SAXSdb — 7bgb

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Telomerase Cajal body protein 1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 1	H/ACA ribonucleoprotein complex subunit DKC1 × 2 （O60832） H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3 × 2 （Q9NPE3） RNA (92-MER) × 1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1 × 2 （Q9NY12） H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2 × 2 （Q9NX24）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TCAB1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–548； UniProt 1–548

H/ACA ribonucleoprotein complex subunit DKC1

物种未注明

UniProt O60832

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 1	Telomerase Cajal body protein 1 × 1 （Q9BUR4） H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3 × 2 （Q9NPE3） RNA (92-MER) × 1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1 × 2 （Q9NY12） H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2 × 2 （Q9NX24）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DKC1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–514； UniProt 1–514 作者链 G； PDB构建体 1–514； UniProt 1–514

H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3

物种未注明

UniProt Q9NPE3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 1	Telomerase Cajal body protein 1 × 1 （Q9BUR4） H/ACA ribonucleoprotein complex subunit DKC1 × 2 （O60832） RNA (92-MER) × 1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1 × 2 （Q9NY12） H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2 × 2 （Q9NX24）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NOP10_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–64； UniProt 1–64 作者链 J； PDB构建体 1–64； UniProt 1–64

H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1

物种未注明

UniProt Q9NY12

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 1	Telomerase Cajal body protein 1 × 1 （Q9BUR4） H/ACA ribonucleoprotein complex subunit DKC1 × 2 （O60832） H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3 × 2 （Q9NPE3） RNA (92-MER) × 1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2 × 2 （Q9NX24）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GAR1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–217； UniProt 1–217 作者链 H； PDB构建体 1–217； UniProt 1–217

H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2

物种未注明

UniProt Q9NX24

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 1	Telomerase Cajal body protein 1 × 1 （Q9BUR4） H/ACA ribonucleoprotein complex subunit DKC1 × 2 （O60832） H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3 × 2 （Q9NPE3） RNA (92-MER) × 1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1 × 2 （Q9NY12）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NHP2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–153； UniProt 1–153 作者链 I； PDB构建体 1–153； UniProt 1–153

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7bgb
沉积日期 deposition_date	2021-01-06
结构标题 title	The H/ACA RNP lobe of human telomerase
关键词 keywords	H/ACA RNP, ribonucleoprotein, complex, RNA, RNA BINDING PROTEIN; RNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7bgb__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7bgb__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7bgb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	45.69 Å
Rg（电子密度）	45.79 Å
总 Rg	45.90 Å
原子数	14538
残基数	1666
排除体积	253280 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7bgb__assembly_1__model_1`	decameric （10）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Telomerase Cajal body protein 1
分子量 formula_weight	59357.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K
原子数 atom_count	14538

MKTLETQPLAPDCCPSDQDPAPAHPSPHASPMNKNADSELMPPPPERGDPPRLSPDPVAGSAVSQELREGDPVSLSTPLETEFGSPSELSPRIEEQELSENTSLPAEEANGSLSEEEANGPELGSGKAMEDTSGEPAAEDEGDTAWNYSFSQLPRFLSGSWSEFSTQPENFLKGCKWAPDGSCILTNSADNILRIYNLPPELYHEGEQVEYAEMVPVLRMVEGDTIYDYCWYSLMSSAQPDTSYVASSSRENPIHIWDAFTGELRASFRAYNHLDELTAAHSLCFSPDGSQLFCGFNRTVRVFSTARPGRDCEVRATFAKKQGQSGIISCIAFSPAQPLYACGSYGRSLGLYAWDDGSPLALLGGHQGGITHLCFHPDGNRFFSGARKDAELLCWDLRQSGYPLWSLGREVTTNQRIYFDLDPTGQFLVSGSTSGAVSVWDTDGPGNDGKPEPVLSFLPQKDCTNGVSLHPSLPLLATASGQRVFPEPTESGDEGEELGLPLLSTRHVHLECRLQLWWCGGAPDSSIPDDHQGEKGQGGTEGGVGELI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	H/ACA ribonucleoprotein complex subunit DKC1
分子量 formula_weight	57779.2 kDa
EC 编号 ec_number	5.4.99.-
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,C

MADAEVIILPKKHKKKKERKSLPEEDVAEIQHAEEFLIKPESKVAKLDTSQWPLLLKNFDKLNVRTTHYTPLACGSNPLKREIGDYIRTGFINLDKPSNPSSHEVVAWIRRILRVEKTGHSGTLDPKVTGCLIVCIERATRLVKSQQSAGKEYVGIVRLHNAIEGGTQLSRALETLTGALFQRPPLIAAVKRQLRVRTIYESKMIEYDPERRLGIFWVSCEAGTYIRTLCVHLGLLLGVGGQMQELRRVRSGVMSEKDHMVTMHDVLDAQWLYDNHKDESYLRRVVYPLEKLLTSHKRLVMKDSAVNAICYGAKIMLPGVLRYEDGIEVNQEIVVITTKGEAICMAIALMTTAVISTCDHGIVAKIKRVIMERDTYPRKWGLGPKASQKKLMIKQGLLDKHGKPTDSTPATWKQEYVDYSESAKKEVVAEVVKAPQVVAEAAKTAKRKRESESESDETPPAAPQLIKKEKKKSKKDKKAKAGLESGAEPGDGDSDTTKKKKKKKKAKEVELVSE

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3
分子量 formula_weight	7720.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,F

MFLQYYLNEQGDRVYTLKKFDPMGQQTCSAHPARFSPDDKYSRHRITIKKRFKVLMTQQPRPVL

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	RNA (92-MER)
分子量 formula_weight	145477.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	B

GGGUUGCGGAGGGUGGGCCUGGGAGGGGUGGUGGCCAUUUUUUGUCUAACCCUAACUGAGAAGGGCGUAGGCGCCGUGCUUUUGCUCCCCGCGCGCUGUUUUUCUCGCUGACUUUCAGCGGGCGGAAAAGCCUCGGCCUGCCGCCUUCCACCGUUCAUUCUAGAGCAAACAAAAAAUGUCAGCUGCUGGCCCGUUCGCCCCUCCCGGGGACCUGCGGCGGGUCGCCUGCCCAGCCCCCGAACCCCGCCUGGAGGCCGCGGUCGGCCCGGGGCUUCUCCGGAGGCACCCACUGCCACCGCGAAGAGUUGGGCUCUGUCAGCCGCGGGUCUCUCGGGGGCGAGGGCGAGGUUCAGGCCUUUCAGGCCGCAGGAAGAGGAACGGAGCGAGUCCCCGCGCGCGGCGCGAUUCCCUGAGCUGUGGGACGUGCACCCAGGACUCGGCUCACACAUGC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1
分子量 formula_weight	22388.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,D

MSFRGGGRGGFNRGGGGGGFNRGGSSNHFRGGGGGGGGGNFRGGGRGGFGRGGGRGGFNKGQDQGPPERVVLLGEFLHPCEDDIVCKCTTDENKVPYFNAPVYLENKEQIGKVDEIFGQLRDFYFSVKLSENMKASSFKKLQKFYIDPYKLLPLQRFLPRPPGEKGPPRGGGRGGRGGGRGGGGRGGGRGGGFRGGRGGGGGGFRGGRGGGFRGRGH

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2
分子量 formula_weight	17226.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,E

MTKIKADPDGPEAQAEACSGERTYQELLVNQNPIAQPLASRRLTRKLYKCIKKAVKQKQIRRGVKEVQKFVNKGEKGIMVLAGDTLPIEVYCHLPVMCEDRNLPYVYIPSKTDLGAAAGSKRPTCVIMVKPHEEYQEAYDECLEEVQSLPLPL

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.400 Å
最低分辨率 resolution_low	3.400 Å
R 因子 r_factor	0.3045
R_work r_work	0.3045
R_free r_free	—

分辨率 resolution	3.40 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	204665

The H/ACA RNP lobe of human telomerase

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Telomerase Cajal body protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

H/ACA ribonucleoprotein complex subunit DKC1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7bgb__assembly_1__model_1

7bgb__assembly_1__model_1 | I(q)

7bgb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)