SAXSdb — 6za8

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Neurotensin receptor type 1,Neurotensin receptor type 1,Neurotensin receptor 1 (NTSR1),Neurotensin receptor 1 (NTSR1),Neurotensin receptor type 1,Neurotensin receptor 1 (NTSR1),Neurotensin receptor 1 (NTSR1) ;

Rattus norvegicus

UniProt P20789

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	(2~{S})-2-[[1-(7-chloranylquinolin-4-yl)-5-(2,6-dimethoxyphenyl)pyrazol-3-yl]carbonylamino]-4-methyl-pentanoic acid × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NTR1_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 AAA； PDB构建体 5–308； UniProt 50–371

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6za8
沉积日期 deposition_date	2020-06-05
结构标题 title	Crystal structure of the neurotensin receptor 1 in complex with the small-molecule partial agonist RTI-3a
关键词 keywords	GPCR-ligand complex, rNTSR1, RTI-3a, partial agonist, membrane protein; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6za8__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6za8__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6za8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	31.90 Å
Rg（电子密度）	32.17 Å
总 Rg	32.13 Å
原子数	6635
残基数	450
排除体积	60062 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6za8__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	;Neurotensin receptor type 1,Neurotensin receptor type 1,Neurotensin receptor 1 (NTSR1),Neurotensin receptor 1 (NTSR1),Neurotensin receptor type 1,Neurotensin receptor 1 (NTSR1),Neurotensin receptor 1 (NTSR1) ;
分子量 formula_weight	53089.2 kDa
突变 mutation	;S83G,A86L,T101R,H103D,H105Y,L119F,M121L,E124D,R143K,D150E,A161V,R167L,R213L,V234L,K235R,V240L,I253A,I260A,N262R,K263R,H305R,C332V,F342A,T354S,F358V,S362A ;
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AAA
原子数 atom_count	6659

GPGSGPNSDLDVNTDIYSKVLVTAIYLALFVVGTVGNGVTLFTLARKKSLQSLQSRVDYYLGSLALSDLLILLFALPVDLYNFIWVHHPWAFGDAGCKGYYFLREACTYATALNVVSLSVELYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAIPMLFTMGLQNLSGDGTHPGGLVCTPIVDTATLRVVIQLNTFMSFLFPMLVASILNTVAARRLTVMVHQAAFNMTIEPGRVQALRRGVLVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFVYISDEQWTTALFDFYHYFYMLSNALVYVSAAINPILYNLAEDLVEDWEKARKLLEAARKGQDDEVRILLANGADVNTADETGFTPLHLAAWEGHLGIVEVLLKNGADVNANDERGHTPLHLAAYTGHLEIVEVLLKNGAGVNATDVIGTAPLHLAAMWGHLEIVEVLLKNGADVNAQDKFGKTPFDLAIDNGNEDIAEVLQKAATRELEVLFQ

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	(2~{S})-2-[[1-(7-chloranylquinolin-4-yl)-5-(2,6-dimethoxyphenyl)pyrazol-3-yl]carbonylamino]-4-methyl-pentanoic acid
分子量 formula_weight	523.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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晶胞边长 a length_a	76.468 Å
晶胞边长 b length_b	211.197 Å
晶胞边长 c length_c	93.703 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 2 2 21
空间群编号 int_tables_number	20
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.720 Å
最低分辨率 resolution_low	29.640 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2815
R_free r_free	0.3001

Crystal structure of the neurotensin receptor 1 in complex with the small-molecule partial agonist RTI-3a

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Neurotensin receptor type 1,Neurotensin receptor type 1,Neurotensin receptor 1 (NTSR1),Neurotensin receptor 1 (NTSR1),Neurotensin receptor type 1,Neurotensin receptor 1 (NTSR1),Neurotensin receptor 1 (NTSR1) ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6za8__assembly_1__model_1

6za8__assembly_1__model_1 | I(q)

6za8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the neurotensin receptor 1 in complex with the small-molecule partial agonist RTI-3a

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Neurotensin receptor type 1,Neurotensin receptor type 1,Neurotensin receptor 1 (NTSR1),Neurotensin receptor 1 (NTSR1),Neurotensin receptor type 1,Neurotensin receptor 1 (NTSR1),Neurotensin receptor 1 (NTSR1) ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6za8__assembly_1__model_1

6za8__assembly_1__model_1 | I(q)

6za8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

7. 引用文献 (1)