CREBBP
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 1081–1197 | 未记录 | OSN (4~{R})-6-[(~{E})-5-(7-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)pent-1-enyl]-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；20% ethylene glycol 21% PEG6K 0.1M tris pH 8.3 0.125M lithium chloride | 分辨率 2.20 Å R-free 0.269 |
| 2 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 B； UniProt 1081–1197 | 未记录 | OSN (4~{R})-6-[(~{E})-5-(7-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)pent-1-enyl]-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；20% ethylene glycol 21% PEG6K 0.1M tris pH 8.3 0.125M lithium chloride | 分辨率 2.20 Å R-free 0.269 |
| 3 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 C； UniProt 1081–1197 | 未记录 | OSN (4~{R})-6-[(~{E})-5-(7-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)pent-1-enyl]-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；20% ethylene glycol 21% PEG6K 0.1M tris pH 8.3 0.125M lithium chloride | 分辨率 2.20 Å R-free 0.269 |
| 4 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 D； UniProt 1081–1197 | 未记录 | OSN (4~{R})-6-[(~{E})-5-(7-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)pent-1-enyl]-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；20% ethylene glycol 21% PEG6K 0.1M tris pH 8.3 0.125M lithium chloride | 分辨率 2.20 Å R-free 0.269 |
| 5 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 E； UniProt 1081–1197 | 未记录 | OSN (4~{R})-6-[(~{E})-5-(7-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)pent-1-enyl]-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；20% ethylene glycol 21% PEG6K 0.1M tris pH 8.3 0.125M lithium chloride | 分辨率 2.20 Å R-free 0.269 |
| 6 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 F； UniProt 1081–1197 | 未记录 | OSN (4~{R})-6-[(~{E})-5-(7-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)pent-1-enyl]-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；20% ethylene glycol 21% PEG6K 0.1M tris pH 8.3 0.125M lithium chloride | 分辨率 2.20 Å R-free 0.269 |
| 7 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 G； UniProt 1081–1197 | 未记录 | OSN (4~{R})-6-[(~{E})-5-(7-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)pent-1-enyl]-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；20% ethylene glycol 21% PEG6K 0.1M tris pH 8.3 0.125M lithium chloride | 分辨率 2.20 Å R-free 0.269 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 6YIJ | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1JSP NMR Structure of CBP Bromodomain in complex with p53 peptide 提交 2001-08-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
0.5mM CBP bromodomain U-15N; 0.5mM P53 peptide; 100mM phosphate buffer; pH 6.5 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5mM CBP bromodomain U-15N,13C; 0.5mM P53 peptide;100mM phosphate buffer; pH 6.5 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5mM CBP bromodomain U-15N,13C; 0.5mM P53 peptide;100mM phosphate buffer; pH 6.5 | 99.9%D2O
NMR样品组成
0.5mM CBP bromodomain U-15N,13C,75% 2H; 0.5mM P53 peptide;100mM phosphate buffer; pH 6.5 | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1LIQ Non-native Solution Structure of a fragment of the CH1 domain of CBP 提交 2002-04-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
376–402（27 aa）
片段：RESIDUES 1-27
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；275 K；压力 ambient
NMR样品组成
0.4mM CBP(376-402), 0.6mM TCEP, 0.6mM ZnSO4, 95% H2O, 10% D2O | 95% H2O, 10% D2O
NMR样品组成
0.4mM CBP(376-402), 0.6mM TCEP, 0.6mM ZnSO4, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1WO3 Solution structure of Minimal Mutant 1 (MM1): Multiple alanine mutant of non-native CHANCE domain 提交 2004-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
376–400（25 aa）
片段：CBP
|
突变：E1A, R3S, S6A, H9K, R11A, T12A, M13A, K14A, L17A, N18A, Q24A, A25K | ZN ZINC ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.9；275 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.4mM MM1, 0.5mM TCEP, 1mM ZnSO4, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.4mM MM1, 0.5mM TCEP, 1mM ZnSO4, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1WO4 Solution structure of Minimal Mutant 2 (MM2): Multiple alanine mutant of non-native CHANCE domain 提交 2004-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
376–400（25 aa）
片段：CBP
|
突变：E1A, R3S, S6A, P8S, H9K, R11A, T12A, M13A, K14A, L17A, N18A, Q24A, A25K | ZN ZINC ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.9；275 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.4mM MM2, 0.5mM TCEP, 1mM ZnSO4, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.4mM MM2, 0.5mM TCEP, 1mM ZnSO4, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1WO5 Solution structure of Designed Functional Finger 2 (DFF2): Designed mutant based on non-native CHANCE domain 提交 2004-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
376–400（25 aa）
片段：CBP
|
突变：E1R, R3I, S6F, P8K, H9V, R11A, T12A, M13A, K14A, L17A, N18A, Q24A, A25K | ZN ZINC ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.9；275 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.3mM DFF2, 0.5mM TCEP, 1mM ZnSO4, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1WO6 Solution structure of Designed Functional Finger 5 (DFF5): Designed mutant based on non-native CHANCE domain 提交 2004-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
376–400（25 aa）
片段：CBP
|
突变：E1A, R3Y, A4Y, S6I, H9K, R11A, T12A, M13A, K14A, L17A, N18A, M20T, Q24F, A25K | ZN ZINC ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.2；275 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.3mM DFF5, 0.5mM TCEP, 1mM ZnSO4, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1WO7 Solution structure of Designed Functional Finger 7 (DFF7): Designed mutant based on non-native CHANCE domain 提交 2004-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
376–400（25 aa）
片段：CBP
|
突变：E1F, R3S, A4T, S6Y, H9K, R11A, T12A, M13A, K14A, L17A, N18A, M20I, Q24Y, A25K | ZN ZINC ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7；275 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.25mM DFF7, 0.5mM TCEP, 1mM ZnSO4, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1ZOQ IRF3-CBP complex 提交 2005-05-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
2065–2111（47 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.2 M ammonium acetate, 0.15 M Mg acetate, 5% (v/v) PEG 4000, 50 mM Na HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.226 |
| 1ZOQ IRF3-CBP complex 提交 2005-05-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
2065–2111（47 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.2 M ammonium acetate, 0.15 M Mg acetate, 5% (v/v) PEG 4000, 50 mM Na HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.226 |
| 2D82 Target Structure-Based Discovery of Small Molecules that Block Human p53 and CREB Binding Protein (CBP) Association 提交 2005-12-01 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：Bromodomain
|
未记录 | TTR 9-ACETYL-2,3,4,9-TETRAHYDRO-1H-CARBAZOL-1-ONE × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 AMBIENT
NMR样品组成
0.5MM CBP BROMODOMAIN U-15N, 13C; 3.0MM CRB Ligand; 100MM PHOSPHATE BUFFER; PH 6.5 | 100% D2O
NMR样品组成
0.5MM CBP BROMODOMAIN U-15N, 13C, 75% 2H; 3.0MM CRB Ligand; 100MM PHOSPHATE BUFFER; PH 6.5 | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2KJE NMR structure of CBP TAZ2 and adenoviral E1A complex 提交 2009-05-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1763–1854（92 aa）
片段：UNP residues 1763-1854
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
1-1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TRIS-1, 1-1.5 mM [U-100% 15N] TRIS-2, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2KWF The structure of E-protein activation domain 1 bound to the KIX domain of CBP/p300 elucidates leukemia induction by E2A-PBX1 提交 2010-04-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
587–673（87 aa）
片段：UNP residues 587-673, KIX domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM DSS-1, 20 mM MES-2, 1 mM beta-mercaptoethanol-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2L84 Solution NMR structures of CBP bromodomain with small molecule j28 提交 2011-01-03 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：Bromo domain residues 1081-1197
|
未记录 | J28 5-[(E)-(2-amino-4-hydroxy-5-methylphenyl)diazenyl]-2,4-dimethylbenzenesulfonic acid × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 3 mM J28, 100 mM sodium phosphate, 3 mM [U-100% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 3 mM J28, 100 mM sodium phosphate, 3 mM [U-100% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2L85 Solution NMR structures of CBP bromodomain with small molecule of HBS 提交 2011-01-04 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：BROMO DOMAIN residues 1081-1197
|
未记录 | L85 4-[(E)-(4-hydroxyphenyl)diazenyl]benzenesulfonic acid × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 3 mM (E)-4-((4-hydroxyphenyl)diazenyl)benzenesulfonic acid, 100 mM sodium phosphate, 3 mM [U-100% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 3 mM (E)-4-((4-hydroxyphenyl)diazenyl)benzenesulfonic acid, 100 mM sodium phosphate, 3 mM [U-100% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LXS Allosteric communication in the KIX domain proceeds through dynamic re-packing of the hydrophobic core 提交 2012-08-31 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
587–673（87 aa）
片段：UNP RESIDUES 587-673
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.8；300 K；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-1, 2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_2-2, 25 mM sodium chloride-3, 50 mM potassium phosphate-4, 1 mM sodium azide-5, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LXT Allosteric communication in the KIX domain proceeds through dynamic re-packing of the hydrophobic core 提交 2012-08-31 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
587–673（87 aa）
片段：UNP RESIDUES 587-673
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.8；300 K；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-1, 2 mM entity_2-2, 2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_3-3, 25 mM sodium chloride-4, 50 mM potassium phosphate-5, 1 mM sodium azide-6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2N1A Docked structure between SUMO1 and ZZ-domain from CBP 提交 2015-03-26 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
1699–1751（53 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
20 mM MES, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
20 mM MES, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2RNY Complex Structures of CBP Bromodomain with H4 ack20 Peptide 提交 2008-02-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成
0.5mM [U-100% 13C; U-100% 15N] sodium phosphate, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3DWY Crystal Structure of the Bromodomain of Human CREBBP 提交 2008-07-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：Bromo domain: residues 1084-1197
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN, 25% PEG3350, 5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.219 |
| 3DWY Crystal Structure of the Bromodomain of Human CREBBP 提交 2008-07-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：Bromo domain: residues 1084-1197
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN, 25% PEG3350, 5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.219 |
| 3P1C Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with acetylated lysine 提交 2010-09-30 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | ALY N(6)-ACETYLLYSINE × 1 SCN THIOCYANATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN
25% PEG3350
5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.218 |
| 3P1C Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with acetylated lysine 提交 2010-09-30 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | ALY N(6)-ACETYLLYSINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN
25% PEG3350
5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.218 |
| 3P1D Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with N-Methyl-2-pyrrolidone (NMP) 提交 2010-09-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：Bromo domain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | SCN THIOCYANATE ION × 1 MB3 1-methylpyrrolidin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN
20% PEG3350
5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.218 |
| 3P1D Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with N-Methyl-2-pyrrolidone (NMP) 提交 2010-09-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：Bromo domain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | MB3 1-methylpyrrolidin-2-one × 1 K POTASSIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN
20% PEG3350
5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.218 |
| 3P1E Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with dimethyl sulfoxide (DMSO) 提交 2010-09-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：Bromo domain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | SCN THIOCYANATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN
25% PEG3350
5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.236 |
| 3P1E Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with dimethyl sulfoxide (DMSO) 提交 2010-09-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：Bromo domain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 K POTASSIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN
25% PEG3350
5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.236 |
| 3P1F Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with a hydroquinazolin ligand 提交 2010-09-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：Bromo domain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 K POTASSIUM ION × 1 3PF 3-methyl-3,4-dihydroquinazolin-2(1H)-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.15M KSCN
20% PEG3350
10% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.218 |
| 3P1F Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with a hydroquinazolin ligand 提交 2010-09-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：Bromo domain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 K POTASSIUM ION × 1 3PF 3-methyl-3,4-dihydroquinazolin-2(1H)-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.15M KSCN
20% PEG3350
10% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.218 |
| 3SVH Crystal Structure of the bromdomain of human CREBBP in complex with a 3,5-dimethylisoxazol ligand 提交 2011-07-12 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | KRG 3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-ethoxybenzoic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.25M KSCN, 10% PEG 3350, 5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.224 |
| 3SVH Crystal Structure of the bromdomain of human CREBBP in complex with a 3,5-dimethylisoxazol ligand 提交 2011-07-12 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | KRG 3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-ethoxybenzoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.25M KSCN, 10% PEG 3350, 5% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.224 |
| 4A9K BROMODOMAIN OF HUMAN CREBBP WITH N-(4-hydroxyphenyl)acetamide 提交 2011-11-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：BROMODOMAIN, RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 TYL N-(4-HYDROXYPHENYL)ACETAMIDE (TYLENOL) × 1 SCN THIOCYANATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
277 K；150 MM KSCN, 20% PEG 3350, 4 DEGREES CELSIUS.
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.197 |
| 4A9K BROMODOMAIN OF HUMAN CREBBP WITH N-(4-hydroxyphenyl)acetamide 提交 2011-11-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：BROMODOMAIN, RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | TYL N-(4-HYDROXYPHENYL)ACETAMIDE (TYLENOL) × 1 K POTASSIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
277 K；150 MM KSCN, 20% PEG 3350, 4 DEGREES CELSIUS.
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.197 |
| 4N3W Crystal Structure of the Bromodomain-PHD Finger Module of Human Transcriptional Co-Activator CBP in complex with Acetylated Histone 4 Peptide (H4K20ac). 提交 2013-10-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1080–1316（237 aa）
片段：Bromodomain-PHD Finger Module, residues 1080-1316
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG 3,350, 0.2 M magnesium chloride, and 0.1 M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.286 |
| 4N4F Crystal Structure of the Bromodomain-PHD Finger Module of Human Transcriptional Co-Activator CBP in complex with di-Acetylated Histone 4 Peptide (H412acK16ac). 提交 2013-10-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1080–1316（237 aa）
片段：Bromodomain residues 1080-1316
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20% PEG MME 2,000, 0.2 M trimethylamine N-oxide, and 0.1 M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.241 |
| 4NR4 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with an isoxazolyl-benzimidazole ligand 提交 2013-11-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 2LK 1-(4-chlorobenzyl)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1H-benzimidazole × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.1M MgCl, 0.1M Tris pH 8.0, 20% PEG 6K, 10% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.192 |
| 4NR4 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with an isoxazolyl-benzimidazole ligand 提交 2013-11-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 2LK 1-(4-chlorobenzyl)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1H-benzimidazole × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.1M MgCl, 0.1M Tris pH 8.0, 20% PEG 6K, 10% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.192 |
| 4NR5 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with an isoxazolyl-benzimidazole ligand 提交 2013-11-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 2LL 5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]-2-(2-phenylethyl)-1H-benzimidazole × 1 NO3 NITRATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.20M NaNO3, 20.0% PEG 3350, 10.0% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.226 |
| 4NR6 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with an oxazepin ligand 提交 2013-11-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 2LN 1-[7-(3,4-dimethoxyphenyl)-9-{[(3R)-1-methylpiperidin-3-yl]methoxy}-2,3-dihydro-1,4-benzoxazepin-4(5H)-yl]propan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；0.10M MgCl2, 0.1M MES pH 6.0, 20.0% PEG 6K, 10.0% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.231 |
| 4NR7 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with an isoxazolyl-benzimidazole ligand 提交 2013-11-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 2LO 2-[2-(3-chloro-4-methoxyphenyl)ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(2S)-2-(morpholin-4-yl)propyl]-1H-benzimidazole × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；0.20M NH4Cl, 0.1M MES pH 6.0, 20.0% PEG 6K, 10.0% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.144 |
| 4NYV Crystal Structure of the Bromodomain of human CREBBP in complex with a quinazolin-one ligand 提交 2013-12-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 15E 6-bromo-3-methyl-3,4-dihydroquinazolin-2(1H)-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.15M KSCN, 25% PEG_3350, 5% ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.251 |
| 4NYV Crystal Structure of the Bromodomain of human CREBBP in complex with a quinazolin-one ligand 提交 2013-12-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 15E 6-bromo-3-methyl-3,4-dihydroquinazolin-2(1H)-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.15M KSCN, 25% PEG_3350, 5% ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.251 |
| 4NYV Crystal Structure of the Bromodomain of human CREBBP in complex with a quinazolin-one ligand 提交 2013-12-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 15E 6-bromo-3-methyl-3,4-dihydroquinazolin-2(1H)-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.15M KSCN, 25% PEG_3350, 5% ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.251 |
| 4NYV Crystal Structure of the Bromodomain of human CREBBP in complex with a quinazolin-one ligand 提交 2013-12-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 15E 6-bromo-3-methyl-3,4-dihydroquinazolin-2(1H)-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.15M KSCN, 25% PEG_3350, 5% ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.251 |
| 4NYW Crystal Structure of the Bromodomain of human CREBBP in complex with a dihydroquinoxalinone ligand 提交 2013-12-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | SCN THIOCYANATE ION × 1 2O3 (3R)-N-[3-(3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)propyl]-3-methyl-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinoxaline-5-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20% PEG 3350, 9% Ethylene Glycol, 0.18M KSCN, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.187 |
| 4NYX Crystal Structure of the Bromodomain of human CREBBP in complex with a dihydroquinoxalinone ligand 提交 2013-12-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 2O4 (3R)-N-[3-(7-methoxy-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)propyl]-3-methyl-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinoxaline-5-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.05M CaCl2, 0.1M TRIS, 20.0% PEG 6K, 10.0% EtGly, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.135 |
| 4OUF Crystal Structure of CBP bromodomain 提交 2014-02-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：Bromo domain: residues 1082-1197
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.1 M HEPES-Na pH 7.0, 0.2M KSCN, 25% PEG3350 and 5% Ethylene Glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.191 |
| 4OUF Crystal Structure of CBP bromodomain 提交 2014-02-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1082–1197（116 aa）
片段：Bromo domain: residues 1082-1197
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.1 M HEPES-Na pH 7.0, 0.2M KSCN, 25% PEG3350 and 5% Ethylene Glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.191 |
| 4TQN Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with UL04 提交 2014-06-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：Monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：Kinase domain, Residues 1081-1197
|
未记录 | UL4 3-[(5-acetyl-2-ethoxyphenyl)carbamoyl]benzoic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M MES pH 6.5, 0.1M MgCl2, 20% PEG 6000, 10% EtGly
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.199 |
| 4TS8 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with XZ08 提交 2014-06-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：Monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：Kinase domain, residues 1081-1197
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 XZ8 4-(1-acetyl-1H-indol-3-yl)-5-methyl-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M MES pH 6.5, 0.1M MgCl2, 20% PEG 3350 10% EtGly
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.254 |
| 4WHU BROMO domain of CREB binding protein 提交 2014-09-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 3OT 2-methoxy-4-{1-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]-2-(2-phenylethyl)-1H-benzimidazol-5-yl}cyclohepta-2,4,6-trien-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；obtained through screen with Hampton Research kits (HT and Index)
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.261 |
| 4YK0 Crystal structure of the CBP bromodomain in complex with CPI098 提交 2015-03-03 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1045–1158（114 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | 986 (4R)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M Bis-Tris, pH 6.5
27% PEG3350
0.1M magnesium chloride
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.269 |
| 4YK0 Crystal structure of the CBP bromodomain in complex with CPI098 提交 2015-03-03 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1045–1158（114 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | 986 (4R)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M Bis-Tris, pH 6.5
27% PEG3350
0.1M magnesium chloride
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.269 |
| 4YK0 Crystal structure of the CBP bromodomain in complex with CPI098 提交 2015-03-03 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
1045–1158（114 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | 986 (4R)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M Bis-Tris, pH 6.5
27% PEG3350
0.1M magnesium chloride
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.269 |
| 4YK0 Crystal structure of the CBP bromodomain in complex with CPI098 提交 2015-03-03 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
1045–1158（114 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | 986 (4R)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M Bis-Tris, pH 6.5
27% PEG3350
0.1M magnesium chloride
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.269 |
| 5CGP Selective pharmacological inhibition of the CREB binding protein bromodomain regulates inflammatory cytokines in macrophages and RGS4 in neurons 提交 2015-07-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 53W 5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-2-[2-(4-methoxyphenyl)ethyl]-1-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]-1H-benzimidazole × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15-20% PEG 8000, 0.2M CaAcetate, 0.1 M cacodylate ph 6-7
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.249 |
| 5DBM Crystal structure of the CBP bromodomain in complex with CPI703 提交 2015-08-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1082-1197)
|
未记录 | 58N (4R)-6-(1-tert-butyl-1H-pyrazol-4-yl)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；277 K；0.1 M BICINE:NaOH pH 9.0, 20% (w/v) PEG 6000 (CPI703)
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.220 |
| 5DBM Crystal structure of the CBP bromodomain in complex with CPI703 提交 2015-08-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1082-1197)
|
未记录 | 58N (4R)-6-(1-tert-butyl-1H-pyrazol-4-yl)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；277 K；0.1 M BICINE:NaOH pH 9.0, 20% (w/v) PEG 6000 (CPI703)
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.220 |
| 5DBM Crystal structure of the CBP bromodomain in complex with CPI703 提交 2015-08-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1082-1197)
|
未记录 | 58N (4R)-6-(1-tert-butyl-1H-pyrazol-4-yl)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；277 K；0.1 M BICINE:NaOH pH 9.0, 20% (w/v) PEG 6000 (CPI703)
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.220 |
| 5EIC Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with AYC 提交 2015-10-29 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN, 20% PEG3350, 10% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.209 |
| 5EIC Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with AYC 提交 2015-10-29 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | 5J5 2-[(chloroacetyl)amino]-5-[(E)-(4-sulfophenyl)diazenyl]benzenesulfonic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN, 20% PEG3350, 10% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.209 |
| 5ENG Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with UP39 提交 2015-11-09 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | 5QN methyl 2-[2-(3,5-dihydro-2~{H}-pyrazin-4-yl)ethoxy]-5-[(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)carbamoyl]benzoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN, 20% PEG3350, 10% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.172 |
| 5EP7 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with UN32 提交 2015-11-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 5QR 3-[(1-methyl-6-oxidanylidene-pyridin-3-yl)carbonylamino]benzoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN, 20% PEG3350, 10% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.176 |
| 5GH9 Crystal structure of CBP Bromodomain with H3K56ac peptide 提交 2016-06-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1081–1196（116 aa）
片段：UNP residues 1081-1196
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.05 M Cadmium sulfate hydrate, 0.1 M HEPES, 1.0 M Sodium acetate trihydrate,
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.176 |
| 5H85 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with UO37D 提交 2015-12-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 5XS methyl 3-(7~{H}-purin-6-ylcarbamoyl)benzoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.15M KSCN, 20% PEG 3350, 10% EtGly
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.199 |
| 5I83 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP bound to the benzodiazepinone G02773986 提交 2016-02-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1082-1197)
|
未记录 | SCN THIOCYANATE ION × 1 68Y (4R)-4-methyl-7-[(1R)-1-phenylethoxy]-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.2 M potassium thiocyanate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 5% v/v ethylene glycol, 23% PEG3350
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.188 |
| 5I86 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP bound to the benzodiazepinone G02778174 提交 2016-02-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1082-1197)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SCN THIOCYANATE ION × 1 69A (4R)-N-benzyl-4-methyl-2-oxo-2,3,4,5-tetrahydro-1H-1,5-benzodiazepine-6-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.2 M potassium thiocyanate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 5% v/v ethylene glycol, 23% PEG3350
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.161 |
| 5I86 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP bound to the benzodiazepinone G02778174 提交 2016-02-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1082-1197)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 69A (4R)-N-benzyl-4-methyl-2-oxo-2,3,4,5-tetrahydro-1H-1,5-benzodiazepine-6-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.2 M potassium thiocyanate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 5% v/v ethylene glycol, 23% PEG3350
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.161 |
| 5I89 Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP bound to the benzodiazepinone G02857790 提交 2016-02-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1082-1197)
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 69B (4R)-6-(3-cyclopropyl-1-methyl-1H-indazol-5-yl)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.2 M calcium acetate hydrate, and 20% w/v PEG3350
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.137 |
| 5I8B CBP in complex with Cpd23 ((R)-6-(3-(benzyloxy)phenyl)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-benzo[b][1,4]diazepin-2-one) 提交 2016-02-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1312（232 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 69F (4R)-6-[3-(benzyloxy)phenyl]-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 NA SODIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris pH 8,
0.2 M sodium thiocyanate
19-23% PEG 3350
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.200 |
| 5I8G CBP in complex with Cpd637 ((R)-4-methyl-6-(1-methyl-3-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-1H-indazol-5-yl)-1,3,4,5-tetrahydro-2H-benzo[b][1,4]diazepin-2-one) 提交 2016-02-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1312（232 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 69E (4R)-4-methyl-6-[1-methyl-3-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-1H-indazol-5-yl]-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 NA SODIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；containing 0.1 M Bis-Tris pH 8,
0.2 M sodium thiocyanate
19-23% PEG 3350
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.210 |
| 5J0D Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with a benzoxazepine compound 提交 2016-03-28 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 6F9 7-(3,5-dimethoxyphenyl)-N-[(3S)-1-methylpiperidin-3-yl]-4-propanoyl-2,3,4,5-tetrahydro-1,4-benzoxazepine-9-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；25% PEG3350, 0.2 M MgCl2, 0.1M BisTris pH 7.5
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.197 |
| 5JEM Complex of IRF-3 with CBP 提交 2016-04-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
2065–2111（47 aa）
片段：UNP residues 2065-2111
链 D
2065–2111（47 aa）
片段：UNP residues 2065-2111
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.242 |
| 5JEM Complex of IRF-3 with CBP 提交 2016-04-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 F
2065–2111（47 aa）
片段：UNP residues 2065-2111
链 H
2065–2111（47 aa）
片段：UNP residues 2065-2111
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.242 |
| 5KTU Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP bound to pyrazolopiperidine scaffold 提交 2016-07-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1082-1197)
|
未记录 | 6XB 1-(3-phenylazanyl-1,4,6,7-tetrahydropyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)ethanone × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, and 25% polyethylene glycol (PEG) 3350
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.212 |
| 5KTU Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP bound to pyrazolopiperidine scaffold 提交 2016-07-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1082-1197)
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, and 25% polyethylene glycol (PEG) 3350
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.212 |
| 5KTW CREBBP bromodomain in complex with Cpd 44 (3-((5-acetyl-1-(cyclopropylmethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-3-yl)amino)-N-isopropylbenzamide) 提交 2016-07-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1085–1196（112 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | 6XG 3-[[1-(cyclopropylmethyl)-5-ethanoyl-6,7-dihydro-4~{H}-pyrazolo[4,3-c]pyridin-3-yl]amino]-~{N}-propan-2-yl-benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.2 M potassium thiocyanate,
0.1 M Bis-Tris pH 5.5,
5% v/v ethylene glycol,
23% PEG 3350
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.176 |
| 5KTW CREBBP bromodomain in complex with Cpd 44 (3-((5-acetyl-1-(cyclopropylmethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-3-yl)amino)-N-isopropylbenzamide) 提交 2016-07-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1085–1196（112 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | 6XG 3-[[1-(cyclopropylmethyl)-5-ethanoyl-6,7-dihydro-4~{H}-pyrazolo[4,3-c]pyridin-3-yl]amino]-~{N}-propan-2-yl-benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.2 M potassium thiocyanate,
0.1 M Bis-Tris pH 5.5,
5% v/v ethylene glycol,
23% PEG 3350
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.176 |
| 5KTW CREBBP bromodomain in complex with Cpd 44 (3-((5-acetyl-1-(cyclopropylmethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-3-yl)amino)-N-isopropylbenzamide) 提交 2016-07-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
1085–1196（112 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | 6XG 3-[[1-(cyclopropylmethyl)-5-ethanoyl-6,7-dihydro-4~{H}-pyrazolo[4,3-c]pyridin-3-yl]amino]-~{N}-propan-2-yl-benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.2 M potassium thiocyanate,
0.1 M Bis-Tris pH 5.5,
5% v/v ethylene glycol,
23% PEG 3350
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.176 |
| 5KTX CREBBP bromodomain in complex with Cpd59 ((S)-1-(3-((2-fluoro-4-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)phenyl)amino)-1-(tetrahydrofuran-3-yl)-6,7-dihydro-1H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5(4H)-yl)ethanone) 提交 2016-07-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1085–1196（112 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | 6XH 1-[3-[[2-fluoranyl-4-(1-methylpyrazol-4-yl)phenyl]amino]-1-[(3~{S})-oxolan-3-yl]-6,7-dihydro-4~{H}-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl]ethanone × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；287 K；0.2 M potassium thiocyanate,
0.1 M Bis-Tris pH 5.5,
5% v/v ethylene glycol,
23% PEG 3350
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.172 |
| 5LPJ Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；277 K；LiSO4, PEG 3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.196 |
| 5LPL Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP bound to the inhibitor XDM3c 提交 2016-08-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 71X ~{N}-[(1~{R},2~{R})-7-chloranyl-2-oxidanyl-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7.5；277 K；NaCl, PEG 3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.210 |
| 5MME Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with US46C 提交 2016-12-09 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | 8Q6 dimethyl 5-[(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)amino]benzene-1,3-dicarboxylate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Cacodylate, pH6.5, 0.2 M Calcium acetate, 18% PEG8000
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.176 |
| 5MME Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with US46C 提交 2016-12-09 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | 8Q6 dimethyl 5-[(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)amino]benzene-1,3-dicarboxylate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Cacodylate, pH6.5, 0.2 M Calcium acetate, 18% PEG8000
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.176 |
| 5MMG Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with UT07C 提交 2016-12-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | UT0 1-[4-ethoxy-3-[(1-methylsulfonylindol-6-yl)amino]phenyl]ethanone × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.15 M KSCN, 10% Ethylene Glycol, 20% PEG3350
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.163 |
| 5MPK Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with DK19 提交 2016-12-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | 0BC ~{N}-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)-3-(2~{H}-1,2,3,4-tetrazol-5-yl)-5-(1,3-thiazol-4-yl)benzamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES-Na, pH7.5, 0.2 M MgCl2, 25% P3350
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 5MPK Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with DK19 提交 2016-12-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | 0BC ~{N}-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)-3-(2~{H}-1,2,3,4-tetrazol-5-yl)-5-(1,3-thiazol-4-yl)benzamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES-Na, pH7.5, 0.2 M MgCl2, 25% P3350
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 5MPN Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with FA26 提交 2016-12-16 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | YE5 1-[4-ethoxy-3-[3-(2~{H}-1,2,3,4-tetrazol-5-yl)phenyl]phenyl]ethanone × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M MgCl2, 0.1 M Bis-Tris, pH6.5, 5% EG, 23% PEG3350
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.167 |
| 5MPZ Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with CBP007 提交 2016-12-19 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 4I8 methyl 2-oxidanylidene-3~{H}-1,3-benzoxazole-6-carboxylate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M MgCl2, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 5% v/v ethylene glycol, 23% PEG3350
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.176 |
| 5MQE Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with CBP006 提交 2016-12-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | PKU 4-bromanyl-~{N}-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M potassium thiocyanate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 5% v/v ethylene glycol, 23% PEG3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.225 |
| 5MQE Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with CBP006 提交 2016-12-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | PKU 4-bromanyl-~{N}-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M potassium thiocyanate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 5% v/v ethylene glycol, 23% PEG3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.225 |
| 5MQG Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with CBP015 提交 2016-12-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | F31 1-(4-azanyl-3-methoxy-phenyl)ethanone × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M potassium thiocyanate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 5% v/v ethylene glycol, 23% PEG3350
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.191 |
| 5MQG Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with CBP015 提交 2016-12-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | F31 1-(4-azanyl-3-methoxy-phenyl)ethanone × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M potassium thiocyanate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 5% v/v ethylene glycol, 23% PEG3350
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.191 |
| 5MQK Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with CBP019 提交 2016-12-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | QPR 1-(1-methylindol-3-yl)ethanone × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.15 M KSCN, 20% PEG3350, 10% EG
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.210 |
| 5MQK Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with CBP019 提交 2016-12-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | QPR 1-(1-methylindol-3-yl)ethanone × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.15 M KSCN, 20% PEG3350, 10% EG
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.210 |
| 5NLK Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with US13A 提交 2017-04-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | 92E ~{N}-[3-acetamido-5-[(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)carbamoyl]phenyl]furan-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M Buffer System 3, pH8.5, 37.50% v/v MPD_P1K_P3350, 0.09 M NPS
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.216 |
| 5NRW Crystal structure of the human bromodomain of CREBBP bound to the inhibitor XDM4 提交 2017-04-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain, UNP residues 1081-1197
|
未记录 | 96N 4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-~{N}-(naphthalen-1-ylmethyl)-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；277 K；LiSO4, PEG 3350, ethylene glycol
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.260 |
| 5NU3 Crystal structure of the human bromodomain of CREBBP bound to the inhibitor XDM-CBP 提交 2017-04-28 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | 99E ~{N}-[[2,8-bis(oxidanyl)naphthalen-1-yl]methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 BU3 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 4 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；277 K；LiSO4, PEG 3350, ethylene glycol
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.200 |
| 5OWK Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with DSPB2A002 提交 2017-09-01 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | 7MX ethyl 4-chloranyl-1-methyl-6-oxidanylidene-pyridine-3-carboxylate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M MES, pH6.5, 0.1 M MgCl2, 20% PEG6K, 10% EG
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.176 |
| 5SVH Crystal structure of the KIX domain of CBP in complex with a MLL/c-Myb chimera 提交 2016-08-06 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
587–673（87 aa）
片段：UNP residues 587-673
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M potassium sulfate
2.3M Ammonium sulphate
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.242 |
| 5SVH Crystal structure of the KIX domain of CBP in complex with a MLL/c-Myb chimera 提交 2016-08-06 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
587–673（87 aa）
片段：UNP residues 587-673
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 12 CL CHLORIDE ION × 42 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M potassium sulfate
2.3M Ammonium sulphate
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.242 |
| 5SVH Crystal structure of the KIX domain of CBP in complex with a MLL/c-Myb chimera 提交 2016-08-06 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
587–673（87 aa）
片段：UNP residues 587-673
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 14 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M potassium sulfate
2.3M Ammonium sulphate
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.242 |
| 5TB6 Structure of bromodomain of CREBBP with a pyrazolo[4,3-c]pyridin fragment 提交 2016-09-11 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | 77X 1-(3-phenyl-1,4,6,7-tetrahydropyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)propan-1-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.15M KSCN
15% PEG 3350
5% EtGly
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.243 |
| 5W0E CREBBP bromodomain in complex with Cpd19 (3-(7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-N-methyl-1-(tetrahydro-2H-pyran-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carboxamide) 提交 2017-05-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：Bromodomain, UNP residues 1082-1197
|
未记录 | 9U4 3-[7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-N-methyl-1-(oxan-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.2M MgCl2, 0.1M Bis-Tris pH6.5, 22% PEG3350
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.260 |
| 5W0F CREBBP Bromodomain in complex with Cpd3 ((S)-1-(3-(6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-1-(tetrahydrofuran-3-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)ethan-1-one) 提交 2017-05-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：Bromodomain, UNP residues 1082-1197
|
未记录 | 9U7 1-{3-[6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-1-[(3S)-oxolan-3-yl]-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl}ethan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.2 M Li2SO4, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 19% PEG3350
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.206 |
| 5W0L CREBBP Bromodomain in complex with Cpd10 (1-(3-(7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-1-(tetrahydro-2H-pyran-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)ethan-1-one) 提交 2017-05-31 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：Bromodomain, UNP residues 1082-1197
|
未记录 | 9UD 1-{3-[7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-1-(oxan-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl}ethan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；100 mM Bis-Tris pH 5.5, 200-300 mM KSCN, 21-25% PEG 3350
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.229 |
| 5W0L CREBBP Bromodomain in complex with Cpd10 (1-(3-(7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-1-(tetrahydro-2H-pyran-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)ethan-1-one) 提交 2017-05-31 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1082–1197（116 aa）
片段：Bromodomain, UNP residues 1082-1197
|
未记录 | 9UD 1-{3-[7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-1-(oxan-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl}ethan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；100 mM Bis-Tris pH 5.5, 200-300 mM KSCN, 21-25% PEG 3350
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.229 |
| 5W0Q CREBBP Bromodomain in complex with Cpd17 (N,2,7-trimethyl-2,3-dihydro-4H-benzo[b][1,4]oxazine-4-carboxamide) 提交 2017-05-31 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：Bromodomain, UNP residues 1082-1197
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 9UG (2R)-N,2,7-trimethyl-2,3-dihydro-4H-1,4-benzoxazine-4-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 0.2M Li2SO4, 25% PEG3350
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.213 |
| 5XXH Crystal Structure Analysis of the CBP 提交 2017-07-04 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | E0D (3S)-1-[2-(3-ethanoylindol-1-yl)ethanoyl]piperidine-3-carboxylic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；30% PEG 3350, 0.2M MgCl2, 0.1M Tris HCl, PH 8.5
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.208 |
| 6ALB CREBBP bromodomain in complex with Cpd 30 (1-(3-(3-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)isoquinolin-8-yl)-1-(tetrahydro-2H-pyran-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)ethan-1-one) 提交 2017-08-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1312（232 aa）
片段：Bromodomain (UNP residue 1081-1312)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 BKJ 1-{3-[3-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)isoquinolin-8-yl]-1-(oxan-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl}ethan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.2 M Li2SO4, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 19% PEG3350
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.242 |
| 6ALC CREBBP bromodomain in complex with Cpd 4 (1-(1-(cyclopropylmethyl)-3-(1H-indol-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)ethan-1-one) 提交 2017-08-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1085–1196（112 aa）
片段：Bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.2 M Li2SO4, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 19% PEG3350
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.212 |
| 6ALC CREBBP bromodomain in complex with Cpd 4 (1-(1-(cyclopropylmethyl)-3-(1H-indol-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)ethan-1-one) 提交 2017-08-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1085–1196（112 aa）
片段：Bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | BKD 1-[1-(cyclopropylmethyl)-3-(1H-indol-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl]ethan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.2 M Li2SO4, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 19% PEG3350
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.212 |
| 6AXQ CREBBP bromodomain in complex with Cpd6 (methyl 1H-indole-3-carboxylate) 提交 2017-09-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1085–1196（112 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 C2Y methyl 1H-indole-3-carboxylate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.2；289 K；3.545 M Formate, 100 mM Tris-HCl pH 8.2, 10% glycerol
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.216 |
| 6AXQ CREBBP bromodomain in complex with Cpd6 (methyl 1H-indole-3-carboxylate) 提交 2017-09-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1085–1196（112 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 C2Y methyl 1H-indole-3-carboxylate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.2；289 K；3.545 M Formate, 100 mM Tris-HCl pH 8.2, 10% glycerol
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.216 |
| 6AXQ CREBBP bromodomain in complex with Cpd6 (methyl 1H-indole-3-carboxylate) 提交 2017-09-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
1085–1196（112 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 C2Y methyl 1H-indole-3-carboxylate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.2；289 K；3.545 M Formate, 100 mM Tris-HCl pH 8.2, 10% glycerol
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.216 |
| 6AXQ CREBBP bromodomain in complex with Cpd6 (methyl 1H-indole-3-carboxylate) 提交 2017-09-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
1085–1196（112 aa）
片段：bromodomain (UNP residues 1085-1196)
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 C2Y methyl 1H-indole-3-carboxylate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.2；289 K；3.545 M Formate, 100 mM Tris-HCl pH 8.2, 10% glycerol
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.216 |
| 6AY3 CREBBP bromodomain in complex with Cpd16 (5-(7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-N-methyl-1H-indole-3-carboxamide) 提交 2017-09-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1083–1197（115 aa）
片段：Bromodomain (UNP residue 1083-1197)
|
未记录 | C3J 5-[7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-N-methyl-1H-indole-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.2M MgCl2, 0.1M Bis-Tris pH6.5, 22% PEG3350
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.237 |
| 6AY3 CREBBP bromodomain in complex with Cpd16 (5-(7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-N-methyl-1H-indole-3-carboxamide) 提交 2017-09-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1083–1197（115 aa）
片段：Bromodomain (UNP residue 1083-1197)
|
未记录 | C3J 5-[7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-N-methyl-1H-indole-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.2M MgCl2, 0.1M Bis-Tris pH6.5, 22% PEG3350
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.237 |
| 6AY5 CREBBP bromodomain in complex with Cpd17 (5-(7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-3-methylbenzo[d]thiazol-2(3H)-one) 提交 2017-09-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1083–1197（115 aa）
片段：Bromodomain (UNP residue 1083-1197)
|
未记录 | C3V 5-[7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-3-methyl-1,3-benzothiazol-2(3H)-one × 1 SO4 SULFATE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.2M MgCl2, 0.1M Bis-Tris pH6.5, 22% PEG3350
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.184 |
| 6DMK A multiconformer ligand model of an isoxazolyl-benzimidazole ligand bound to the bromodomain of human CREBBP 提交 2018-06-05 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1045–1157（113 aa）
|
未记录 | NO3 NITRATE ION × 1 2LL 5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]-2-(2-phenylethyl)-1H-benzimidazole × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.20M NaNO3, 20.0% PEG 3350, 10.0% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.234 |
| 6ES7 Structure and dynamics conspire in the evolution of affinity between intrinsically disordered proteins 提交 2017-10-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
2061–2109（49 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）na；压力 1
NMR样品组成
100 % 13C/15N CID, 100 % 13C/15N NCBD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6FQO Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with DT29 提交 2018-02-14 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | E2T ~{N}-[3-(2,5-dimethyl-3-oxidanylidene-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.15 M KSCN, 20% PEG3350, 10% EG
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.194 |
| 6FQO Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with DT29 提交 2018-02-14 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | E2T ~{N}-[3-(2,5-dimethyl-3-oxidanylidene-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.15 M KSCN, 20% PEG3350, 10% EG
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.194 |
| 6FQT Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with DR46 提交 2018-02-14 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | AY2 ~{N}-[3-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)-5-(1-methylpyrazol-3-yl)phenyl]furan-2-carboxamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Hepes, pH7.5, 0.2 M LiSO4, 25% PEG3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.255 |
| 6FQU Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with DR09 提交 2018-02-14 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | E3B 1-[3-[3-[3,3-bis(fluoranyl)piperidin-1-yl]phenyl]-4-ethoxy-phenyl]ethanone × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.15 M KSCN, 20% PEG3350, 10% EG
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.190 |
| 6FR0 Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with PB08 提交 2018-02-15 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | E3H ~{N}-[3-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)-5-(2-ethyl-5-methyl-3-oxidanylidene-1,2-oxazol-4-yl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Hepes, pH7.5, 0.2 M LiSO4, 25% PEG3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.202 |
| 6FR0 Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with PB08 提交 2018-02-15 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | E3H ~{N}-[3-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)-5-(2-ethyl-5-methyl-3-oxidanylidene-1,2-oxazol-4-yl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Hepes, pH7.5, 0.2 M LiSO4, 25% PEG3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.202 |
| 6FRF Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with PA10 提交 2018-02-15 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | E3T ~{N}-[3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Sodium Citrate, pH 5.6, 1.3 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.228 |
| 6FRF Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with PA10 提交 2018-02-15 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | E3T ~{N}-[3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Sodium Citrate, pH 5.6, 1.3 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.228 |
| 6FRF Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with PA10 提交 2018-02-15 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | E3T ~{N}-[3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Sodium Citrate, pH 5.6, 1.3 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.228 |
| 6FRF Crystal structure of CREBBP bromodomain complexd with PA10 提交 2018-02-15 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | E3T ~{N}-[3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Sodium Citrate, pH 5.6, 1.3 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.228 |
| 6QST Structure of CREBBP bromodomain with compound 2 bound 提交 2019-02-22 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | JGK ~{N}-[3-(3-azanyl-5-methyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris propane pH 7.5, 0.02 M Sodium/potassium phosphate, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.219 |
| 6QST Structure of CREBBP bromodomain with compound 2 bound 提交 2019-02-22 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | JGK ~{N}-[3-(3-azanyl-5-methyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris propane pH 7.5, 0.02 M Sodium/potassium phosphate, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.219 |
| 6QST Structure of CREBBP bromodomain with compound 2 bound 提交 2019-02-22 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | JGK ~{N}-[3-(3-azanyl-5-methyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris propane pH 7.5, 0.02 M Sodium/potassium phosphate, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.219 |
| 6QST Structure of CREBBP bromodomain with compound 2 bound 提交 2019-02-22 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | JGK ~{N}-[3-(3-azanyl-5-methyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris propane pH 7.5, 0.02 M Sodium/potassium phosphate, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.219 |
| 6SQC Crystal structure of complex between nuclear coactivator binding domain of CBP and [1040-1086]ACTR containing alpha-methylated Leu1055 and Leu1076 提交 2019-09-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
2061–2112（52 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；20% PEG6000, 100 mM Tris pH 8 and 10 mM ZnCl2
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.274 |
| 6SQE Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with KD341 提交 2019-09-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | LSZ ~{N}-[3-[(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)carbamoyl]-5-(1-methylpyrazol-3-yl)phenyl]-5-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]furan-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.2M MgCl2, 25% PEG 3350, 0.1M BisTris pH 5.5
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.191 |
| 6SQF Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with LB32A 提交 2019-09-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | LTW ~{N}-[3-[[5-ethanoyl-2-[2-(2-oxa-6-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)ethoxy]phenyl]carbamoyl]-5-(1-methylpyrazol-3-yl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1M MES pH 6.5, 12% PEG 20000
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.215 |
| 6SQM Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with LA36 提交 2019-09-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | LU5 ~{N}-[3-acetamido-5-[(3-methylcinnolin-5-yl)carbamoyl]phenyl]furan-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；8% Ethylene glycol, 0.1M HEPES pH 7.5, 10% PEG 8000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.269 |
| 6SQM Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with LA36 提交 2019-09-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | LU5 ~{N}-[3-acetamido-5-[(3-methylcinnolin-5-yl)carbamoyl]phenyl]furan-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；8% Ethylene glycol, 0.1M HEPES pH 7.5, 10% PEG 8000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.269 |
| 6SQM Crystal structure of CREBBP bromodomain complexed with LA36 提交 2019-09-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | LU5 ~{N}-[3-acetamido-5-[(3-methylcinnolin-5-yl)carbamoyl]phenyl]furan-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；8% Ethylene glycol, 0.1M HEPES pH 7.5, 10% PEG 8000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.269 |
| 6SXX Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with ACA007 提交 2019-09-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 LXQ (3~{R})-1-ethanoylpyrrolidine-3-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；25% PEG3350, 0.2 M Potassium thiocyanate, 5% EtGly
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.253 |
| 6SXX Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with ACA007 提交 2019-09-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 LXQ (3~{R})-1-ethanoylpyrrolidine-3-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；25% PEG3350, 0.2 M Potassium thiocyanate, 5% EtGly
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.253 |
| 6YIK Crystal structure of the CREBBP bromodomain in complex with a tetrahydroquinoxaline ligand 提交 2020-04-01 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | OSQ (3~{R})-~{N}-[3-(3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)-2,2-bis(fluoranyl)propyl]-3-methyl-2-oxidanylidene-3,4-dihydro-1~{H}-quinoxaline-5-carboxamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；21% PEG3350
15% ethylene glycol
0.25M sodium formate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.184 |
| 6YIK Crystal structure of the CREBBP bromodomain in complex with a tetrahydroquinoxaline ligand 提交 2020-04-01 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | OSQ (3~{R})-~{N}-[3-(3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)-2,2-bis(fluoranyl)propyl]-3-methyl-2-oxidanylidene-3,4-dihydro-1~{H}-quinoxaline-5-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；21% PEG3350
15% ethylene glycol
0.25M sodium formate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.184 |
| 6YIK Crystal structure of the CREBBP bromodomain in complex with a tetrahydroquinoxaline ligand 提交 2020-04-01 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | OSQ (3~{R})-~{N}-[3-(3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)-2,2-bis(fluoranyl)propyl]-3-methyl-2-oxidanylidene-3,4-dihydro-1~{H}-quinoxaline-5-carboxamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；21% PEG3350
15% ethylene glycol
0.25M sodium formate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.184 |
| 6YIL Crystal structure of the CREBBP bromodomain in complex with a tetrahydroquinoxaline ligand 提交 2020-04-01 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | OSQ (3~{R})-~{N}-[3-(3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)-2,2-bis(fluoranyl)propyl]-3-methyl-2-oxidanylidene-3,4-dihydro-1~{H}-quinoxaline-5-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20% PEG3350
10% ethylene glycol
0.2M sodium acetate
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.151 |
| 6YIM Crystal structure of the CREBBP bromodomain in complex with a benzo-diazepine ligand 提交 2020-04-01 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | OS8 (4~{R})-~{N}-[3-(7-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)propyl]-4-methyl-2-oxidanylidene-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepine-6-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20% PEG3350
10% ethylene glycol
0.2M sodium fluoride
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.167 |
| 7CO1 Crystal structure of SMAD2 in complex with wild-type CBP 提交 2020-08-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1951–1973（23 aa）
链 D
1951–1973（23 aa）
链 F
1951–1973（23 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；1 M sodium phosphate monobasic monohydrate-potassium phosphate dibasic
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.283 |
| 7EVJ Crystal structure of CBP bromodomain liganded with 9c 提交 2021-05-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | JE9 3-acetyl-1-((3-(1-cyclopropyl-1H-pyrazol-4-yl)-2-fluoro-5-(hydroxymethyl)phenyl)carbamoyl)indolizin-7-yl dimethylcarbamate × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；277 K；0.2 M NH4H2PO4, 20% PEG 3350, pH 4.6, and 20% Gly
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.209 |
| 7JFL Crystal structure of human phosphorylated IRF-3 bound to CBP 提交 2020-07-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
2065–2111（47 aa）
链 D
2065–2111（47 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；0.1 M sodium acetate pH 5.0, 0.2 M MgCl2, 5% PEG 3350
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.223 |
| 7JFM Crystal structure of mouse phosphorylated IRF-3 bound to CBP 提交 2020-07-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
2065–2111（47 aa）
链 D
2065–2111（47 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.2 M ammonium citrate tribasic at pH 7.0, 12% PEG 3350
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.252 |
| 7JUO CBP bromodomain complexed with YF2-23 提交 2020-08-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YF2 N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-(1-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)-1H-indol-4-yl}ethanesulfonamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；277 K；0.2 M lithium citrate tribasic tetrahydrate, 17-19% PEG 3350, pH 8.4
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.276 |
| 7JUO CBP bromodomain complexed with YF2-23 提交 2020-08-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YF2 N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-(1-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)-1H-indol-4-yl}ethanesulfonamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；277 K；0.2 M lithium citrate tribasic tetrahydrate, 17-19% PEG 3350, pH 8.4
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.276 |
| 7JUO CBP bromodomain complexed with YF2-23 提交 2020-08-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YF2 N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-(1-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)-1H-indol-4-yl}ethanesulfonamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；277 K；0.2 M lithium citrate tribasic tetrahydrate, 17-19% PEG 3350, pH 8.4
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.276 |
| 7JUO CBP bromodomain complexed with YF2-23 提交 2020-08-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YF2 N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-(1-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)-1H-indol-4-yl}ethanesulfonamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；277 K；0.2 M lithium citrate tribasic tetrahydrate, 17-19% PEG 3350, pH 8.4
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.276 |
| 7JUO CBP bromodomain complexed with YF2-23 提交 2020-08-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 F
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YF2 N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-(1-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)-1H-indol-4-yl}ethanesulfonamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；277 K；0.2 M lithium citrate tribasic tetrahydrate, 17-19% PEG 3350, pH 8.4
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.276 |
| 7JUO CBP bromodomain complexed with YF2-23 提交 2020-08-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 G
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YF2 N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-(1-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)-1H-indol-4-yl}ethanesulfonamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；277 K；0.2 M lithium citrate tribasic tetrahydrate, 17-19% PEG 3350, pH 8.4
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.276 |
| 7JUO CBP bromodomain complexed with YF2-23 提交 2020-08-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 H
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YF2 N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-(1-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)-1H-indol-4-yl}ethanesulfonamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；277 K；0.2 M lithium citrate tribasic tetrahydrate, 17-19% PEG 3350, pH 8.4
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.276 |
| 7JUO CBP bromodomain complexed with YF2-23 提交 2020-08-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 E
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YF2 N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-(1-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)-1H-indol-4-yl}ethanesulfonamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；277 K；0.2 M lithium citrate tribasic tetrahydrate, 17-19% PEG 3350, pH 8.4
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.276 |
| 7RLE Crystal structure of PPAR gamma in complex with CREB-binding protein and agonist GW1929 提交 2021-07-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
57–80（24 aa）
片段：Residues 57-80
链 D
57–80（24 aa）
片段：Residues 57-80
|
未记录 | EDK (2~{S})-3-[4-[2-[methyl(pyridin-2-yl)amino]ethoxy]phenyl]-2-[[2-(phenylcarbonyl)phenyl]amino]propanoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；1M sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1M sodium cacodylate, pH 6.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.275 |
| 7TB3 cryo-EM structure of MBP-KIX-apoferritin 提交 2021-12-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric |
链 A
549–630（82 aa）
链 B
549–630（82 aa）
链 C
549–630（82 aa）
链 D
549–630（82 aa）
链 E
549–630（82 aa）
链 F
549–630（82 aa）
链 G
549–630（82 aa）
链 H
549–630（82 aa）
链 I
549–630（82 aa）
链 J
549–630（82 aa）
链 K
549–630（82 aa）
链 L
549–630（82 aa）
链 M
549–630（82 aa）
链 N
549–630（82 aa）
链 O
549–630（82 aa）
链 P
549–630（82 aa）
链 Q
549–630（82 aa）
链 R
549–630（82 aa）
链 S
549–630（82 aa）
链 T
549–630（82 aa）
链 U
549–630（82 aa）
链 V
549–630（82 aa）
链 W
549–630（82 aa）
链 X
549–630（82 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.57 Å |
| 7TBH cryo-EM structure of MBP-KIX-apoferritin complex with peptide 7 提交 2021-12-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric |
链 A
549–630（82 aa）
链 B
549–630（82 aa）
链 C
549–630（82 aa）
链 D
549–630（82 aa）
链 E
549–630（82 aa）
链 F
549–630（82 aa）
链 G
549–630（82 aa）
链 H
549–630（82 aa）
链 I
549–630（82 aa）
链 J
549–630（82 aa）
链 K
549–630（82 aa）
链 L
549–630（82 aa）
链 M
549–630（82 aa）
链 N
549–630（82 aa）
链 O
549–630（82 aa）
链 P
549–630（82 aa）
链 Q
549–630（82 aa）
链 R
549–630（82 aa）
链 S
549–630（82 aa）
链 T
549–630（82 aa）
链 U
549–630（82 aa）
链 V
549–630（82 aa）
链 W
549–630（82 aa）
链 X
549–630（82 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 7WX2 CBP-BrD complexed with NEO2734 提交 2022-02-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | 7OW 1,3-dimethyl-5-[2-(oxan-4-yl)-3-[2-(trifluoromethyloxy)ethyl]benzimidazol-5-yl]pyridin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8.5；289 K；PEG3350, NaNO3, ethylene glycol
|
分辨率 1.24 Å R-free 0.200 |
| 7XH6 Crystal structure of CBP bromodomain liganded with CCS1477 提交 2022-04-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M HEPES pH 7.5, 2% v/v Tacsimate pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.227 |
| 7XH6 Crystal structure of CBP bromodomain liganded with CCS1477 提交 2022-04-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M HEPES pH 7.5, 2% v/v Tacsimate pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.227 |
| 7XHE Crystal structure of CBP bromodomain liganded with CCS151 提交 2022-04-08 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | JHF (6S)-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(3R)-1-methylsulfonylpyrrolidin-3-yl]benzimidazol-2-yl]-1-(3-fluoranyl-4-methoxy-phenyl)piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M Sodium malonate pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.231 |
| 7XHE Crystal structure of CBP bromodomain liganded with CCS151 提交 2022-04-08 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | JHF (6S)-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(3R)-1-methylsulfonylpyrrolidin-3-yl]benzimidazol-2-yl]-1-(3-fluoranyl-4-methoxy-phenyl)piperidin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M Sodium malonate pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.231 |
| 7XI0 Crystal structure of CBP bromodomain liganded with CCS150 提交 2022-04-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | EL0 (6S)-1-(3-chloranyl-4-methoxy-phenyl)-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(3R)-1-methylsulfonylpyrrolidin-3-yl]benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M NaAc, 20% w/v Polyethylene glycol, 3350 PH 7.3
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.224 |
| 7XI0 Crystal structure of CBP bromodomain liganded with CCS150 提交 2022-04-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | EL0 (6S)-1-(3-chloranyl-4-methoxy-phenyl)-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(3R)-1-methylsulfonylpyrrolidin-3-yl]benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M NaAc, 20% w/v Polyethylene glycol, 3350 PH 7.3
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.224 |
| 7XIJ Crystal structure of CBP bromodomain liganded with Y08175 提交 2022-04-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1043–1159（117 aa）
|
未记录 | EJ3 3-[(1-ethanoyl-5-methoxy-indol-3-yl)carbonylamino]-4-fluoranyl-5-(1-methylpyrazol-4-yl)benzoic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M MgCl2 0.1M TrsHCl 30% PEG4000 PH7.5
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.221 |
| 7XM7 Crystal Structure of the CBP in complex with the Y08188 提交 2022-04-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | GAY 3-ethanoyl-~{N}-[2-fluoranyl-3-(1-methylpyrazol-4-yl)phenyl]-7-methoxy-indolizine-1-carboxamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG3350 0.2M NH4NO3 PH6.2
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.257 |
| 7XM7 Crystal Structure of the CBP in complex with the Y08188 提交 2022-04-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | GAY 3-ethanoyl-~{N}-[2-fluoranyl-3-(1-methylpyrazol-4-yl)phenyl]-7-methoxy-indolizine-1-carboxamide × 1 NO3 NITRATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG3350 0.2M NH4NO3 PH6.2
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.257 |
| 7XM7 Crystal Structure of the CBP in complex with the Y08188 提交 2022-04-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | NO3 NITRATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG3350 0.2M NH4NO3 PH6.2
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.257 |
| 7XM7 Crystal Structure of the CBP in complex with the Y08188 提交 2022-04-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG3350 0.2M NH4NO3 PH6.2
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.257 |
| 7XNE Crystal structure of CBP bromodomain liganded with Y08284 提交 2022-04-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | GHF N-[3-(1-cyclopropylpyrazol-4-yl)-2-fluoranyl-5-[(1S)-1-oxidanylethyl]phenyl]-3-ethanoyl-7-methoxy-indolizine-1-carboxamide × 2 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Magnesium acetate tetrahydrate, 0.1 M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5, 20% w/v Polyethylene glycol 8,000
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.259 |
| 7XNG Crystal structure of CBP bromodomain liganded with Y08092(31g) 提交 2022-04-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
链 B
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | GI5 3-[(1-ethanoylindol-3-yl)carbonylamino]-5-[[(2S)-oxan-2-yl]oxymethyl]benzoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG3350 0.2M KSCN 0.1M HEPES PH8.5
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.242 |
| 8FUP Bromodomain of CBP liganded with BMS-536924 and CCS-1477 提交 2023-01-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | N6I (3M)-4-{[(2S)-2-(3-chlorophenyl)-2-hydroxyethyl]amino}-3-[4-methyl-6-(morpholin-4-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]pyridin-2(1H)-one × 1 JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.2 M Ammonium sulfate, 30% w/v Polyethylene glycol 8000
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.212 |
| 8FUP Bromodomain of CBP liganded with BMS-536924 and CCS-1477 提交 2023-01-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.2 M Ammonium sulfate, 30% w/v Polyethylene glycol 8000
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.212 |
| 8FV2 Bromodomain of CBP liganded with CCS-1477 提交 2023-01-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；0.056M Sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.344M Potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.226 |
| 8FV2 Bromodomain of CBP liganded with CCS-1477 提交 2023-01-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；0.056M Sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.344M Potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.226 |
| 8FV2 Bromodomain of CBP liganded with CCS-1477 提交 2023-01-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；0.056M Sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.344M Potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.226 |
| 8FV2 Bromodomain of CBP liganded with CCS-1477 提交 2023-01-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；0.056M Sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.344M Potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.226 |
| 8FXA Bromodomain of CBP liganded with iCBP4 提交 2023-01-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 YJY (6S)-1-[3,5-bis(trifluoromethyl)phenyl]-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}piperidin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.180 |
| 8FXA Bromodomain of CBP liganded with iCBP4 提交 2023-01-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 YJY (6S)-1-[3,5-bis(trifluoromethyl)phenyl]-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}piperidin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.180 |
| 8FXE Bromodomain of CBP liganded with iCBP6 提交 2023-01-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP residues 1081-1197
|
未记录 | YID (6S)-1-(3-tert-butylphenyl)-6-{(5P)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.186 |
| 8FXN Bromodomain of CBP liganded with iCBP7 提交 2023-01-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | YN0 tert-butyl {(1R,4s)-4-[(5M)-2-[(2S)-1-(3-tert-butylphenyl)-6-oxopiperidin-2-yl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1H-benzimidazol-1-yl]cyclohexyl}carbamate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.03M Sodium nitrate, 0.03 Sodium phosphate dibasic, 0.03M Ammonium sulfate, 0.1 M Imidazole, 0.1 M MES pH 6.5, 20% v/v PEG 500 MME; 10% w/v PEG 20000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.242 |
| 8FXO Bromodomain of CBP liganded with iCBP8 提交 2023-01-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | YN5 (6S)-1-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}piperidin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.2 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5, 30% w/v Polyethylene glycol 4000
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.205 |
| 8G6T Bromodomain of CBP liganded with inhibitor iCBP2 提交 2023-02-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YRI (6S)-1-(3,4-dibromophenyl)-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}piperidin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；0.01 M Nickel(II) chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.222 |
| 8G6T Bromodomain of CBP liganded with inhibitor iCBP2 提交 2023-02-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YRI (6S)-1-(3,4-dibromophenyl)-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}piperidin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；0.01 M Nickel(II) chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.222 |
| 8G6T Bromodomain of CBP liganded with inhibitor iCBP2 提交 2023-02-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YRI (6S)-1-(3,4-dibromophenyl)-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}piperidin-2-one × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；0.01 M Nickel(II) chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.222 |
| 8G6T Bromodomain of CBP liganded with inhibitor iCBP2 提交 2023-02-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
1082–1197（116 aa）
|
未记录 | YRI (6S)-1-(3,4-dibromophenyl)-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}piperidin-2-one × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；0.01 M Nickel(II) chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.222 |
| 8GA2 Bromodomain of CBP liganded with inhibitor iCBP5 提交 2023-02-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1082–1197（116 aa）
片段：Bromodomain, residues 1082-1197
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 YVK (6S)-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}-1-phenylpiperidin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate; 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5; 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.225 |
| 8GA2 Bromodomain of CBP liganded with inhibitor iCBP5 提交 2023-02-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
1082–1197（116 aa）
片段：Bromodomain, residues 1082-1197
|
未记录 | YVK (6S)-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}-1-phenylpiperidin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate; 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5; 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.225 |
| 8GA2 Bromodomain of CBP liganded with inhibitor iCBP5 提交 2023-02-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
1082–1197（116 aa）
片段：Bromodomain, residues 1082-1197
|
未记录 | YVK (6S)-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}-1-phenylpiperidin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate; 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5; 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.225 |
| 8GA2 Bromodomain of CBP liganded with inhibitor iCBP5 提交 2023-02-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1082–1197（116 aa）
片段：Bromodomain, residues 1082-1197
|
未记录 | YVK (6S)-6-{(5M)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1s,4R)-4-methoxycyclohexyl]-1H-benzimidazol-2-yl}-1-phenylpiperidin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate; 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5; 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.225 |
| 8HAL Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 提交 2022-10-26 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric |
链 K
1084–1873（790 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 8HAM Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 提交 2022-10-26 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric |
链 K
1084–1873（790 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 8HAN Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 3 提交 2022-10-26 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric |
链 K
1084–1873（790 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 9GEJ Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione 提交 2024-08-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKJ 2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione × 1 SO4 SULFATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.3 M LiSO4, 0.1 M Tris pH 8, PEG 3350
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.220 |
| 9GEJ Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione 提交 2024-08-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKJ 2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione × 1 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.3 M LiSO4, 0.1 M Tris pH 8, PEG 3350
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.220 |
| 9GEJ Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione 提交 2024-08-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.3 M LiSO4, 0.1 M Tris pH 8, PEG 3350
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.220 |
| 9GEJ Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione 提交 2024-08-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKJ 2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione × 1 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.3 M LiSO4, 0.1 M Tris pH 8, PEG 3350
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.220 |
| 9GEJ Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione 提交 2024-08-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 E
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKJ 2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.3 M LiSO4, 0.1 M Tris pH 8, PEG 3350
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.220 |
| 9GEJ Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione 提交 2024-08-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 F
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKJ 2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.3 M LiSO4, 0.1 M Tris pH 8, PEG 3350
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.220 |
| 9GEJ Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione 提交 2024-08-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 G
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKJ 2R,13S,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,13,14,20,21,24,25-dodecahydro-19H,23H-16,18-etheno-9,13-methano-7,28-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-k]pyrido[1,2-s][1,4]dioxa[7,19]diazacyclodocosine-4,8-dione × 2 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.3 M LiSO4, 0.1 M Tris pH 8, PEG 3350
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.220 |
| 9GET Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (R,E)-6-(5-(7-methoxy-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)pent-1-en-1-yl)-4-methyl-8-(morpholine-4-carbonyl)-1,3,4,5-tetrahydro-2H-benzo[b][1,4]diazepin-2-one 提交 2024-08-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKM (4~{R})-6-[(~{E})-5-(7-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)pent-1-enyl]-4-methyl-8-morpholin-4-ylcarbonyl-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 3,350
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.167 |
| 9GEU Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (R,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,17,18,21,22-decahydro-4H,16H,20H-13,15-etheno-7,25-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-h]pyrido[1,2-p][1]oxa[4,16]diazacyclononadecine-4,8(9H)-dione 提交 2024-08-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | BU3 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 2 A1IKL (R,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,17,18,21,22-decahydro-4H,16H,20H-13,15-etheno-7,25-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-h]pyrido[1,2-p][1]oxa[4,16]diazacyclononadecine-4,8(9H)-dione × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；277 K；0.1M citric acid, PEG 3350
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.197 |
| 9GEU Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (R,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,17,18,21,22-decahydro-4H,16H,20H-13,15-etheno-7,25-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-h]pyrido[1,2-p][1]oxa[4,16]diazacyclononadecine-4,8(9H)-dione 提交 2024-08-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | BU3 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 1 A1IKL (R,E)-2-methyl-1,2,3,5,10,11,17,18,21,22-decahydro-4H,16H,20H-13,15-etheno-7,25-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-h]pyrido[1,2-p][1]oxa[4,16]diazacyclononadecine-4,8(9H)-dione × 1 CIT CITRIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；277 K；0.1M citric acid, PEG 3350
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.197 |
| 9GEW Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (R,E)-6-(5-(6-methoxy-2,3-dihydro-4H-benzo[b][1,4]oxazin-4-yl)pent-1-en-1-yl)-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-benzo[b][1,4]diazepin-2-one 提交 2024-08-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKI (4~{R})-6-[(~{E})-5-(6-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzoxazin-4-yl)pent-1-enyl]-4-methyl-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 BU3 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；5% Tacsimate pH 7, 0.1 M Hepes pH 7, 10% PEG monomethyl ether 5000
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.198 |
| 9GEY Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (R,E)-2-methyl-1,2,3,5,9,10,11,12,18,19,22,23-dodecahydro-17H,21H-14,16-etheno-7,26-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-l]pyrido[2,1-d][1]oxa[5,17]diazacycloicosine-4,8-dione 提交 2024-08-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKK (R,E)-2-methyl-1,2,3,5,9,10,11,12,18,19,22,23-dodecahydro-17H,21H-14,16-etheno-7,26-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-l]pyrido[2,1-d][1]oxa[5,17]diazacycloicosine-4,8-dione × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% PEG 3,350
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.211 |
| 9GEY Crystal structure of CREBBP bromodomain in complex with (R,E)-2-methyl-1,2,3,5,9,10,11,12,18,19,22,23-dodecahydro-17H,21H-14,16-etheno-7,26-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-l]pyrido[2,1-d][1]oxa[5,17]diazacycloicosine-4,8-dione 提交 2024-08-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1IKK (R,E)-2-methyl-1,2,3,5,9,10,11,12,18,19,22,23-dodecahydro-17H,21H-14,16-etheno-7,26-(metheno)[1,4]diazepino[2,3-l]pyrido[2,1-d][1]oxa[5,17]diazacycloicosine-4,8-dione × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% PEG 3,350
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.211 |
| 9H02 Crystal structure of human CREBBP histone acetyltransferase domain in complex with a bisubstrate inhibitor, Lys-CoA 提交 2024-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1322–1555（234 aa）
链 A
1618–1700（83 aa）
|
突变：Y1503F 突变：Y1503F | 01K [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (3R,20R)-20-carbamoyl-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4,8,14,22-tetraoxo-12-thia-5,9,15,21-tetraazatricos-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1M (NH4)2SO4, 0.1 Na3 cit 5.6pH, 30% w/v PEG 4000
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.224 |
| 9H0K Crystal structure of human CREBBP histone acetyltransferase domain in complex with Propionyl- Coenzyme A 提交 2024-10-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1322–1555（234 aa）
链 A
1618–1700（83 aa）
|
突变：Y1503F 突变：Y1503F | 1VU propionyl Coenzyme A × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；292 K；0.1M Na3 cit , 2.4M (NH4)2SO4
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.240 |
| 9H0K Crystal structure of human CREBBP histone acetyltransferase domain in complex with Propionyl- Coenzyme A 提交 2024-10-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1322–1555（234 aa）
链 B
1618–1700（83 aa）
|
突变：Y1503F 突变：Y1503F | 1VU propionyl Coenzyme A × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；292 K；0.1M Na3 cit , 2.4M (NH4)2SO4
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.240 |
| 9IWL X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-intrinsic fatty acid (E. coli origin)-CBP coactivator peptide co-crystals obtained by cross-seeding 提交 2024-07-25 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
62–80（19 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris (pH 8.5), 30% PEG 4000, 0.2M Sodium acetate trihydrate
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.236 |
| 9J6O Crystal Structure of bromodomain of human CBP in complex with the inhibitor CZL-046 提交 2024-08-16 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
片段：UNP RESIDUES 1081-1197
|
未记录 | A1L3S (3~{S},5~{S})-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-5-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]-3-fluoranyl-pyrrolidin-2-one × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Potassium sulfate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.290 |
| 9JUU X-ray crystal structure of Y16515 in CBP 提交 2024-10-08 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1EDN (5~{S})-1-(3-chloranyl-4-methoxy-phenyl)-5-[4-(3-methyl-1,2-benzoxazol-5-yl)-1-[(2~{R})-2-morpholin-4-ylpropyl]imidazol-2-yl]pyrrolidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M Sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1 M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5, 30% v/v 2-Propanol
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.219 |
| 9JUY X-ray crystal structure of Y16513 in CBP 提交 2024-10-08 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1081–1197（117 aa）
|
未记录 | A1EDO (5~{S})-1-(3-chloranyl-4-methoxy-phenyl)-5-[4-(3-methyl-1,2-benzoxazol-5-yl)-1-[(2~{S})-2-morpholin-4-ylpropyl]imidazol-2-yl]pyrrolidin-2-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Sodium citrate tribasic dihydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.227 |
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| UniProt名称 | CBP_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 3–119； UniProt 1081–1197 作者链 B； PDB构建体 3–119； UniProt 1081–1197 作者链 C； PDB构建体 3–119； UniProt 1081–1197 作者链 D； PDB构建体 3–119； UniProt 1081–1197 作者链 E； PDB构建体 3–119； UniProt 1081–1197 作者链 F； PDB构建体 3–119； UniProt 1081–1197 作者链 G； PDB构建体 3–119； UniProt 1081–1197 |
