6xny

Structure of RAG1 (R848M/E649V)-RAG2-DNA Strand Transfer Complex (Paired-Form)

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

V(D)J recombination-activating protein 1

Mus musculus

UniProt P15919

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 4 DNA 6 V(D)J recombination-activating protein 2 × 2 (P21784) 12RSS integration strand (55-mer) × 1 23RSS integration strand (66-mer) × 1 Flanking DNA top strand (16-mer) × 2 23RSS signal DNA top strand (45-mer) × 1 12RSS signal DNA top strand (34-mer) × 1 MAGNESIUM ION × 4 ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RAG1_MOUSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–750; UniProt 261–1008 作者链 C; PDB构建体 3–750; UniProt 261–1008

V(D)J recombination-activating protein 2

Mus musculus

UniProt P21784

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 4 DNA 6 V(D)J recombination-activating protein 1 × 2 (P15919) 12RSS integration strand (55-mer) × 1 23RSS integration strand (66-mer) × 1 Flanking DNA top strand (16-mer) × 2 23RSS signal DNA top strand (45-mer) × 1 12RSS signal DNA top strand (34-mer) × 1 MAGNESIUM ION × 4 ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RAG2_MOUSE
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 5–363; UniProt 3–361 作者链 D; PDB构建体 5–363; UniProt 3–361

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6xny
沉积日期 deposition_date2020-07-05
结构标题 titleStructure of RAG1 (R848M/E649V)-RAG2-DNA Strand Transfer Complex (Paired-Form)
关键词 keywordsDNA Transposase, RECOMBINATION; RECOMBINATION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6xny__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6xny__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6xny__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)37.92 Å
Rg(电子密度)37.84 Å
总 Rg38.13 Å
原子数16681
残基数1909
排除体积288990 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6xny__assembly_1__model_1 decameric (10) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

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7. 引用文献 (1)