7ewk

Barley photosystem I-LHCI-Lhca6 supercomplex

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 15	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （S4Z289） Photosystem I iron-sulfur center × 1 Photosystem I reaction center subunit D × 1 Photosystem I reaction center subunit E × 1 Photosystem I reaction center subunit F × 1 Photosystem I reaction center subunit H × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （S4Z1D9） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （S4Z1E9） Photosystem I reaction center subunit K × 1 Photosystem I reaction center subunit L × 1 Chlorophyll a-b binding protein Lhca1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein Lhca3 × 1 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 （Q9LKC7） Chlorophyll a-b binding protein Lhca6 × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 137 PHYLLOQUINONE × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 BETA-CAROTENE × 25 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 2 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 2 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 6 CHLOROPHYLL B × 11 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	S4Z1K7_HORVS
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–742； UniProt 9–750

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

物种未注明

UniProt S4Z289

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 15	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （S4Z1K7） Photosystem I iron-sulfur center × 1 Photosystem I reaction center subunit D × 1 Photosystem I reaction center subunit E × 1 Photosystem I reaction center subunit F × 1 Photosystem I reaction center subunit H × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （S4Z1D9） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （S4Z1E9） Photosystem I reaction center subunit K × 1 Photosystem I reaction center subunit L × 1 Chlorophyll a-b binding protein Lhca1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein Lhca3 × 1 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 （Q9LKC7） Chlorophyll a-b binding protein Lhca6 × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 137 PHYLLOQUINONE × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 BETA-CAROTENE × 25 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 2 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 2 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 6 CHLOROPHYLL B × 11 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	S4Z289_HORVS
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–733； UniProt 2–734

Photosystem I reaction center subunit VIII

物种未注明

UniProt S4Z1D9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 15	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （S4Z1K7） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （S4Z289） Photosystem I iron-sulfur center × 1 Photosystem I reaction center subunit D × 1 Photosystem I reaction center subunit E × 1 Photosystem I reaction center subunit F × 1 Photosystem I reaction center subunit H × 1 Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （S4Z1E9） Photosystem I reaction center subunit K × 1 Photosystem I reaction center subunit L × 1 Chlorophyll a-b binding protein Lhca1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein Lhca3 × 1 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 （Q9LKC7） Chlorophyll a-b binding protein Lhca6 × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 137 PHYLLOQUINONE × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 BETA-CAROTENE × 25 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 2 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 2 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 6 CHLOROPHYLL B × 11 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	S4Z1D9_HORVS
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–30； UniProt 5–34

Photosystem I reaction center subunit IX

物种未注明

UniProt S4Z1E9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 15	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （S4Z1K7） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （S4Z289） Photosystem I iron-sulfur center × 1 Photosystem I reaction center subunit D × 1 Photosystem I reaction center subunit E × 1 Photosystem I reaction center subunit F × 1 Photosystem I reaction center subunit H × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （S4Z1D9） Photosystem I reaction center subunit K × 1 Photosystem I reaction center subunit L × 1 Chlorophyll a-b binding protein Lhca1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein Lhca3 × 1 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 （Q9LKC7） Chlorophyll a-b binding protein Lhca6 × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 137 PHYLLOQUINONE × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 BETA-CAROTENE × 25 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 2 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 2 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 6 CHLOROPHYLL B × 11 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	S4Z1E9_HORVS
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–42； UniProt 1–42

Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q9LKC7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 15	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （S4Z1K7） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （S4Z289） Photosystem I iron-sulfur center × 1 Photosystem I reaction center subunit D × 1 Photosystem I reaction center subunit E × 1 Photosystem I reaction center subunit F × 1 Photosystem I reaction center subunit H × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （S4Z1D9） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （S4Z1E9） Photosystem I reaction center subunit K × 1 Photosystem I reaction center subunit L × 1 Chlorophyll a-b binding protein Lhca1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein Lhca3 × 1 Chlorophyll a-b binding protein Lhca6 × 1 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CHLOROPHYLL A × 137 PHYLLOQUINONE × 2 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 BETA-CAROTENE × 25 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 2 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 2 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 6 CHLOROPHYLL B × 11 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9LKC7_HORVU
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 4； PDB构建体 1–197； UniProt 29–225

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7ewk
沉积日期 deposition_date	2021-05-25
结构标题 title	Barley photosystem I-LHCI-Lhca6 supercomplex
关键词 keywords	Photosystem I, Light-harvesting complex, Lhca6, cyclic electron transport, Photosynthesis; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7ewk__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7ewk__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7ewk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	51.80 Å
Rg（电子密度）	51.37 Å
总 Rg	51.55 Å
原子数	32765
残基数	3110
排除体积	601800 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7ewk__assembly_1__model_1`	pentadecameric （15）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (26)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1
分子量 formula_weight	82292.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	32765

EVKIVVDRDPVKTSFEEWARPGHFSRTLAKGPDTTTWIWNLHADAHDFDSHTGDLEEISRKVFSAHFGQLSIIFLWLSGMYFHGARFSNYEAWLSDPTHIGPSAQVVWPIVGQEILNGDVGGGFRGIQITSGFFQLWRASGITSELQLYCTAIGALVFAALMLFAGWFHYHKAAPKLAWFQDVESMLNHHLAGLLGLGSLSWAGHQIHVSLPINQFLDAGVDPKEIPLPHEFILNRDLLAQLYPSFAEGATPFFTLNWSKYAEFLTFRGGLDPVTGGLWLTDIAHHHLAIAILFLIAGHMYRTNWGIGHGLKDILEAHKGPFTGQGHKGLYEILTTSWHAQLSLNLAMLGSTTIVVAHHMYSMPPYPYLATDYGTQLSLFTHHMWIGGFLIVGAAAHAAIFMVRDYDPTTRYNDLLDRVLRHRDAIISHLNWVCIFLGFHSFGLYIHNDTMSALGRPQDMFSDTAIQLQPIFAQWVQNIHATAPGVTAPGATTSTSLTWGGGELVAVGGKVALLPIPLGTADFLVHHIHAFTIHVTVLILLKGVLFARSSRLIPDKANLGFRFPCDGPGRGGTCQVSAWDHVFLGLFWMYNAISVVIFHFSWKMQSDVWGTISDQGVVTHITGGNFAQSSITINGWLRDFLWAQASQVIQSYGSSLSAYGLFFLGAHFVWAFSLMFLFSGRGYWQELIESIVWAHNKLKVAPATQPRALSIIQGRAVGVTHYLLGGIATTWAFFLARIIAVG

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2
分子量 formula_weight	82562.7 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

ELRFPRFSQGLAQDPTTRRIWFGIATAHDFESHDDITEERLYQNIFASHFGQLAIIFLWTSGNLFHVAWQGNFESWIQDPLHVRPIAHAIWDPHFGQPAVEAFTRGGAAGPVNIAYSGVYQWWYTIGLRTNEDLYTGALFLLFLSTLSLIASWLHLQPKWKPSLSWFKNAESRLNHHLSGLFGVSSLAWTGHLVHVAIPASRGEYVRWNNFLDVLPYPQGLGPLLTGQWNLYAQNPDSSNHLFGTAQGAGTAILTLLGGFHPQTQSLWLTDMAHHHLAIAFIFLIAGHMYRTNFGIGHSIKDLLEAHTPPGGRLGRGHKGLYDTINNSIHFQLGLALASLGVITSLVAQHMYSLPPYAFIAQDFTTQAALYTHHQYIAGFIMTGAFAHGAIFFIRDYNPEQNEDNVLARMLDHKEAIISHLSWASLFLGFHTLGLYVHNDVMLAFGTPEKQILIEPIFAQWIQSAHGKTTYGFDILLSSTNGPAFNAGRSLWLPGWLNAVNENSNSLFLTIGPGDFLVHHAIALGLHTTTLILVKGALDARGSKLMPDKKDFGYSFPCDGPGRGGTCDISAWDAFYLAVFWMLNTIGWVTFYWHWKHITLWQGNVSQFNESSTYLMGWLRDYLWLNSSQLINGYNPFGMNSLSVWAWMFLFGHLVWATGFMFLISWRGYWQELIETLAWAHERTPLANLIRWRDKPVALSIVQARLVGLAHFSVGYIFTYAAFLIASTSGKFG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Photosystem I iron-sulfur center
分子量 formula_weight	8909.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSHSVKIYDTCIGCTQCVRACPTDVLEMIPWDGCKAKQIASAPRTEDCVGCKRCESACPTDFLSVRVYLGPETTRSMALSY

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit D
分子量 formula_weight	15801.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

GFVPPQLDPSTPSPIFGGSTGGLLRKAQVEEFYVITWTSPKEQVFEMPTGGAAIMREGPNLLKLARKEQCLALGNRLRSKYKIAYQFYRVFPNGEVQYLHPKDGVYPEKVNAGRQGVGQNFRSIGKNVSPIEVKFTGKNSFD

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit E
分子量 formula_weight	7679.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

KPPPRGPKRGTKVKILRRESYWYNGTGSVVTVDQDPNTRYPVVVRFAKVNYAGVSTNNYALDEIKEVA

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit F
分子量 formula_weight	17488.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

DIAGLTPCKESKAFAKREKQSVKKLNSSLKKYAPDSAPALAIQATIDKTKRRFENYGKFGLLCGSDGLPHLIVSGDQRHWGEFITPGVLFLYIAGWIGWVGRSYLIAVSGEKKPAMREIIIDVELAARIIPRGFIWPVAAYRELINGDLVVDDADIGY

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit H
分子量 formula_weight	6431.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

LQSKFFNTFAAPFTKRGLLLKFLLIGGGSLVAYVSASASPDLLPIKKGPQLPPTPGPRGKI

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit VIII
分子量 formula_weight	3338.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

NLPSIFVPLVGLVFPAIAMTSLFLYVQKKK

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit IX
分子量 formula_weight	4747.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MRDIKTYLSVAPVLSTLWFGALAGLLIEINRLFPDALSFPFF

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit K
分子量 formula_weight	8502.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

YIGSSTNLIMVTTTTLMLFAGRFGLAPSANRKATAGLKLEARESGLQTGDPAGFTLADTLACGAVGHIMGVGIVLGLKNTGVLD

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit L
分子量 formula_weight	15512.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

SLETPVTSSPLVAWYLSNLPAYRTAVSPLLRGIEVGLAHGYLLVGPFALTGPLRNTPVHGQAGTLGAIGLVSILSVCLTMYGVASFNEGEPSTAPVLTLTGRKKEADKLQTAEGWSQFTGGFFFGGVSGAVWAYFLLYVLDLPYFF

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein Lhca1
分子量 formula_weight	21278.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1

EWFPGQPRPAHLDGSSPGDFGFDPLGLATVPENFERFKESEIYHCRWAMLCVPGVLVPEALGLGNWVKAQEWAALPDGQATYLGNPVPWGNLPTILAIEFLAIAFAEQQRTMEKDPEKKKYPGGAFDPLGFSKDPAKFEELKLKEIKNGRLAMLAFVGFCVQQSAYPGTGPLENLATHLADPWHNNIGDIVIP

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein Lhca3
分子量 formula_weight	24395.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3

RQLWFASKQSLTYLDGTLPGDFGFDPLGLSDPEGTGGFIEPRWLAYGEIFNGRTAMMGVVGMIAPEALGKVGLVPPETAIPWFQAGAIPPAGTYQYWADPYTLFVFEMALIGFAEHRRLQDWYNPGSMGKQYFLGLEKYLGGSGDPAYPGGPIFNPLGFGTKSEKEMKELKLKEIKNGRLAMLAFLGMSLQAIFTGVGPFQNLLDHLSDPVNNNILTSLKFH

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
分子量 formula_weight	21976.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4

KGSWLPGLQSPAYLDGSLAGDNGFDPLALAEDPEDLRWFVQAELVNGRWAMLGVAGMLIPEVLTKAGLLNAPEWYDAGKETYFASSSTLFVIEFILFHYVEIRRWQDIKNPGSVNQDPIFKSYSLPPHECGYPGSVFNPLNFAPTLENKEKELANGRLAMLAFLGFLVQHNVTGKGPFENLQQHLADPWHNTIIQTI

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein Lhca6
分子量 formula_weight	23904.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	6

TVCEPLGPDRPVWFPGTAPPPWLDGSLPGDFGFDPLGFGSEPESLRWFAQAELMHGRWAMLAVAGILIPEILQKWGFMEEFSWYTAGEREYFADPWTLFVTQMALMGWVEGRRWMDYLNPGSVDIEPRFPNRKNPTPDVGYPGGLWFDWGNWGRGSPEPVMVLRTKEIKNGRLAMLAFVGFWFQVVYTGQGPLDNLFAHLADPGHCNIFSA

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A ISOMER
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	137

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	PHYLLOQUINONE
分子量 formula_weight	450.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	BETA-CAROTENE
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	25

实体 21 Entity 21 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 22 Entity 22 non-polymer

描述 description	DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
分子量 formula_weight	949.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 23 Entity 23 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	(3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL
分子量 formula_weight	568.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 25 Entity 25 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL B
分子量 formula_weight	907.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	11

实体 26 Entity 26 non-polymer

描述 description	;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ;
分子量 formula_weight	600.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id	7ewk101
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

结构域编号 domain_id	7ewk301
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

结构域编号 domain_id	7ewk401
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

结构域编号 domain_id	7ewk601
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3460 — Chlorophyll a-b binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll a/b binding protein domain

结构域编号 domain_id	7ewkL01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1240 — Photosystem 1 Reaction Centre Subunit Xi; Chain: L;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.88 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	103844

Barley photosystem I-LHCI-Lhca6 supercomplex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit VIII

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit IX

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7ewk__assembly_1__model_1

7ewk__assembly_1__model_1 | I(q)

7ewk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (26)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

实体 9 Entity 9 polymer

聚合物 Polymer

实体 10 Entity 10 polymer

聚合物 Polymer

实体 11 Entity 11 polymer

聚合物 Polymer

实体 12 Entity 12 polymer

聚合物 Polymer

实体 13 Entity 13 polymer

聚合物 Polymer

实体 14 Entity 14 polymer

聚合物 Polymer