Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | (1S,2R,3R,4S,5S,6R)-2,3,4,5,6-pentakis(phosphonooxy)cyclohexyl trihydrogen diphosphate × 1 MAGNESIUM ION × 3 CHLORIDE ION × 2 FLUORIDE ION × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | NUDT3_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 22–169； UniProt 1–148 |
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| 条目编号 entry_id | 6woi |
| 沉积日期 deposition_date | 2020-04-24 |
| 结构标题 title | Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1 (DIPP1/NUDT3) in complex with 1-Diphosphoinositol pentakisphosphate, Mg, and Fluoride ion, presoaked with 1,5-IP8, Mg and Fluoride for 30 seconds |
| 关键词 keywords | phosphatase, nudix, catalysis mechanism, Substrate Specificity, inositol, inositol pyrophosphate, HYDROLASE; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 15.06 Å |
| Rg（电子密度） | 14.01 Å |
| 总 Rg | 15.05 Å |
| 原子数 | 1132 |
| 残基数 | 134 |
| 排除体积 | 19770 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d6woia_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.113 — Nudix |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.113.1 — Nudix |
| 家族 Family family | d.113.1.1 — MutT-like |