6upt

Tudor Domain of Tumor suppressor p53BP1 with MFP-2706

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TP53-binding protein 1

Homo sapiens

UniProt A6NNK5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 2-((2-chlorobenzyl)thio)-4,5-dihydro-1H-imidazole × 1 UNKNOWN ATOM OR ION × 3 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 UNKNOWN ATOM OR ION × 2 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A6NNK5_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–124; UniProt 1438–1561 作者链 B; PDB构建体 1–124; UniProt 1438–1561

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6upt
沉积日期 deposition_date2019-10-18
结构标题 titleTudor Domain of Tumor suppressor p53BP1 with MFP-2706
关键词 keywords53BP1, Tudor, MFP-2706, Structural Genomics, Structural Genomics Consortium, SGC, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6upt__assembly_1__model_1 monomeric (1) 排除 — —
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。
2 1 6upt__assembly_2__model_1 monomeric (1) 排除 — —
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd6upta1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.34.9 — Tudor/PWWP/MBT
家族 Family familyb.34.9.1 — Tudor domain
结构域编号 domain_idd6upta2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.34.9 — Tudor/PWWP/MBT
家族 Family familyb.34.9.1 — Tudor domain
结构域编号 domain_idd6uptb1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.34.9 — Tudor/PWWP/MBT
家族 Family familyb.34.9.1 — Tudor domain
结构域编号 domain_idd6uptb2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.34.9 — Tudor/PWWP/MBT
家族 Family familyb.34.9.1 — Tudor domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id6uptA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
结构域编号 domain_id6uptA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 —
结构域编号 domain_id6uptB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
结构域编号 domain_id6uptB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 —
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7. 引用文献 (1)