Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | (1r,2R,3S,4s,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentakis(phosphonooxy)cyclohexyl trihydrogen diphosphate × 1 MAGNESIUM ION × 3 CHLORIDE ION × 2 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | NUDT3_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 22–169； UniProt 1–148 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 6woc |
| 沉积日期 deposition_date | 2020-04-24 |
| 结构标题 title | Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1 (DIPP1/NUDT3) in complex with 5-diphosphoinositol pentakisphosphate and Mg, presoaked with 5-IP7, Mg and Fluoride, soaking 1min in the absence of Fluoride. |
| 关键词 keywords | phosphatase, nudix, catalysis mechanism, Substrate Specificity, inositol, inositol pyrophosphate, HYDROLASE; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 15.11 Å |
| Rg（电子密度） | 14.03 Å |
| 总 Rg | 15.09 Å |
| 原子数 | 1131 |
| 残基数 | 134 |
| 排除体积 | 19757 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d6woca_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.113 — Nudix |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.113.1 — Nudix |
| 家族 Family family | d.113.1.1 — MutT-like |