SAXSdb — 6xrf

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Effector EagT6

Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	PAAR motif family protein × 1 （A0A2R3IMB8） water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	PAAR motif family protein × 1 （A0A2R3IMB8） water × 3	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	PAAR motif family protein × 1 （A0A2R3IMB8） water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EAGT6_PSEAE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–144； UniProt 1–144 作者链 B； PDB构建体 1–144； UniProt 1–144 作者链 D； PDB构建体 1–144； UniProt 1–144 作者链 E； PDB构建体 1–144； UniProt 1–144 作者链 G； PDB构建体 1–144； UniProt 1–144 作者链 H； PDB构建体 1–144； UniProt 1–144

PAAR motif family protein

Pseudomonas aeruginosa

UniProt A0A2R3IMB8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Effector EagT6 × 2 （Q9I738） water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Effector EagT6 × 2 （Q9I738） water × 3	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Effector EagT6 × 2 （Q9I738） water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2R3IMB8_PSEAI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–60； UniProt 1–60 作者链 F； PDB构建体 1–60； UniProt 1–60 作者链 I； PDB构建体 1–60； UniProt 1–60

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6xrf
沉积日期 deposition_date	2020-07-12
结构标题 title	EagT6 Tse6 NT complex
关键词 keywords	EagT6, Tse6, Type VI secretion, T6SS, CHAPERONE; CHAPERONE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6xrf__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6xrf__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6xrf__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	21.07 Å
Rg（电子密度）	19.95 Å
总 Rg	20.79 Å
原子数	5222
残基数	336
排除体积	46489 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6xrf__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6xrf__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`6xrf__assembly_3__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Effector EagT6
分子量 formula_weight	16653.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,D,E,G,H
原子数 atom_count	15822

MTLYRLHEADLEIPDAWQDQSINIFKLPASGPAREASFVISRDASQGDAPFADYVARQLENAEKQLPGFKLHKRWDINIHGHAAVLLDYQWQREGRDLMLRQVFIERRPAVLITTLTTTPADLPHHEPAWKQAMQTLVPRPTPSGS

来源 Source

来源生物 organism	Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	208964
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	PAAR motif family protein
分子量 formula_weight	6220.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,F,I

MDAQAAARLGDEIAHGFGVAAMVAGAVAGALIGAAVVAATAATGGLAAVILAGSIAAGGLSHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Pseudomonas aeruginosa
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	287
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	246

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晶胞边长 a length_a	68.951 Å
晶胞边长 b length_b	68.951 Å
晶胞边长 c length_c	173.054 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	18

空间群 space_group	P 32
空间群编号 int_tables_number	145
晶系 crystal_system	trigonal

分辨率 resolution	2.560 Å
最低分辨率 resolution_low	28.840 Å
R 因子 r_factor	0.2316
R_work r_work	0.2295
R_free r_free	0.2682

EagT6 Tse6 NT complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Effector EagT6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

PAAR motif family protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6xrf__assembly_2__model_1

6xrf__assembly_2__model_1 | I(q)

6xrf__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (1)

EagT6 Tse6 NT complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Effector EagT6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PAAR motif family protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6xrf__assembly_2__model_1

6xrf__assembly_2__model_1 | I(q)

6xrf__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (1)