Bacillus subtilis (strain 168)
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 4 | SODIUM ION × 8 GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 4 water × 4 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | XPT_BACSU |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 5–197； UniProt 2–194 作者链 B； PDB构建体 5–197； UniProt 2–194 作者链 C； PDB构建体 5–197； UniProt 2–194 作者链 D； PDB构建体 5–197； UniProt 2–194 |
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| 条目编号 entry_id | 6w1i |
| 沉积日期 deposition_date | 2020-03-04 |
| 结构标题 title | Re-interpretation of ppGpp (G4P) electron density in the deposited crystal structure of Xanthine phosphoribosyltransferase (XPRT) (1Y0B). |
| 关键词 keywords | ;(p)ppGpp, salvage, GTP, homeostasis, XPRT, PRPP, purine, Structural Genomics, PSI-2, Protein Structure Initiative, Midwest Center for Structural Genomics, MCSG, TRANSFERASE ;; TRANSFERASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 29.81 Å |
| Rg（电子密度） | 29.02 Å |
| 总 Rg | 29.70 Å |
| 原子数 | 11955 |
| 残基数 | 761 |
| 排除体积 | 106610 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d6w1ia1 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.61 — PRTase-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.61.1 — PRTase-like |
| 家族 Family family | c.61.1.1 — Phosphoribosyltransferases (PRTases) |
| 结构域编号 domain_id | d6w1ia2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d6w1ib1 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.61 — PRTase-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.61.1 — PRTase-like |
| 家族 Family family | c.61.1.1 — Phosphoribosyltransferases (PRTases) |
| 结构域编号 domain_id | d6w1ib2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d6w1ic1 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.61 — PRTase-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.61.1 — PRTase-like |
| 家族 Family family | c.61.1.1 — Phosphoribosyltransferases (PRTases) |
| 结构域编号 domain_id | d6w1ic2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d6w1id1 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.61 — PRTase-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.61.1 — PRTase-like |
| 家族 Family family | c.61.1.1 — Phosphoribosyltransferases (PRTases) |
| 结构域编号 domain_id | d6w1id2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |