6ycz

Plasmodium falciparum Myosin A delta-Nter, Post-Rigor state

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Myosin-A

Plasmodium falciparum (isolate 3D7)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Myosin A tail domain interacting protein × 1 （W7K1J7） Uncharacterized protein × 1 （A0A2I0BQX1） SULFATE ION × 3 1,2-ETHANEDIOL × 2 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MYOA_PLAF7
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–818； UniProt 1–818

Myosin A tail domain interacting protein

Plasmodium falciparum (isolate NF54)

UniProt W7K1J7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Myosin-A × 1 （Q8IDR3） Uncharacterized protein × 1 （A0A2I0BQX1） SULFATE ION × 3 1,2-ETHANEDIOL × 2 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	W7K1J7_PLAFO
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–204； UniProt 1–204

Uncharacterized protein

Plasmodium falciparum (isolate NF54)

UniProt A0A2I0BQX1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Myosin-A × 1 （Q8IDR3） Myosin A tail domain interacting protein × 1 （W7K1J7） SULFATE ION × 3 1,2-ETHANEDIOL × 2 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2I0BQX1_PLAFO
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–134； UniProt 1–134

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6ycz
沉积日期 deposition_date	2020-03-19
结构标题 title	Plasmodium falciparum Myosin A delta-Nter, Post-Rigor state
关键词 keywords	Myosin A, Myosin, Plasmodium, Myosin XIV, Myosin 14, MOTOR PROTEIN; MOTOR PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6ycz__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6ycz__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6ycz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	36.06 Å
Rg（电子密度）	35.68 Å
总 Rg	36.10 Å
原子数	8501
残基数	1057
排除体积	151890 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6ycz__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Myosin-A
分子量 formula_weight	92394.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	8556

MAVTNEEIKTASKIVRRVSNVEAFDKSGSVFKGYQIWTDISPTIENDPNIMFVKCVVQQGSKKEKLTVVQIDPPGTGTPYDIDPTHAWNCNSQVDPMSFGDIGLLNHTNIPCVLDFLKHRYLKNQIYTTAVPLIVAINPYKDLGNTTNEWIRRYRDTADHTKLPPHVFTCAREALSNLHGVNKSQTIIVSGESGAGKTEATKQIMRYFASSKSGNMDLRIQTAIMAANPVLEAFGNAKTIRNNNSSRFGRFMQLVISHEGGIRYGSVVAFLLEKSRIITQDDNERSYHIFYQFLKGANSTMKSKFGLKGVTEYKLLNPNSTEVSGVDDVKDFEEVIESLKNMELSESDIEVIFSIVAGILTLGNVRLIEKQEAGLSDAAAIMDEDMGVFNKACELMYLDPELIKREILIKVTVAGGTKIEGRWNKNDAEVLKSSLCKAMYEKLFLWIIRHLNSRIEPEGGFKTFMGMLDIFGFEVFKNNSLEQLFINITNEMLQKNFVDIVFERESKLYKDEGISTAELKYTSNKEVINVLCEKGKSVLSYLEDQCLAPGGTDEKFVSSCATNLKENNKFTPAKVASNKNFIIQHTIGPIQYCAESFLLKNKDVLRGDLVEVIKDSPNPIVQQLFEGQVIEKGKIAKGSLIGSQFLNQLTSLMNLINSTEPHFIRCIKPNENKKPLEWCEPKILIQLHALSILEALVLRQLGYSYRRTFEEFLYQYKFVDIAAAEDSSVENQNKCVNILKLSGLSESMYKIGKSMVFLKQEGAKILTKIQREKLVEWENCVSVIEAAILKHKYKQKVNKNIPSLLRVQAHIRKKMVAQ

来源 Source

来源生物 organism	Plasmodium falciparum (isolate 3D7)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	36329
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Myosin A tail domain interacting protein
分子量 formula_weight	23510.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MKQECNVCYFNLPDPESTLGPYDNELNYFTWGPGFEYEPEPQRKPLSIEESFENSEESEESVADIQQLEEKVDESDVRIYFNEKSSGGKISIDNASYNARKLGLAPSSIDEKKIKELYGDNLTYEQYLEYLSICVHDKDNVEELIKMFAHFDNNCTGYLTKSQMKNILTTWGDALTDQEAIDALNAFSSEDNIDYKLFCEDILQ

来源 Source

来源生物 organism	Plasmodium falciparum (isolate NF54)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	5843
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Uncharacterized protein
分子量 formula_weight	15692.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MASDMEEKFREAFILFSSCSDHIEMYKFFELMNSFGIILTNDEKAALPNDINMDYWLNFAKKHYNYEQPFKHINNVNEQNTNVQIKIDNFLGIMKALDTRLTESDLNILLQITNPENKSTLNLKTVSQKLTESI

来源 Source

来源生物 organism	Plasmodium falciparum (isolate NF54)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	5843
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 8 Entity 8 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	6yczA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	530 —

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晶胞边长 a length_a	90.080 Å
晶胞边长 b length_b	114.430 Å
晶胞边长 c length_c	170.710 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.270 Å
最低分辨率 resolution_low	48.300 Å
R 因子 r_factor	0.1820
R_work r_work	0.1790
R_free r_free	0.2270

Plasmodium falciparum Myosin A delta-Nter, Post-Rigor state

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Myosin-A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Myosin A tail domain interacting protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Uncharacterized protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6ycz__assembly_1__model_1

6ycz__assembly_1__model_1 | I(q)

6ycz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (2)

Plasmodium falciparum Myosin A delta-Nter, Post-Rigor state

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Myosin-A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Myosin A tail domain interacting protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Uncharacterized protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6ycz__assembly_1__model_1

6ycz__assembly_1__model_1 | I(q)

6ycz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (2)