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7c81

E30 F-particle in complex with 6C5

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

VP4

物种未注明

UniProt Q33C85

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 360 VP1 × 60 VP2 × 60 VP3 × 60 Light chain × 60 Heavy chain × 60 SPHINGOSINE × 60 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 VP1 × 1 VP2 × 1 VP3 × 1 Light chain × 1 Heavy chain × 1 SPHINGOSINE × 1 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 30 VP1 × 5 VP2 × 5 VP3 × 5 Light chain × 5 Heavy chain × 5 SPHINGOSINE × 5 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 36 VP1 × 6 VP2 × 6 VP3 × 6 Light chain × 6 Heavy chain × 6 SPHINGOSINE × 6 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 VP1 × 1 VP2 × 1 VP3 × 1 Light chain × 1 Heavy chain × 1 SPHINGOSINE × 1 与蛋白数一致
6 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 360 VP1 × 60 VP2 × 60 VP3 × 60 Light chain × 60 Heavy chain × 60 SPHINGOSINE × 60 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
7c80 7c80 7c80 7c80 7c80 7c80 7c81 7c81 7c81 7c81 7c81 7c81

共 30 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q33C85_9ENTO
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 2–69； UniProt 2–69

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7c81
沉积日期 deposition_date2020-05-28
结构标题 titleE30 F-particle in complex with 6C5
关键词 keywordsMAb, 6C5, E30, VIRUS-IMMUNE SYSTEM complex; VIRUS/IMMUNE SYSTEM
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7c81__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7c81__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 1011 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7c81__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）0.00 Å
Rg（电子密度）150.60 Å
总 Rg150.60 Å
原子数570840
残基数74820
排除体积10051000 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7c81__assembly_1__model_1 360-meric （360） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 7c81__assembly_2__model_1 hexameric （6） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 7c81__assembly_3__model_1 30-meric （30） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
4 1 7c81__assembly_4__model_1 36-meric （36） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
5 1 7c81__assembly_5__model_1 hexameric （6） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
6 1 7c81__assembly_6__model_1 360-meric （360） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd7c81a_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family familyb.121.4.1 — Picornaviridae-like VP (VP1, VP2, VP3 and VP4)
结构域编号 domain_idd7c81c_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family familyb.121.4.1 — Picornaviridae-like VP (VP1, VP2, VP3 and VP4)
结构域编号 domain_idd7c81h1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd7c81h2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd7c81l1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd7c81l2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id7c81H01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id7c81L01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
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7. 引用文献 (1)