Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Ubiquitin-like protein ISG15 × 1 （Q64339） ZINC ION × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | R1A_SARS2 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–315； UniProt 1564–1878 |
Mus musculus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Replicase polyprotein 1a × 1 （P0DTC1） ZINC ION × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | ISG15_MOUSE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 6yva |
| 沉积日期 deposition_date | 2020-04-28 |
| 结构标题 title | PLpro-C111S with mISG15 |
| 关键词 keywords | Deubiquitinase, papain-like-protease, SARS-CoV-2, ISG15, complex, CELL INVASION; CELL INVASION |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 24.36 Å |
| Rg（电子密度） | 23.45 Å |
| 总 Rg | 24.41 Å |
| 原子数 | 3378 |
| 残基数 | 438 |
| 排除体积 | 60019 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d6yvaa1 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like) |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.15.1 — Ubiquitin-like |
| 家族 Family family | d.15.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d6yvaa2 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.3 — Cysteine proteinases |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.3.1 — Cysteine proteinases |
| 家族 Family family | d.3.1.23 — Papain-like viral protease catalytic domain |
| 结构域编号 domain_id | d6yvac1 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like) |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.15.1 — Ubiquitin-like |
| 家族 Family family | d.15.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d6yvac2 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like) |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.15.1 — Ubiquitin-like |
| 家族 Family family | d.15.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | 6yvaA01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 20 — Ubiquitin-like (UB roll) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 540 — Papain-like viral protease, N-terminal domain |
| 结构域编号 domain_id | 6yvaA02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 1190 — Papain-like viral protease, thumb domain |
| 结构域编号 domain_id | 6yvaC01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 20 — Ubiquitin-like (UB roll) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1 |
| 结构域编号 domain_id | 6yvaC02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 20 — Ubiquitin-like (UB roll) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1 |