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7g00

Crystal Structure of human FABP1 in complex with 2-[[3-(5-tert-butyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophen-2-yl]carbamoyl]cyclopentene-1-carboxylic acid

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fatty acid-binding protein, liver

Homo sapiens

UniProt P07148

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 2-{[(3P)-3-(5-tert-butyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophen-2-yl]carbamoyl}cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 THIOCYANATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
10 蛋白单体 单体 蛋白 1 2-{[(3P)-3-(5-tert-butyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophen-2-yl]carbamoyl}cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 THIOCYANATE ION × 2 water × 1 与蛋白数一致
11 蛋白单体 单体 蛋白 1 2-{[(3P)-3-(5-tert-butyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophen-2-yl]carbamoyl}cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 water × 1 与蛋白数一致
12 蛋白单体 单体 蛋白 1 2-{[(3P)-3-(5-tert-butyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophen-2-yl]carbamoyl}cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 THIOCYANATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
13 蛋白单体 单体 蛋白 1 2-{[(3P)-3-(5-tert-butyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophen-2-yl]carbamoyl}cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 THIOCYANATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
14 蛋白单体 单体 蛋白 1 2-{[(3P)-3-(5-tert-butyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophen-2-yl]carbamoyl}cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 THIOCYANATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
15 蛋白单体 单体 蛋白 1 2-{[(3P)-3-(5-tert-butyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophen-2-yl]carbamoyl}cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 THIOCYANATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
16 蛋白单体 单体 蛋白 1 2-{[(3P)-3-(5-tert-butyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophen-2-yl]carbamoyl}cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 THIOCYANATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 2-{[(3P)-3-(5-tert-butyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophen-2-yl]carbamoyl}cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 THIOCYANATE ION × 2 water × 1 与蛋白数一致
3 蛋白单体 单体 蛋白 1 2-{[(3P)-3-(5-tert-butyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophen-2-yl]carbamoyl}cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 water × 1 与蛋白数一致
4 蛋白单体 单体 蛋白 1 2-{[(3P)-3-(5-tert-butyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophen-2-yl]carbamoyl}cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 THIOCYANATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
5 蛋白单体 单体 蛋白 1 2-{[(3P)-3-(5-tert-butyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophen-2-yl]carbamoyl}cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 THIOCYANATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
6 蛋白单体 单体 蛋白 1 2-{[(3P)-3-(5-tert-butyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophen-2-yl]carbamoyl}cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 THIOCYANATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
7 蛋白单体 单体 蛋白 1 2-{[(3P)-3-(5-tert-butyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophen-2-yl]carbamoyl}cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 THIOCYANATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
8 蛋白单体 单体 蛋白 1 2-{[(3P)-3-(5-tert-butyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophen-2-yl]carbamoyl}cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 THIOCYANATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致
9 蛋白单体 单体 蛋白 1 2-{[(3P)-3-(5-tert-butyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophen-2-yl]carbamoyl}cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 THIOCYANATE ION × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
2f73 2f73 2f73 2f73 2f73 2f73 2f73 2f73 2l67 2l68 2lkk 2py1

共 63 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源二聚体
6mp4 6mp4 6mp4 6mp4 7dze 7dzf 7dzg 7dzh 7dzi 7dzj 7dzk 7dzl

共 12 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物

暂无

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FABPL_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 4–130； UniProt 1–127 作者链 B； PDB构建体 4–130； UniProt 1–127 作者链 C； PDB构建体 4–130； UniProt 1–127 作者链 D； PDB构建体 4–130； UniProt 1–127 作者链 E； PDB构建体 4–130； UniProt 1–127 作者链 F； PDB构建体 4–130； UniProt 1–127 作者链 G； PDB构建体 4–130； UniProt 1–127 作者链 H； PDB构建体 4–130； UniProt 1–127 作者链 I； PDB构建体 4–130； UniProt 1–127 作者链 J； PDB构建体 4–130； UniProt 1–127 作者链 K； PDB构建体 4–130； UniProt 1–127 作者链 L； PDB构建体 4–130； UniProt 1–127 作者链 M； PDB构建体 4–130； UniProt 1–127 作者链 N； PDB构建体 4–130； UniProt 1–127 作者链 O； PDB构建体 4–130； UniProt 1–127 作者链 P； PDB构建体 4–130； UniProt 1–127

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7g00
沉积日期 deposition_date2023-04-27
结构标题 titleCrystal Structure of human FABP1 in complex with 2-[[3-(5-tert-butyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophen-2-yl]carbamoyl]cyclopentene-1-carboxylic acid
关键词 keywordsLIPID BINDING PROTEIN, FATTY ACID BINDING PROTEIN, CYTOPLASM, LIPID-BINDING, TRANSPORT, PROTEIN BINDING; LIPID BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7g00__assembly_8__model_1

Assembly 8 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7g00__assembly_8__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7g00__assembly_8__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）15.34 Å
Rg（电子密度）14.01 Å
总 Rg15.23 Å
原子数1047
残基数130
排除体积18843 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7g00__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 7g00__assembly_2__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 7g00__assembly_3__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 7g00__assembly_4__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
5 1 7g00__assembly_5__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
6 1 7g00__assembly_6__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
7 1 7g00__assembly_7__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
8 1 7g00__assembly_8__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
9 1 7g00__assembly_9__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
10 1 7g00__assembly_10__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
11 1 7g00__assembly_11__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
12 1 7g00__assembly_12__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
13 1 7g00__assembly_13__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
14 1 7g00__assembly_14__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
15 1 7g00__assembly_15__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
16 1 7g00__assembly_16__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id7g00A01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Calycin beta-barrel core domain
结构域编号 domain_id7g00B01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Calycin beta-barrel core domain
结构域编号 domain_id7g00C01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Calycin beta-barrel core domain
结构域编号 domain_id7g00D01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Calycin beta-barrel core domain
结构域编号 domain_id7g00E01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Calycin beta-barrel core domain
结构域编号 domain_id7g00F01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Calycin beta-barrel core domain
结构域编号 domain_id7g00G01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Calycin beta-barrel core domain
结构域编号 domain_id7g00H01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Calycin beta-barrel core domain
结构域编号 domain_id7g00I01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Calycin beta-barrel core domain
结构域编号 domain_id7g00J01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Calycin beta-barrel core domain
结构域编号 domain_id7g00K01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Calycin beta-barrel core domain
结构域编号 domain_id7g00L01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Calycin beta-barrel core domain
结构域编号 domain_id7g00M01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Calycin beta-barrel core domain
结构域编号 domain_id7g00N01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Calycin beta-barrel core domain
结构域编号 domain_id7g00O01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Calycin beta-barrel core domain
结构域编号 domain_id7g00P01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Calycin beta-barrel core domain
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7. 引用文献 (1)