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6vgc

Crystal Structures of FLAP bound to DG-031

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

5-lipoxygenase-activating protein

Homo sapiens

UniProt P20292

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 (2R)-cyclopentyl{4-[(quinolin-2-yl)methoxy]phenyl}acetic acid × 3 CALCIUM ION × 1 water × 3 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 (2R)-cyclopentyl{4-[(quinolin-2-yl)methoxy]phenyl}acetic acid × 3 CALCIUM ION × 1 octyl beta-D-glucopyranoside × 1 water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
2q7m 2q7m 2q7r 2q7r 6vgc 6vgc 6vgi 6vgi

共 8 个 assembly

异源或核酸复合物

暂无

查看构建体与数据证据
UniProt名称 AL5AP_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 4–163； UniProt 2–161 作者链 B； PDB构建体 4–163； UniProt 2–161 作者链 C； PDB构建体 4–163； UniProt 2–161 作者链 D； PDB构建体 4–163； UniProt 2–161 作者链 E； PDB构建体 4–163； UniProt 2–161 作者链 F； PDB构建体 4–163； UniProt 2–161

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6vgc
沉积日期 deposition_date2020-01-07
结构标题 titleCrystal Structures of FLAP bound to DG-031
关键词 keywords5-Lipoxygenase Activating Protein, FLAP, DG-031, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6vgc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6vgc__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6vgc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）25.77 Å
Rg（电子密度）25.09 Å
总 Rg25.86 Å
原子数3581
残基数444
排除体积65201 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6vgc__assembly_1__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 6vgc__assembly_2__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id6vgcA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily550 — Membrane associated eicosanoid/glutathione metabolism-like domain
结构域编号 domain_id6vgcB01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily550 — Membrane associated eicosanoid/glutathione metabolism-like domain
结构域编号 domain_id6vgcC01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily550 — Membrane associated eicosanoid/glutathione metabolism-like domain
结构域编号 domain_id6vgcD01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily550 — Membrane associated eicosanoid/glutathione metabolism-like domain
结构域编号 domain_id6vgcE01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily550 — Membrane associated eicosanoid/glutathione metabolism-like domain
结构域编号 domain_id6vgcF01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily550 — Membrane associated eicosanoid/glutathione metabolism-like domain
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7. 引用文献 (1)