacillus neapolitanus c2

UniProt O85040

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Ribulose bisphosphate carboxylase small chain × 8 (P45686) water × 16 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RBL1_HALNC
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–474; UniProt 2–473 作者链 C; PDB构建体 3–474; UniProt 2–473 作者链 E; PDB构建体 3–474; UniProt 2–473 作者链 G; PDB构建体 3–474; UniProt 2–473

Ribulose bisphosphate carboxylase small chain

Halothiobacillus neapolitanus (strain ATCC 23641 / c2)

UniProt P45686

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 16 Ribulose bisphosphate carboxylase large chain, CsoS2 N-peptide fusion × 8 (O85040) water × 16 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RBS_HALNC
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–110; UniProt 1–110 作者链 D; PDB构建体 1–110; UniProt 1–110 作者链 F; PDB构建体 1–110; UniProt 1–110 作者链 H; PDB构建体 1–110; UniProt 1–110

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6uew
沉积日期 deposition_date2019-09-23
结构标题 titleRubisco / CsoS2 N-peptide complex responsible for alpha-carboxysome cargo loading
关键词 keywordsRubisco, CsoS2, carboxysome, phase separation, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6uew__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6uew__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6uew__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)47.26 Å
Rg(电子密度)46.34 Å
总 Rg46.70 Å
原子数35272
残基数4456
排除体积623550 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6uew__assembly_1__model_1 hexadecameric (16) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd6uewb_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.73 — RuBisCO, small subunit
超家族 Superfamily superfamilyd.73.1 — RuBisCO, small subunit
家族 Family familyd.73.1.1 — RuBisCO, small subunit
结构域编号 domain_idd6uewd_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.73 — RuBisCO, small subunit
超家族 Superfamily superfamilyd.73.1 — RuBisCO, small subunit
家族 Family familyd.73.1.1 — RuBisCO, small subunit
结构域编号 domain_idd6uewf_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.73 — RuBisCO, small subunit
超家族 Superfamily superfamilyd.73.1 — RuBisCO, small subunit
家族 Family familyd.73.1.1 — RuBisCO, small subunit
结构域编号 domain_idd6uewh_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.73 — RuBisCO, small subunit
超家族 Superfamily superfamilyd.73.1 — RuBisCO, small subunit
家族 Family familyd.73.1.1 — RuBisCO, small subunit

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id6uewA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — RuBisCO large subunit, N-terminal domain
结构域编号 domain_id6uewA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily110 — Ribulose bisphosphate carboxylase, large subunit, C-terminal domain
结构域编号 domain_id6uewB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology190 — Ribulose 1,5 Bisphosphate Carboxylase/Oxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribulose bisphosphate carboxylase, small subunit
结构域编号 domain_id6uewC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — RuBisCO large subunit, N-terminal domain
结构域编号 domain_id6uewC02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily110 — Ribulose bisphosphate carboxylase, large subunit, C-terminal domain
结构域编号 domain_id6uewD00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology190 — Ribulose 1,5 Bisphosphate Carboxylase/Oxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribulose bisphosphate carboxylase, small subunit
结构域编号 domain_id6uewE01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — RuBisCO large subunit, N-terminal domain
结构域编号 domain_id6uewE02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily110 — Ribulose bisphosphate carboxylase, large subunit, C-terminal domain
结构域编号 domain_id6uewF00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology190 — Ribulose 1,5 Bisphosphate Carboxylase/Oxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribulose bisphosphate carboxylase, small subunit
结构域编号 domain_id6uewG01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — RuBisCO large subunit, N-terminal domain
结构域编号 domain_id6uewG02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily110 — Ribulose bisphosphate carboxylase, large subunit, C-terminal domain
结构域编号 domain_id6uewH00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology190 — Ribulose 1,5 Bisphosphate Carboxylase/Oxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribulose bisphosphate carboxylase, small subunit
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7. 引用文献 (2)