SAXSdb — 7kvf

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Coagulation factor V

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 29–2224	未记录	无其他共同聚合物	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4；20 mM HEPES, 150 mM NaCl, 5 mM CaCl2 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7KVF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1CZS CRYSTAL STRUCTURE OF THE C2 DOMAIN OF HUMAN COAGULATION FACTOR V: COMPLEX WITH PHENYLMERCURY 提交 1999-09-07	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2065–2224（160 aa）片段：C2 DISCOIDIN-LIKE DOMAIN	未记录	PHG PHENYLMERCURY × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.2；AMMONIUM SULFATE, pH 10.20, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.90 Å R-free 0.258
1CZT CRYSTAL STRUCTURE OF THE C2 DOMAIN OF HUMAN COAGULATION FACTOR V 提交 1999-09-07	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2065–2224（160 aa）片段：C2 DISCOIDIN-LIKE DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.2；AMMONIUM SULFATE, pH 10.20, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.87 Å R-free 0.242
1CZV CRYSTAL STRUCTURE OF THE C2 DOMAIN OF HUMAN COAGULATION FACTOR V: DIMERIC CRYSTAL FORM 提交 1999-09-07	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2065–2224（160 aa）片段：C2 DISCOIDIN-LIKE DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 10；pH 10.00	分辨率 2.40 Å R-free 0.257
1CZV CRYSTAL STRUCTURE OF THE C2 DOMAIN OF HUMAN COAGULATION FACTOR V: DIMERIC CRYSTAL FORM 提交 1999-09-07	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2065–2224（160 aa）片段：C2 DISCOIDIN-LIKE DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 10；pH 10.00	分辨率 2.40 Å R-free 0.257
3P6Z Structural basis of thrombin mediated factor V activation: essential role of the hirudin-like sequence Glu666-Glu672 for processing at the heavy chain-B domain junction 提交 2010-10-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 685–737（53 aa）片段：FACTOR V, A2-B DOMAIN LINKER	未记录	NA SODIUM ION × 3 0G6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 3 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM MOPS/HEPES-Na, pH 7.5, 12.5% (w/v) PEG 1000, 12.5% (w/v) PEG 3350, 12.5% (v/v) 2-methylpentane-2,4-diol (MPD), 30 mM Ca2+, 30 mM Mg2+, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.70 Å R-free 0.239
3P6Z Structural basis of thrombin mediated factor V activation: essential role of the hirudin-like sequence Glu666-Glu672 for processing at the heavy chain-B domain junction 提交 2010-10-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 685–737（53 aa）片段：FACTOR V, A2-B DOMAIN LINKER	未记录	NA SODIUM ION × 6 0G6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM MOPS/HEPES-Na, pH 7.5, 12.5% (w/v) PEG 1000, 12.5% (w/v) PEG 3350, 12.5% (v/v) 2-methylpentane-2,4-diol (MPD), 30 mM Ca2+, 30 mM Mg2+, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.70 Å R-free 0.239
3P70 Structural basis of thrombin-mediated factor V activation: essential role of the hirudin-like sequence Glu666-Glu672 for processing at the heavy chain-B domain junction 提交 2010-10-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 M 685–737（53 aa）片段：FACTOR V, A2-B DOMAIN LINKER	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 BEN BENZAMIDINE × 1 NA SODIUM ION × 2 BGC beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM MOPS/HEPES-Na, pH 7.5, 12.5% (w/v) PEG 1000, 12.5% (w/v) PEG 3350, 12.5% (v/v) 2-methylpentane-2,4-diol (MPD), 20 mM D-glucose, 20 mM D-mannose, 20 mM D-galactose, 20 mM L-fucose, 20 mM D-xylose, 20 mM N-acetyl-D-glucosamine , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.55 Å R-free 0.279
3P70 Structural basis of thrombin-mediated factor V activation: essential role of the hirudin-like sequence Glu666-Glu672 for processing at the heavy chain-B domain junction 提交 2010-10-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 N 685–737（53 aa）片段：FACTOR V, A2-B DOMAIN LINKER	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 BEN BENZAMIDINE × 1 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM MOPS/HEPES-Na, pH 7.5, 12.5% (w/v) PEG 1000, 12.5% (w/v) PEG 3350, 12.5% (v/v) 2-methylpentane-2,4-diol (MPD), 20 mM D-glucose, 20 mM D-mannose, 20 mM D-galactose, 20 mM L-fucose, 20 mM D-xylose, 20 mM N-acetyl-D-glucosamine , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.55 Å R-free 0.279
3P70 Structural basis of thrombin-mediated factor V activation: essential role of the hirudin-like sequence Glu666-Glu672 for processing at the heavy chain-B domain junction 提交 2010-10-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 O 685–737（53 aa）片段：FACTOR V, A2-B DOMAIN LINKER	未记录	BEN BENZAMIDINE × 1 NA SODIUM ION × 1 BGC beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM MOPS/HEPES-Na, pH 7.5, 12.5% (w/v) PEG 1000, 12.5% (w/v) PEG 3350, 12.5% (v/v) 2-methylpentane-2,4-diol (MPD), 20 mM D-glucose, 20 mM D-mannose, 20 mM D-galactose, 20 mM L-fucose, 20 mM D-xylose, 20 mM N-acetyl-D-glucosamine , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.55 Å R-free 0.279
3P70 Structural basis of thrombin-mediated factor V activation: essential role of the hirudin-like sequence Glu666-Glu672 for processing at the heavy chain-B domain junction 提交 2010-10-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 P 685–737（53 aa）片段：FACTOR V, A2-B DOMAIN LINKER	未记录	BEN BENZAMIDINE × 1 NA SODIUM ION × 2 BGC beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM MOPS/HEPES-Na, pH 7.5, 12.5% (w/v) PEG 1000, 12.5% (w/v) PEG 3350, 12.5% (v/v) 2-methylpentane-2,4-diol (MPD), 20 mM D-glucose, 20 mM D-mannose, 20 mM D-galactose, 20 mM L-fucose, 20 mM D-xylose, 20 mM N-acetyl-D-glucosamine , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.55 Å R-free 0.279
3S9C Russell's viper venom serine proteinase, RVV-V in complex with the fragment (residues 1533-1546) of human factor V 提交 2011-06-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1561–1574（14 aa）片段：UNP residues 1561-1574	未记录	BGC beta-D-glucopyranose × 1 GLC alpha-D-glucopyranose × 1 ACT ACETATE ION × 4 ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；20% PEG 3350, 0.2M zinc acetate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.218
7KVE Cryo-EM structure of human Factor V at 3.3 Angstrom resolution 提交 2020-11-27	结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 29–2224（2196 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES, 150 mM NaCl, 5 mM CaCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7KXY Cryo-EM structure of human Factor Va at 4.4 Angstrom resolution 提交 2020-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 29–737（709 aa）片段：UNP residues 29-737 链 B 1574–2224（651 aa）片段：UNP residues 1574-2224	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES, 150 mM NaCl, 5 mM CaCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
7TPP Cryo-em structure of human prothrombin:prothrombinase at 4.1 Angstrom resolution 提交 2022-01-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 29–737（709 aa）片段：domains A1 and A2 (UNP residues 29-737) 链 D 1574–2224（651 aa）片段：domains C1, C2, and A3 (UNP residues 1574-2224)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM Hepes, 150mM NaCl, 5mM CaCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8FDG Cryo-EM structure of coagulation factor V short 提交 2022-12-03	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 29–783（755 aa）链 A 1487–2224（738 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2 second blot 20 second wait time	分辨率 3.20 Å
8TN9 Structural architecture of the acidic region of the B domain of coagulation factor V 提交 2023-08-01	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 29–2224（2196 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES, 150 mM NaCl, 5 mM CaCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
9CTH Preliminary map of the Prothrombin-prothrombinase complex on nano discs 提交 2024-07-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 29–737（709 aa）片段：Domains A1 and A2 (UNP residues 29-737) 链 E 1574–2224（651 aa）片段：Domains C1, C2, and A3 (UNP residues 1574-2224)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES, 150 mM NaCl, and 5 mM CaCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.47 Å
9I2H A 3.3 angstrom cryo-EM structure of an engineered high-affinity human prothrombinase complex 提交 2025-01-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 A 29–737（709 aa）链 B 1574–2224（651 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 0GJ L-alpha-glutamyl-N-{(1S)-4-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-[(1S)-2-chloro-1-hydroxyethyl]butyl}glycinamide × 1 CU COPPER (II) ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES, 150mM NaCl and 5mM CaCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
9MOT Cryo-EM structure of factor Va bound to activated protein C 提交 2024-12-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 29–737（709 aa）片段：Domains A1 and A2 (UNP residues 29-737) 链 B 1574–2224（651 aa）片段：Domains C1, C2, and A3 (UNP residues 1574-2224)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES, 150 mM NaCl, 5 mM CaCl2 cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES, 150 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 40uM n-Dodecyl-B-D-Maltoside cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES, 150 mM NaCl, 5 mM CaCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.15 Å
9MOV Cryo-EM structure of factor Va bound to activated protein C 提交 2024-12-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 29–737（709 aa）片段：Domains A1 and A2 (UNP residues 29-737) 链 B 1574–2224（651 aa）片段：Domains C1, C2, and A3 (UNP residues 1574-2224)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 CA CALCIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES, 150 mM NaCl, 5 mM CaCl2 cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES, 150 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 40uM n-Dodecyl-B-D-Maltoside cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES, 150 mM NaCl, 5 mM CaCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9YQ8 Cryo-EM complex of meizothrombinDESF1, factor Xa, and factor Va 提交 2025-10-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1574–2224（651 aa）片段：Domains C1, C2, and A3 (UNP residues 1574-2224) 链 B 29–702（674 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.84 Å

共 16 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FA5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–2196； UniProt 29–2224

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7kvf
沉积日期 deposition_date	2020-11-28
结构标题 title	Cryo-EM structure of human Factor V at 3.6 Angstrom resolution
关键词 keywords	Human Factor V, BLOOD CLOTTING; BLOOD CLOTTING
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	37.78 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	37.26 Å
零角强度 I(0) i0	383368000.00
分子量 molecular_weight	158040.0 kDa
排除体积 excluded_volume	197170 Å³
包络体积 envelope_volume	265830 Å³
水化壳体积 shell_volume	58814 Å³
包络直径 envelope_diameter	137.1 Å
壳层 Rg shell_rg	43.79 Å
包络 Rg envelope_rg	37.42 Å
形状 Rg shape_rg	37.26 Å
总 Rg total_rg	37.65 Å
总原子数 total_atoms	11142
残基数 n_residues	1374
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	125.5 Å
Rg (实空间) rg_real	37.78 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.89 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.8340e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.4210e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	37.78 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	383400000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8752
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	44.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.398
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.234
角度范围 angular_range	— – 0.2100 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	73830000.0000
实空间数据点数 n_real_points	43
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.835; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.868

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Coagulation factor V
分子量 formula_weight	248973.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B
原子数 atom_count	11142

AQLRQFYVAAQGISWSYRPEPTNSSLNLSVTSFKKIVYREYEPYFKKEKPQSTISGLLGPTLYAEVGDIIKVHFKNKADKPLSIHPQGIRYSKLSEGASYLDHTFPAEKMDDAVAPGREYTYEWSISEDSGPTHDDPPCLTHIYYSHENLIEDFNSGLIGPLLICKKGTLTEGGTQKTFDKQIVLLFAVFDESKSWSQSSSLMYTVNGYVNGTMPDITVCAHDHISWHLLGMSSGPELFSIHFNGQVLEQNHHKVSAITLVSATSTTANMTVGPEGKWIISSLTPKHLQAGMQAYIDIKNCPKKTRNLKKITREQRRHMKRWEYFIAAEEVIWDYAPVIPANMDKKYRSQHLDNFSNQIGKHYKKVMYTQYEDESFTKHTVNPNMKEDGILGPIIRAQVRDTLKIVFKNMASRPYSIYPHGVTFSPYEDEVNSSFTSGRNNTMIRAVQPGETYTYKWNILEFDEPTENDAQCLTRPYYSDVDIMRDIASGLIGLLLICKSRSLDRRGIQRAADIEQQAVFAVFDENKSWYLEDNINKFCENPDEVKRDDPKFYESNIMSTINGYVPESITTLGFCFDDTVQWHFCSVGTQNEILTIHFTGHSFIYGKRHEDTLTLFPMRGESVTVTMDNVGTWMLTSMNSSPRSKKLRLKFRDVKCIPDDDEDSYEIFEPPESTVMATRKMHDRLEPEDEESDADYDYQNRLAAALGIRSFRNSSLNQEEEEFNLTALALENGTEFVSSNTDIIVGSNYSSPSNISKFTVNNLAEPQKAPSHQQATTAGSPLRHLIGKNSVLNSSTAEHSSPYSEDPIEDPLQPDVTGIRLLSLGAGEFKSQEHAKHKGPKVERDQAAKHRFSWMKLLAHKVGRHLSQDTGSPSGMRPWEDLPSQDTGSPSRMRPWKDPPSDLLLLKQSNSSKILVGRWHLASEKGSYEIIQDTDEDTAVNNWLISPQNASRAWGESTPLANKPGKQSGHPKFPRVRHKSLQVRQDGGKSRLKKSQFLIKTRKKKKEKHTHHAPLSPRTFHPLRSEAYNTFSERRLKHSLVLHKSNETSLPTDLNQTLPSMDFGWIASLPDHNQNSSNDTGQASCPPGLYQTVPPEEHYQTFPIQDPDQMHSTSDPSHRSSSPELSEMLEYDRSHKSFPTDISQMSPSSEHEVWQTVISPDLSQVTLSPELSQTNLSPDLSHTTLSPELIQRNLSPALGQMPISPDLSHTTLSPDLSHTTLSLDLSQTNLSPELSQTNLSPALGQMPLSPDLSHTTLSLDFSQTNLSPELSHMTLSPELSQTNLSPALGQMPISPDLSHTTLSLDFSQTNLSPELSQTNLSPALGQMPLSPDPSHTTLSLDLSQTNLSPELSQTNLSPDLSEMPLFADLSQIPLTPDLDQMTLSPDLGETDLSPNFGQMSLSPDLSQVTLSPDISDTTLLPDLSQISPPPDLDQIFYPSESSQSLLLQEFNESFPYPDLGQMPSPSSPTLNDTFLSKEFNPLVIVGLSKDGTDYIEIIPKEEVQSSEDDYAEIDYVPYDDPYKTDVRTNINSSRDPDNIAAWYLRSNNGNRRNYYIAAEEISWDYSEFVQRETDIEDSDDIPEDTTYKKVVFRKYLDSTFTKRDPRGEYEEHLGILGPIIRAEVDDVIQVRFKNLASRPYSLHAHGLSYEKSSEGKTYEDDSPEWFKEDNAVQPNSSYTYVWHATERSGPESPGSACRAWAYYSAVNPEKDIHSGLIGPLLICQKGILHKDSNMPMDMREFVLLFMTFDEKKSWYYEKKSRSSWRLTSSEMKKSHEFHAINGMIYSLPGLKMYEQEWVRLHLLNIGGSQDIHVVHFHGQTLLENGNKQHQLGVWPLLPGSFKTLEMKASKPGWWLLNTEVGENQRAGMQTPFLIMDRDCRMPMGLSTGIISDSQIKASEFLGYWEPRLARLNNGGSYNAWSVEKLAAEFASKPWIQVDMQKEVIITGIQTQGAKHYLKSCYTTEFYVAYSSNQINWQIFKGNSTRNVMYFNGNSDASTIKENQFDPPIVARYIRISPTRAYNRPTLRLELQGCEVNGCSTPLGMENGKIENKQITASSFKKSWWGDYWEPFRARLNAQGRVNAWQAKANNNKQWLEIDLLKIKKITAIITQGCKSLSSEMYVKSYTIHYSEQGVEWKPYRLKSSMVDKIFEGNTNTKGHVKNFFNPPIISRFIRVIPKTWNQSIALRLELFGCDIY

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	7kvfB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	420 — Cupredoxins - blue copper proteins

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.60 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	299182

fit	/app/data/saxs_computation/kv/7kvf/7kvf.fit
pddf	/app/data/pr_computation/kv/7kvf/7kvf.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/kv/7kvf/7kvf.dat

Cryo-EM structure of human Factor V at 3.6 Angstrom resolution

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Coagulation factor V

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)