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6wji

2.05 Angstrom Resolution Crystal Structure of C-terminal Dimerization Domain of Nucleocapsid Phosphoprotein from SARS-CoV-2

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Nucleoprotein

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2

UniProt P0DTC9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 CHLORIDE ION × 2 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 CHLORIDE ION × 3 water × 2 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 CHLORIDE ION × 4 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
6m3m 6m3m 6m3m 6m3m 6yi3 7cdz 7cdz 7cdz 7cdz 7sd4 7uw3 7uw3

共 81 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源二聚体
26ui 6wji 6wji 6wji 6wzo 6wzo 6wzq 6wzq 6yun 6zco 7c22 7c22

共 58 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源四聚体
6vyo 6wkp 7xx1 8iv3 8j6x

共 5 个 assembly

其他同源多聚体
7lux 7luz 7lv2

共 3 个 assembly

异源或核酸复合物
7acs 7act 7cr5 7kgo 7kgp 7kgq 7kgr 7kgs 7kgt 7lgd 7lgd 7n0i

共 75 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NCAP_SARS2
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 14–121； UniProt 257–364 作者链 B； PDB构建体 14–121； UniProt 257–364 作者链 C； PDB构建体 14–121； UniProt 257–364 作者链 D； PDB构建体 14–121； UniProt 257–364 作者链 E； PDB构建体 14–121； UniProt 257–364 作者链 F； PDB构建体 14–121； UniProt 257–364

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6wji
沉积日期 deposition_date2020-04-13
结构标题 title2.05 Angstrom Resolution Crystal Structure of C-terminal Dimerization Domain of Nucleocapsid Phosphoprotein from SARS-CoV-2
关键词 keywords;Structural Genomics, Center for Structural Genomics of Infectious Diseases, CSGID, nucleocapsid phosphoprotein, SARS-CoV-2, VIRAL PROTEIN ;; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6wji__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6wji__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6wji__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）18.55 Å
Rg（电子密度）17.62 Å
总 Rg18.61 Å
原子数1734
残基数216
排除体积30655 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6wji__assembly_1__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 6wji__assembly_2__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 6wji__assembly_3__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd6wjia_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.254 — Nucleocapsid protein dimerization domain
超家族 Superfamily superfamilyd.254.1 — Nucleocapsid protein dimerization domain
家族 Family familyd.254.1.2 — Coronavirus nucleocapsid protein
结构域编号 domain_idd6wjib_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.254 — Nucleocapsid protein dimerization domain
超家族 Superfamily superfamilyd.254.1 — Nucleocapsid protein dimerization domain
家族 Family familyd.254.1.2 — Coronavirus nucleocapsid protein
结构域编号 domain_idd6wjic_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.254 — Nucleocapsid protein dimerization domain
超家族 Superfamily superfamilyd.254.1 — Nucleocapsid protein dimerization domain
家族 Family familyd.254.1.2 — Coronavirus nucleocapsid protein
结构域编号 domain_idd6wjid_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.254 — Nucleocapsid protein dimerization domain
超家族 Superfamily superfamilyd.254.1 — Nucleocapsid protein dimerization domain
家族 Family familyd.254.1.2 — Coronavirus nucleocapsid protein
结构域编号 domain_idd6wjie_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.254 — Nucleocapsid protein dimerization domain
超家族 Superfamily superfamilyd.254.1 — Nucleocapsid protein dimerization domain
家族 Family familyd.254.1.2 — Coronavirus nucleocapsid protein
结构域编号 domain_idd6wjif_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.254 — Nucleocapsid protein dimerization domain
超家族 Superfamily superfamilyd.254.1 — Nucleocapsid protein dimerization domain
家族 Family familyd.254.1.2 — Coronavirus nucleocapsid protein
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7. 引用文献 (1)