7bp2

Structural mechanism directing nucleosome reorganization by NAP1-RELATED PROTEIN 1 (NRP1)

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone H2A.6

Arabidopsis thaliana

UniProt Q9LD28

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Histone H2B.1 × 1 (Q9LQQ4) SULFATE ION × 5 GLYCEROL × 2 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Histone H2B.1 × 1 (Q9LQQ4) SULFATE ION × 5 GLYCEROL × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H2A6_ARATH
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–93; UniProt 14–106 作者链 C; PDB构建体 1–93; UniProt 14–106

Histone H2B.1

Arabidopsis thaliana

UniProt Q9LQQ4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Histone H2A.6 × 1 (Q9LD28) SULFATE ION × 5 GLYCEROL × 2 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Histone H2A.6 × 1 (Q9LD28) SULFATE ION × 5 GLYCEROL × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H2B1_ARATH
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–98; UniProt 51–148 作者链 D; PDB构建体 1–98; UniProt 51–148

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7bp2
沉积日期 deposition_date2020-03-21
结构标题 titleStructural mechanism directing nucleosome reorganization by NAP1-RELATED PROTEIN 1 (NRP1)
关键词 keywordscomplex, Histone, PLANT PROTEIN, NUCLEAR PROTEIN; NUCLEAR PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7bp2__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7bp2__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

7bp2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)17.84 Å
Rg(电子密度)16.44 Å
总 Rg17.59 Å
原子数1406
残基数177
排除体积25256 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7bp2__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 7bp2__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd7bp2a_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.22 — Histone-fold
超家族 Superfamily superfamilya.22.1 — Histone-fold
家族 Family familya.22.1.1 — Nucleosome core histones
结构域编号 domain_idd7bp2b_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.22 — Histone-fold
超家族 Superfamily superfamilya.22.1 — Histone-fold
家族 Family familya.22.1.1 — Nucleosome core histones
结构域编号 domain_idd7bp2c_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.22 — Histone-fold
超家族 Superfamily superfamilya.22.1 — Histone-fold
家族 Family familya.22.1.1 — Nucleosome core histones
结构域编号 domain_idd7bp2d_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.22 — Histone-fold
超家族 Superfamily superfamilya.22.1 — Histone-fold
家族 Family familya.22.1.1 — Nucleosome core histones

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id7bp2B01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Histone, subunit A
结构域编号 domain_id7bp2D01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Histone, subunit A
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7. 引用文献 (1)