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7k5m

CRYSTAL STRUCTURE OF HBV CAPSID Y132A MUTANT IN COMPLEX WITH N-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-phenyl-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carboxamide AT 2.65A RESOLUTION

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Capsid protein

Hepatitis B virus genotype D subtype adw (isolate United Kingdom/adyw/1979)

UniProt P03147

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 N-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-phenyl-2,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carboxamide × 2 ISOPROPYL ALCOHOL × 2 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 N-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-phenyl-2,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carboxamide × 2 ISOPROPYL ALCOHOL × 1 water × 1 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 N-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-phenyl-2,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carboxamide × 2 ISOPROPYL ALCOHOL × 2 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体
3kxs 3kxs 3kxs 4bmg 4bmg 4bmg 7k5m 7k5m 7k5m 9n3h

共 10 个 assembly

同源四聚体
2g33 2g33 2g34 2g34 2qij 2qij 4g93 4g93 5d7y 5d7y 6bvf 6bvf

共 18 个 assembly，这里只显示前 12 个

其他同源多聚体
2g33 2g33 2g33 2g33 2g34 2g34 2g34 2g34 2qij 2qij 2qij 2qij

共 43 个 assembly，这里只显示前 12 个

异源或核酸复合物
6cwd 6cwd 6cwt

共 3 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CAPSD_HBVD1
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 2–150； UniProt 1–149 作者链 B； PDB构建体 2–150； UniProt 1–149 作者链 C； PDB构建体 2–150； UniProt 1–149 作者链 D； PDB构建体 2–150； UniProt 1–149 作者链 E； PDB构建体 2–150； UniProt 1–149 作者链 F； PDB构建体 2–150； UniProt 1–149

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7k5m
沉积日期 deposition_date2020-09-17
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURE OF HBV CAPSID Y132A MUTANT IN COMPLEX WITH N-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-phenyl-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carboxamide AT 2.65A RESOLUTION
关键词 keywordsHVB capsid, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7k5m__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7k5m__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7k5m__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）21.01 Å
Rg（电子密度）20.49 Å
总 Rg21.17 Å
原子数2072
残基数264
排除体积37042 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7k5m__assembly_1__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 7k5m__assembly_2__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 7k5m__assembly_3__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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7. 引用文献 (1)