SAXSdb — 7f4s

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MT-a70 family protein

Tetrahymena thermophila SB210

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MTA9 × 1 （A0E887） water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MTA9 × 1 （A0E887） water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MTA9 × 1 （A0E887） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q22GC0_TETTS
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–202； UniProt 227–428 作者链 B； PDB构建体 1–202； UniProt 227–428 作者链 C； PDB构建体 1–202； UniProt 227–428

MTA9

Paramecium tetraurelia strain d4-2

UniProt A0E887

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MT-a70 family protein × 1 （Q22GC0） water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MT-a70 family protein × 1 （Q22GC0） water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MT-a70 family protein × 1 （Q22GC0） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0E887_PARTE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–237； UniProt 66–302 作者链 E； PDB构建体 1–237； UniProt 66–302 作者链 F； PDB构建体 1–237； UniProt 66–302

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7f4s
沉积日期 deposition_date	2021-06-21
结构标题 title	Crystal structure of TthMTA1-PteMTA9 complex
关键词 keywords	Protein Complex, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7f4s__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7f4s__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7f4s__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	23.76 Å
Rg（电子密度）	22.46 Å
总 Rg	23.39 Å
原子数	3054
残基数	393
排除体积	54493 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7f4s__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`7f4s__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`7f4s__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	MT-a70 family protein
分子量 formula_weight	23113.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	9145

MVPDNSIPICSDVTKLNFQALIDAQMRHAGKMFDVIMMDPPWQLSSSQPSRGVAIAYDSLSDEKIQNMPIQSLQQDGFIFVWAINAKYRVTIKMIENWGYKLVDEITWVKKTVNGKIAKGHGFYLQHAKESCLIGVKGDVDNGRFKKNIASDVIFSERRGQSQKPEEIYQYINQLCPNGNYLEIFARRNNLHDNWVSIGNEL

来源 Source

来源生物 organism	Tetrahymena thermophila SB210
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	312017
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	MTA9
分子量 formula_weight	27627.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,E,F

DKVTCDNLEVLLQWKGSINCQSYETDQKKIVVLKKILGTDLSQYAKGVQGIFIDNLFKKDLKNLDISKKLISNGILFIWSDKSLINEILETMENKGFTYIENLVVVQLSLEQALEELNKHMKIEQTEDAVLDNLDFLQQKVQVKDLILHRPSKVLNQSKQVLIMFRKFDEQKSQLELRHQRTPDVLFDIVNNGKSCLKTKEYIYQTIETLLPKSQLMEIFAQKDQPRKGWISVCENK

来源 Source

来源生物 organism	Paramecium tetraurelia strain d4-2
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	412030
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	212

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	7f4sA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Vaccinia Virus protein VP39

结构域编号 domain_id	7f4sB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Vaccinia Virus protein VP39

结构域编号 domain_id	7f4sC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Vaccinia Virus protein VP39

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晶胞边长 a length_a	75.699 Å
晶胞边长 b length_b	75.647 Å
晶胞边长 c length_c	142.471 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	99.16 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	monoclinic

分辨率 resolution	3.090 Å
最低分辨率 resolution_low	44.930 Å
R 因子 r_factor	0.3047
R_work r_work	0.3037
R_free r_free	0.3156

Crystal structure of TthMTA1-PteMTA9 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MT-a70 family protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

MTA9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7f4s__assembly_1__model_1

7f4s__assembly_1__model_1 | I(q)

7f4s__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of TthMTA1-PteMTA9 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MT-a70 family protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

MTA9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7f4s__assembly_1__model_1

7f4s__assembly_1__model_1 | I(q)

7f4s__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)