SAXSdb — 6usp

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Telomerase reverse transcriptase

Tribolium castaneum

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	单体	蛋白 1 DNA 2	;DNA (5'-D(PGPGPTPCPAPGPGPTPCPAPGPGPTPCPAPG)-3') ; × 1 ;DNA/RNA (5'-R(CPUPGPAPCPCPUPGPAPC)-D(PCPT)-R(PGPAPC)-D(PC)-3') ; × 1 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q0QHL8_TRICA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–597； UniProt 1–596

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6usp
沉积日期 deposition_date	2019-10-28
结构标题 title	Telomerase Reverse Transcriptase product complex, TERT:DNA
关键词 keywords	Telomerase, reverse transcriptase, polymerase, NUCLEAR PROTEIN, TRANSFERASE-RNA-DNA complex; NUCLEAR PROTEIN, TRANSFERASE/RNA/DNA
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6usp__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6usp__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6usp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	28.64 Å
Rg（电子密度）	28.08 Å
总 Rg	28.84 Å
原子数	5523
残基数	628
排除体积	97528 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6usp__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Telomerase reverse transcriptase
分子量 formula_weight	70645.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.49
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	5523

GMVHYYRLSLKSRQKAPKIVNSKYNSILNIALKNFRLCKKHKTKKPVQILALLQEIIPKSYFGTTTNLKRFYKVVEKILTQSSFECIHLSVLHKCYDYDAIPWLQNVEPNLRPKLLLKHNLFLLDNIVKPIIAFYYKPIKTLNGHEIKFIRKEEYISFESKVFHKLKKMKYLVEVQDEVKPRGVLNIIPKQDNFRAIVSIFPDSARKPFFKLLTSKIYKVLEEKYKTSGSLYTCWSEFTQKTQGQIYGIKVDIRDAYGNVKIPVLCKLIQSIPTHLLDSEKKNFIVDHISNQFVAFRRKIYKWNHGLLQGDPLSGCLCELYMAFMDRLYFSNLDKDAFIHRTVDDYFFCSPHPHKVYDFELLIKGVYQVNPTKTRTNLPTHRHPQDEIPYCGKIFNLTTRQVRTLYKLPPNYEIRHKFKLWNFNNQISDDNPARFLQKAMDFPFICNSFTKFEFNTVFNDQRTVFANFYDAMICVAYKFDAAMMALRTSFLVNDFGFIWLVLSSTVRAYASRAFKKIVTYKGGKYRKVTFQCLKSIAWRAFLAVLKRRTEIYKGLIDRIKSREKLTMKFHDGEVDASYFCKLPEKFRFVKINRKASI

来源 Source

来源生物 organism	Tribolium castaneum
通用名 common_name	Red flour beetle
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7070
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(PGPGPTPCPAPGPGPTPCPAPGPGPTPCPAPG)-3') ;
分子量 formula_weight	4979.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	E

GGTCAGGTCAGGTCAG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	;DNA/RNA (5'-R(CPUPGPAPCPCPUPGPAPC)-D(PCPT)-R(PGPAPC)-D(PC)-3') ;
分子量 formula_weight	4999.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide/polyribonucleotide hybrid
链编号 strand_id	F

CUGACCUGACCTGACC

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id	6uspA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	132 — Topoisomerase I; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 —

结构域编号 domain_id	6uspA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	10 — HIV Type 1 Reverse Transcriptase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	6uspA03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2210 —

结构域编号 domain_id	6uspA04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2630 —

结构域编号 domain_id	6uspA05
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	357 — Tetracycline Repressor; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Telomerase reverse transcriptase (TERT), thumb domain

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晶胞边长 a length_a	100.378 Å
晶胞边长 b length_b	100.378 Å
晶胞边长 c length_c	167.999 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 32 2 1
空间群编号 int_tables_number	154
晶系 crystal_system	trigonal

分辨率 resolution	3.560 Å
最低分辨率 resolution_low	48.090 Å
R 因子 r_factor	0.2625
R_work r_work	0.2608
R_free r_free	0.3040

Telomerase Reverse Transcriptase product complex, TERT:DNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Telomerase reverse transcriptase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6usp__assembly_1__model_1

6usp__assembly_1__model_1 | I(q)

6usp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

CATH v4.4 (5 domains)

7. 引用文献 (1)

Telomerase Reverse Transcriptase product complex, TERT:DNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Telomerase reverse transcriptase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6usp__assembly_1__model_1

6usp__assembly_1__model_1 | I(q)

6usp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

CATH v4.4 (5 domains)

7. 引用文献 (1)