SAXSdb — 7a8w

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NBS-LRR class disease resistance protein

Oryza sativa subsp. japonica

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Uncharacterized protein × 1 （G4MXW3） water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Uncharacterized protein × 1 （G4MXW3） water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	D5L9G5_ORYSJ
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 AAA； PDB构建体 1–79； UniProt 183–261 作者链 BBB； PDB构建体 1–79； UniProt 183–261 作者链 DDD； PDB构建体 1–79； UniProt 183–261 作者链 EEE； PDB构建体 1–79； UniProt 183–261

Uncharacterized protein

Magnaporthe oryzae (strain 70-15 / ATCC MYA-4617 / FGSC 8958)

UniProt G4MXW3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	NBS-LRR class disease resistance protein × 2 （D5L9G5） water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	NBS-LRR class disease resistance protein × 2 （D5L9G5） water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G4MXW3_MAGO7
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 CCC； PDB构建体 2–93； UniProt 22–113 作者链 FFF； PDB构建体 2–93； UniProt 22–113

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7a8w
沉积日期 deposition_date	2020-08-31
结构标题 title	Complex of rice blast (Magnaporthe oryzae) effector protein AVR-PikC with an engineered HMA domain of Pikp-1 from rice (Oryza sativa)
关键词 keywords	Fungal effector, HMA domain, NLR protein, MAX effector, ANTIFUNGAL PROTEIN; ANTIFUNGAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7a8w__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7a8w__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7a8w__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	18.80 Å
Rg（电子密度）	17.85 Å
总 Rg	18.85 Å
原子数	3510
残基数	225
排除体积	31088 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7a8w__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`7a8w__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	NBS-LRR class disease resistance protein
分子量 formula_weight	8622.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AAA,BBB,DDD,EEE
原子数 atom_count	7129

RKTGLKQKIVIKVAMEGNNCRSKAMALVASTGGVDSVALVGDLRDKIEVVGYGIDPIKLISALRKKVGDAELLQVSQAKED

来源 Source

来源生物 organism	Oryza sativa subsp. japonica
通用名 common_name	Rice
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	39947
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Uncharacterized protein
分子量 formula_weight	10847.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	CCC,FFF

METGNKYIEKRAIDLSRERDPNFFDNPGIPVPECFWFMFKNNVRQDDGTCYSSWKMDMKVGPNWVHIKSDDNCNLSGDFPPGWIVLGKKRPGF

来源 Source

来源生物 organism	Magnaporthe oryzae (strain 70-15 / ATCC MYA-4617 / FGSC 8958)
通用名 common_name	Rice blast fungus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	242507
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	78

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晶胞边长 a length_a	66.784 Å
晶胞边长 b length_b	80.205 Å
晶胞边长 c length_c	105.683 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.150 Å
最低分辨率 resolution_low	44.165 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2241
R_free r_free	0.2722

Complex of rice blast (Magnaporthe oryzae) effector protein AVR-PikC with an engineered HMA domain of Pikp-1 from rice (Oryza sativa)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NBS-LRR class disease resistance protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Uncharacterized protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7a8w__assembly_1__model_1

7a8w__assembly_1__model_1 | I(q)

7a8w__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (1)

Complex of rice blast (Magnaporthe oryzae) effector protein AVR-PikC with an engineered HMA domain of Pikp-1 from rice (Oryza sativa)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NBS-LRR class disease resistance protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Uncharacterized protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7a8w__assembly_1__model_1

7a8w__assembly_1__model_1 | I(q)

7a8w__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (1)