Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | PHD2-SPECIFIC RaPID CYCLIC PEPTIDE 3C (14-MER) × 1 MANGANESE (II) ION × 1 2-OXOGLUTARIC ACID × 1 BICARBONATE ION × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | EGLN1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 7–233； UniProt 181–407 |
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| 条目编号 entry_id | 6yw1 |
| 沉积日期 deposition_date | 2020-04-29 |
| 结构标题 title | HIF prolyl hydroxylase 2 (PHD2/ EGLN1) in complex with 2OG and RaPID-derived silent allosteric cyclic peptide 3C (14-mer) |
| 关键词 keywords | ;OXIDOREDUCTASE, NON-HEME DIOXYGENASE, IRON, 2-OXOGLUTARATE, HYPOXIA-INDUCIBLE FACTOR, HIF, HIF PROLYL HYDROXYLASE DOMAIN 2, PHD2, EGLN1, OXYGENASE, HYPOXIA, DNA-BINDING, METAL-BINDING, TRANSCRIPTION, HELIX-LOOP-HELIX-BETA, DSBH, FACIAL TRIAD, CYTOPLASM, TRANSCRIPTION/EPIGENETIC REGULATION, SIGNALING, DEVELOPMENT, CELL STRUCTURE, BETA-HYDROXYLATION, TRANSCRIPTION ACTIVATOR/INHIBITOR, UBL CONJUGATION, POLYMORPHISM, VITAMIN C, ZINC-FINGER, FAMILIAL ERYTHROCYTOSIS, BREAST CANCER, TRANSCRIPTION COMPLEX ;; OXIDOREDUCTASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 17.64 Å |
| Rg（电子密度） | 16.51 Å |
| 总 Rg | 17.58 Å |
| 原子数 | 3480 |
| 残基数 | 221 |
| 排除体积 | 31573 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |