7h6h

THE 1.94 A CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN CATHEPSIN G IN COMPLEX WITH 1-[(7-fluoronaphthalen-1-yl)methyl]-3-[[methoxycarbonyl(methyl)amino]methyl]indole-2-carboxylic acid

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 57.8 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cathepsin G

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 21–255	突变：NO	ZN ZINC ION × 1 A1AO6 1-[(7-fluoronaphthalen-1-yl)methyl]-3-{[(methoxycarbonyl)(methyl)amino]methyl}-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：MICROBATCH；pH 7.5；293 K；0.2 M LiSO4 (Salt), 25 %w/v PEG3350 (Precipitant), 0.1 M HEPES 7.5 pH (Buffer), Protein was at 17 mg/mL.	分辨率 1.94 Å R-free 0.232

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7H6H	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AU8 HUMAN CATHEPSIN G 提交 1997-09-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–244（224 aa）	未记录	0H8 N-(3-carboxypropanoyl)-L-valyl-N-[(1R)-5-amino-1-phosphonopentyl]-L-prolinamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 1.90 Å R-free 0.251
1CGH Human cathepsin G 提交 1996-06-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–244（224 aa）	未记录	1ZG N-(3-carboxypropanoyl)-L-valyl-N-{(1R)-1-[(S)-hydroxy(oxido)phosphanyl]-2-phenylethyl}-L-prolinamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 1.80 Å R-free 0.240
1KYN Cathepsin-G 提交 2002-02-05	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–255（235 aa）	未记录	KTP (2-NAPHTHALEN-2-YL-1-NAPHTHALEN-1-YL-2-OXO-ETHYL)-PHOSPHONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；ammonium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 3.50 Å R-free 0.328
1KYN Cathepsin-G 提交 2002-02-05	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 21–255（235 aa）	未记录	KTP (2-NAPHTHALEN-2-YL-1-NAPHTHALEN-1-YL-2-OXO-ETHYL)-PHOSPHONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；ammonium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 3.50 Å R-free 0.328
1T32 A Dual Inhibitor of the Leukocyte Proteases Cathepsin G and Chymase with Therapeutic Efficacy in Animals Models of Inflammation 提交 2004-04-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–244（224 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 5 OHH 2-[3-({METHYL[1-(2-NAPHTHOYL)PIPERIDIN-4-YL]AMINO}CARBONYL)-2-NAPHTHYL]-1-(1-NAPHTHYL)-2-OXOETHYLPHOSPHONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；296 K；PEG 4000, Sodium Hepes, sodium acetate, ammonium sulfate, 2-propanol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 296.0K	分辨率 1.85 Å R-free 0.213
6VTM Human Cathepsin-G Inhibited by S. aureus EapH1 提交 2020-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–244（224 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 25% w/v PEG3350	分辨率 1.60 Å R-free 0.209
6VTM Human Cathepsin-G Inhibited by S. aureus EapH1 提交 2020-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 21–244（224 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 25% w/v PEG3350	分辨率 1.60 Å R-free 0.209
6VTM Human Cathepsin-G Inhibited by S. aureus EapH1 提交 2020-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 21–244（224 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 25% w/v PEG3350	分辨率 1.60 Å R-free 0.209
6VTM Human Cathepsin-G Inhibited by S. aureus EapH1 提交 2020-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 21–244（224 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 25% w/v PEG3350	分辨率 1.60 Å R-free 0.209
7H6G THE 1.21 A CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN CATHEPSIN G IN COMPLEX WITH N-[2-[6-fluoro-2-[(4-hydroxy-5-methyl-2-oxo-5-phenylfuran-3-yl)-phenylmethyl]-1H-indol-3-yl]ethyl]acetamide 提交 2024-04-19	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–255（235 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 3 A1AOS N-(2-{6-fluoro-2-[(R)-[(5R)-4-hydroxy-5-methyl-2-oxo-5-phenyl-2,5-dihydrofuran-3-yl](phenyl)methyl]-1H-indol-3-yl}ethyl)acetamide × 1 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；293 K；0.2 M LiSO4 (Salt), 25 %w/v PEG3350 (Precipitant), 0.1 M HEPES 7.5 pH (Buffer), Protein was at 17 mg/mL.	分辨率 1.21 Å R-free 0.181
7H6G THE 1.21 A CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN CATHEPSIN G IN COMPLEX WITH N-[2-[6-fluoro-2-[(4-hydroxy-5-methyl-2-oxo-5-phenylfuran-3-yl)-phenylmethyl]-1H-indol-3-yl]ethyl]acetamide 提交 2024-04-19	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 21–255（235 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 A1AOS N-(2-{6-fluoro-2-[(R)-[(5R)-4-hydroxy-5-methyl-2-oxo-5-phenyl-2,5-dihydrofuran-3-yl](phenyl)methyl]-1H-indol-3-yl}ethyl)acetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；293 K；0.2 M LiSO4 (Salt), 25 %w/v PEG3350 (Precipitant), 0.1 M HEPES 7.5 pH (Buffer), Protein was at 17 mg/mL.	分辨率 1.21 Å R-free 0.181
8D4S Crystal Structure of Cathepsin G Inhibited by Eap1 from S. aureus 提交 2022-06-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–243（223 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M BisTris (pH 5.5), 0.2M Magnesium Chloride, 25% (w/v) PEG-3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.261
8D4S Crystal Structure of Cathepsin G Inhibited by Eap1 from S. aureus 提交 2022-06-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 21–243（223 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M BisTris (pH 5.5), 0.2M Magnesium Chloride, 25% (w/v) PEG-3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.261
8D4S Crystal Structure of Cathepsin G Inhibited by Eap1 from S. aureus 提交 2022-06-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 21–243（223 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M BisTris (pH 5.5), 0.2M Magnesium Chloride, 25% (w/v) PEG-3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.261
8D4S Crystal Structure of Cathepsin G Inhibited by Eap1 from S. aureus 提交 2022-06-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 21–243（223 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M BisTris (pH 5.5), 0.2M Magnesium Chloride, 25% (w/v) PEG-3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.261
8D4V Crystal Structure of Cathepsin G Inhibited by Eap2 from S. aureus 提交 2022-06-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–243（223 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M BisTris (pH 6.5), 0.2M Ammonium Sulfate, 25%(w/v) PEG-3350	分辨率 1.85 Å R-free 0.251
8D4V Crystal Structure of Cathepsin G Inhibited by Eap2 from S. aureus 提交 2022-06-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 21–243（223 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M BisTris (pH 6.5), 0.2M Ammonium Sulfate, 25%(w/v) PEG-3350	分辨率 1.85 Å R-free 0.251
8D7I Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap1 from S. aureus 提交 2022-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 21–243（223 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；0.1M BisTris, 0.2M sodium/potassium tartrate, 14% PEG-8000	分辨率 3.63 Å R-free 0.217
8D7I Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap1 from S. aureus 提交 2022-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 21–243（223 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；0.1M BisTris, 0.2M sodium/potassium tartrate, 14% PEG-8000	分辨率 3.63 Å R-free 0.217
8D7I Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap1 from S. aureus 提交 2022-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 21–243（223 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；0.1M BisTris, 0.2M sodium/potassium tartrate, 14% PEG-8000	分辨率 3.63 Å R-free 0.217
8D7I Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap1 from S. aureus 提交 2022-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 L 21–243（223 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；0.1M BisTris, 0.2M sodium/potassium tartrate, 14% PEG-8000	分辨率 3.63 Å R-free 0.217
8D7I Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap1 from S. aureus 提交 2022-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 O 21–243（223 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；0.1M BisTris, 0.2M sodium/potassium tartrate, 14% PEG-8000	分辨率 3.63 Å R-free 0.217
8D7I Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap1 from S. aureus 提交 2022-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 R 21–243（223 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；0.1M BisTris, 0.2M sodium/potassium tartrate, 14% PEG-8000	分辨率 3.63 Å R-free 0.217
8D7K Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap2 from S. aureus 提交 2022-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 21–243（223 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.6；293 K；0.1M Citric acid, 0.15M Lithium Sulfate, 12% PEG-6000	分辨率 3.10 Å R-free 0.258
8D7K Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap2 from S. aureus 提交 2022-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 21–243（223 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.6；293 K；0.1M Citric acid, 0.15M Lithium Sulfate, 12% PEG-6000	分辨率 3.10 Å R-free 0.258
8D7K Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap2 from S. aureus 提交 2022-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 21–243（223 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.6；293 K；0.1M Citric acid, 0.15M Lithium Sulfate, 12% PEG-6000	分辨率 3.10 Å R-free 0.258
8D7K Bifunctional Inhibition of Neutrophil Elastase and Cathepsin G by Eap2 from S. aureus 提交 2022-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 L 21–243（223 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.6；293 K；0.1M Citric acid, 0.15M Lithium Sulfate, 12% PEG-6000	分辨率 3.10 Å R-free 0.258
8G24 Crystal Structure of Cathepsin-G and Neutrophil Elastase Inhibited by S. aureus EapH2 at pH 5.5 提交 2023-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 21–243（223 aa）片段：C-terminal truncation (UNP residues 21-243)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M sodium chloride, 26% w/v PDB3350	分辨率 1.82 Å R-free 0.249
8G25 Crystal Structure of Cathepsin-G and Neutrophil Elastase Inhibited by S. aureus EapH2 at pH 7.5 提交 2023-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 21–243（223 aa）片段：C-terminal truncation (UNP residues 21-243)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, 0.2 M lithium sulfate, 26% w/v PEG3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.283
8G25 Crystal Structure of Cathepsin-G and Neutrophil Elastase Inhibited by S. aureus EapH2 at pH 7.5 提交 2023-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 21–243（223 aa）片段：C-terminal truncation (UNP residues 21-243)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, 0.2 M lithium sulfate, 26% w/v PEG3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.283
8G25 Crystal Structure of Cathepsin-G and Neutrophil Elastase Inhibited by S. aureus EapH2 at pH 7.5 提交 2023-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 21–243（223 aa）片段：C-terminal truncation (UNP residues 21-243)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, 0.2 M lithium sulfate, 26% w/v PEG3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.283
8G26 Crystal Structure of Cathepsin-G and Neutrophil Elastase Inhibited by S. aureus EapH2 at pH 8.5 提交 2023-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 21–243（223 aa）片段：C-terminal truncation (UNP residues 21-243)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris, 0.2 M magnesium chloride, 25% PEG3350	分辨率 1.85 Å R-free 0.238
9ASX BIFUNCTIONAL INHIBITION OF NEUTROPHIL ELASTASE AND CATHEPSIN G by Eap3 of S. aureus 提交 2024-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 21–243（223 aa）片段：C-terminal truncation (UNP residues 21-243)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M ammonium citrate 0.1 M imidazole (pH 6.8) 22% (w/v) peg-2kMME	分辨率 1.96 Å R-free 0.228
9ATK BIFUNCTIONAL INHIBITION OF NEUTROPHIL ELASTASE AND CATHEPSIN G by Eap4 of S. aureus 提交 2024-02-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 21–243（223 aa）片段：C-terminal truncation (UNP residues 21-243)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate (pH 5.5) 12% (w/v) PEG-6K	分辨率 2.11 Å R-free 0.233
9ATK BIFUNCTIONAL INHIBITION OF NEUTROPHIL ELASTASE AND CATHEPSIN G by Eap4 of S. aureus 提交 2024-02-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 21–243（223 aa）片段：C-terminal truncation (UNP residues 21-243)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate (pH 5.5) 12% (w/v) PEG-6K	分辨率 2.11 Å R-free 0.233
9ATK BIFUNCTIONAL INHIBITION OF NEUTROPHIL ELASTASE AND CATHEPSIN G by Eap4 of S. aureus 提交 2024-02-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 21–243（223 aa）片段：C-terminal truncation (UNP residues 21-243)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate (pH 5.5) 12% (w/v) PEG-6K	分辨率 2.11 Å R-free 0.233
9ATK BIFUNCTIONAL INHIBITION OF NEUTROPHIL ELASTASE AND CATHEPSIN G by Eap4 of S. aureus 提交 2024-02-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 21–243（223 aa）片段：C-terminal truncation (UNP residues 21-243)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate (pH 5.5) 12% (w/v) PEG-6K	分辨率 2.11 Å R-free 0.233

共 15 个其他 PDB 条目、37 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CATG_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–235； UniProt 21–255

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7h6h
沉积日期 deposition_date	2024-04-19
结构标题 title	THE 1.94 A CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN CATHEPSIN G IN COMPLEX WITH 1-[(7-fluoronaphthalen-1-yl)methyl]-3-[[methoxycarbonyl(methyl)amino]methyl]indole-2-carboxylic acid
关键词 keywords	HUMAN CATHEPSIN G, SERINE PROTEINASE, COMPLEX (SERINE PROTEASE-INHIBITOR) complex, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	18.08 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	16.78 Å
零角强度 I(0) i0	25306900.00
分子量 molecular_weight	24284.0 kDa
排除体积 excluded_volume	22677 Å³
包络体积 envelope_volume	37460 Å³
水化壳体积 shell_volume	18165 Å³
包络直径 envelope_diameter	59.3 Å
壳层 Rg shell_rg	23.50 Å
包络 Rg envelope_rg	17.18 Å
形状 Rg shape_rg	16.74 Å
总 Rg total_rg	17.60 Å
总原子数 total_atoms	1828
残基数 n_residues	224
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	57.8 Å
Rg (实空间) rg_real	17.94 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.22 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.5310e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.4440e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	17.96 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	25310000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8884
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	23.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.152
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.409
角度范围 angular_range	— – 0.4400 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	7776000.0000
实空间数据点数 n_real_points	75
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.853; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.988; Smooth: 0.998

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Cathepsin G
分子量 formula_weight	26801.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.20
突变 mutation	NO
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2080

IIGGRESRPHSRPYMAYLQIQSPAGQSRCGGFLVREDFVLTAAHCWGSNINVTLGAHNIQRRENTQQHITARRAIRHPQYNQRTIQNDIMLLQLSRRVRRNRNVNPVALPRAQEGLRPGTLCTVAGWGRVSMRRGTDTLREVQLRVQRDRQCLRIFGSYDPRRQICVGDRRERKAAFKGDSGGPLLCNNVAHGIVSYGKSSGVPPEVFTRVSSFLPWIRTTMRSFKLLDQMETPL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1-[(7-fluoronaphthalen-1-yl)methyl]-3-{[(methoxycarbonyl)(methyl)amino]methyl}-1H-indole-2-carboxylic acid
分子量 formula_weight	420.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	233

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	80.210 Å
晶胞边长 b length_b	44.730 Å
晶胞边长 c length_c	67.270 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	107.08 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.940 Å
最低分辨率 resolution_low	19.510 Å
R 因子 r_factor	0.1736
R_work r_work	0.1706
R_free r_free	0.2316

fit	/app/data/saxs_computation/h6/7h6h/7h6h.fit
pddf	/app/data/pr_computation/h6/7h6h/7h6h.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/h6/7h6h/7h6h.dat