7fzv

Crystal Structure of human FABP4 in complex with 1-[(2,4-dichlorophenyl)methyl]-4-hydroxy-3-[(E)-3-phenylprop-2-enyl]pyridin-2-one, i.e. SMILES C1(=C(C=CN(C1=O)Cc1c(cc(cc1)Cl)Cl)O)C/C=C/c1ccccc1 with IC50=0.557 microM

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fatty acid-binding protein, adipocyte

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	SULFATE ION × 2 1-[(2,4-dichlorophenyl)methyl]-4-hydroxy-3-[(2E)-3-phenylprop-2-en-1-yl]pyridin-2(1H)-one × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白单体	单体	蛋白 1	SULFATE ION × 4 1-[(2,4-dichlorophenyl)methyl]-4-hydroxy-3-[(2E)-3-phenylprop-2-en-1-yl]pyridin-2(1H)-one × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FABP4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–135； UniProt 1–132 作者链 B； PDB构建体 4–135； UniProt 1–132

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7fzv
沉积日期 deposition_date	2023-04-27
结构标题 title	Crystal Structure of human FABP4 in complex with 1-[(2,4-dichlorophenyl)methyl]-4-hydroxy-3-[(E)-3-phenylprop-2-enyl]pyridin-2-one, i.e. SMILES C1(=C(C=CN(C1=O)Cc1c(cc(cc1)Cl)Cl)O)C/C=C/c1ccccc1 with IC50=0.557 microM
关键词 keywords	LIPID BINDING PROTEIN, FATTY ACID BINDING PROTEIN, CYTOPLASM, LIPID-BINDING, TRANSPORT, PROTEIN BINDING; LIPID BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7fzv__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7fzv__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7fzv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	15.63 Å
Rg（电子密度）	14.23 Å
总 Rg	15.47 Å
原子数	1086
残基数	135
排除体积	19373 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7fzv__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`7fzv__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Fatty acid-binding protein, adipocyte
分子量 formula_weight	15022.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	2188

GSHMCDAFVGTWKLVSSENFDDYMKEVGVGFATRKVAGMAKPNMIISVNGDVITIKSESTFKNTEISFILGQEFDEVTADDRKVKSTITLDGGVLVHVQKWDGKSTTIKRKREDDKLVVECVMKGVTSTRVYERA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1-[(2,4-dichlorophenyl)methyl]-4-hydroxy-3-[(2E)-3-phenylprop-2-en-1-yl]pyridin-2(1H)-one
分子量 formula_weight	386.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	7fzvA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Calycin beta-barrel core domain

结构域编号 domain_id	7fzvB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Calycin beta-barrel core domain

▶

晶胞边长 a length_a	137.496 Å
晶胞边长 b length_b	137.496 Å
晶胞边长 c length_c	137.496 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	48

空间群 space_group	P 4 3 2
空间群编号 int_tables_number	207
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.550 Å
最低分辨率 resolution_low	45.830 Å
R 因子 r_factor	0.1983
R_work r_work	0.1954
R_free r_free	0.2517

Crystal Structure of human FABP4 in complex with 1-[(2,4-dichlorophenyl)methyl]-4-hydroxy-3-[(E)-3-phenylprop-2-enyl]pyridin-2-one, i.e. SMILES C1(=C(C=CN(C1=O)Cc1c(cc(cc1)Cl)Cl)O)C/C=C/c1ccccc1 with IC50=0.557 microM

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fatty acid-binding protein, adipocyte

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7fzv__assembly_1__model_1

7fzv__assembly_1__model_1 | I(q)

7fzv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal Structure of human FABP4 in complex with 1-[(2,4-dichlorophenyl)methyl]-4-hydroxy-3-[(E)-3-phenylprop-2-enyl]pyridin-2-one, i.e. SMILES C1(=C(C=CN(C1=O)Cc1c(cc(cc1)Cl)Cl)O)C/C=C/c1ccccc1 with IC50=0.557 microM

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fatty acid-binding protein, adipocyte

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7fzv__assembly_1__model_1

7fzv__assembly_1__model_1 | I(q)

7fzv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)