SAXSdb — 7cgp

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 15	Acylglycerol kinase, mitochondrial × 1 （Q53H12） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29 × 1 （Q9BSF4） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9 × 5 （Q9Y5J7） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim10 × 6 （P62072） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim10 B × 1 （Q9Y5J6） 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TIM22_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–194； UniProt 1–194

Acylglycerol kinase, mitochondrial

Homo sapiens

UniProt Q53H12

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 15	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22 × 1 （Q9Y584） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29 × 1 （Q9BSF4） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9 × 5 （Q9Y5J7） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim10 × 6 （P62072） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim10 B × 1 （Q9Y5J6） 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AGK_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–422； UniProt 1–422

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29

Homo sapiens

UniProt Q9BSF4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 15	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22 × 1 （Q9Y584） Acylglycerol kinase, mitochondrial × 1 （Q53H12） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9 × 5 （Q9Y5J7） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim10 × 6 （P62072） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim10 B × 1 （Q9Y5J6） 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TIM29_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–260； UniProt 1–260

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9

Homo sapiens

UniProt Q9Y5J7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 15	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22 × 1 （Q9Y584） Acylglycerol kinase, mitochondrial × 1 （Q53H12） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29 × 1 （Q9BSF4） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim10 × 6 （P62072） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim10 B × 1 （Q9Y5J6） 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TIM9_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–89； UniProt 1–89 作者链 E； PDB构建体 1–89； UniProt 1–89 作者链 F； PDB构建体 1–89； UniProt 1–89 作者链 K； PDB构建体 1–89； UniProt 1–89 作者链 L； PDB构建体 1–89； UniProt 1–89

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim10

Homo sapiens

UniProt P62072

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 15	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22 × 1 （Q9Y584） Acylglycerol kinase, mitochondrial × 1 （Q53H12） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29 × 1 （Q9BSF4） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9 × 5 （Q9Y5J7） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim10 B × 1 （Q9Y5J6） 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TIM10_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–90； UniProt 1–90 作者链 H； PDB构建体 1–90； UniProt 1–90 作者链 I； PDB构建体 1–90； UniProt 1–90 作者链 M； PDB构建体 1–90； UniProt 1–90 作者链 N； PDB构建体 1–90； UniProt 1–90 作者链 O； PDB构建体 1–90； UniProt 1–90

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim10 B

Homo sapiens

UniProt Q9Y5J6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 15	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22 × 1 （Q9Y584） Acylglycerol kinase, mitochondrial × 1 （Q53H12） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29 × 1 （Q9BSF4） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9 × 5 （Q9Y5J7） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim10 × 6 （P62072） 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	T10B_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7cgp
沉积日期 deposition_date	2020-07-01
结构标题 title	Cryo-EM structure of the human mitochondrial translocase TIM22 complex at 3.7 angstrom.
关键词 keywords	human mitochondrial translocase TIM22 complex, inner membrane, chaperone Tim9/10a, chaperone Tim9/10a/10b, TRANSLOCASE; TRANSLOCASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7cgp__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7cgp__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7cgp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	47.63 Å
Rg（电子密度）	48.28 Å
总 Rg	48.13 Å
原子数	12433
残基数	1569
排除体积	221500 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7cgp__assembly_1__model_1`	pentadecameric （15）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22
分子量 formula_weight	20048.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	12433

MAAAAPNAGGSAPETAGSAEAPLQYSLLLQYLVGDKRQPRLLEPGSLGGIPSPAKSEEQKMIEKAMESCAFKAALACVGGFVLGGAFGVFTAGIDTNVGFDPKDPYRTPTAKEVLKDMGQRGMSYAKNFAIVGAMFSCTECLIESYRGTSDWKNSVISGCITGGAIGFRAGLKAGAIGCGGFAAFSAAIDYYLR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Acylglycerol kinase, mitochondrial
分子量 formula_weight	47196.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.1.107,2.7.1.138,2.7.1.94
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MTVFFKTLRNHWKKTTAGLCLLTWGGHWLYGKHCDNLLRRAACQEAQVFGNQLIPPNAQVKKATVFLNPAACKGKARTLFEKNAAPILHLSGMDVTIVKTDYEGQAKKLLELMENTDVIIVAGGDGTLQEVVTGVLRRTDEATFSKIPIGFIPLGETSSLSHTLFAESGNKVQHITDATLAIVKGETVPLDVLQIKGEKEQPVFAMTGLRWGSFRDAGVKVSKYWYLGPLKIKAAHFFSTLKEWPQTHQASISYTGPTERPPNEPEETPVQRPSLYRRILRRLASYWAQPQDALSQEVSPEVWKDVQLSTIELSITTRNNQLDPTSKEDFLNICIEPDTISKGDFITIGSRKVRNPKLHVEGTECLQASQCTLLIPEGAGGSFSIDSEEYEAMPVEVKLLPRKLQFFCDPRKREQMLTSPTQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29
分子量 formula_weight	29272.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MAAAALRRFWSRRRAEAGDAVVAKPGVWARLGSWARALLRDYAEACRDASAEARARPGRAAVYVGLLGGAAACFTLAPSEGAFEEALLEASGTLLLLAPATRNRESEAFVQRLLWLRGRGRLRYVNLGLCSLVYEAPFDAQASLYQARCRYLQPRWTDFPGRVLDVGFVGRWWVLGAWMRDCDINDDEFLHLPAHLRVVGPQQLHSETNERLFDEKYKPVVLTDDQVDQALWEEQVLQKEKKDRLALSQAHSLVQAEAPR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9
分子量 formula_weight	10391.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,E,F,K,L

MAAQIPESDQIKQFKEFLGTYNKLTETCFLDCVKDFTTREVKPEETTCSEHCLQKYLKMTQRISMRFQEYHIQQNEALAAKAGLLGQPR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim10
分子量 formula_weight	10349.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H,I,M,N,O

MDPLRAQQLAAELEVEMMADMYNRMTSACHRKCVPPHYKEAELSKGESVCLDRCVSKYLDIHERMGKKLTELSMQDEELMKRVQQSSGPA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim10 B
分子量 formula_weight	11601.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MERQQQQQQQLRNLRDFLLVYNRMTELCFQRCVPSLHHRALDAEEEACLHSCAGKLIHSNHRLMAAYVQLMPALVQRRIADYEAASAVPGVAAEQPGVSPSGS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine
分子量 formula_weight	744.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	7cgpJ01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	810 — Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim13 like domains

结构域编号 domain_id	7cgpL01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	810 — Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim13 like domains

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.70 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	482959

Cryo-EM structure of the human mitochondrial translocase TIM22 complex at 3.7 angstrom.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Acylglycerol kinase, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim10

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim10 B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7cgp__assembly_1__model_1

7cgp__assembly_1__model_1 | I(q)

7cgp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 7 Entity 7 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains