3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase 2
Escherichia coli (strain K12)
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–413 | 未记录 | Acyl carrier protein × 2 (P0A6A8) EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 MU4 N-[2-(hexadecanoylamino)ethyl]-N~3~-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;281 K;30 % PEG 8K, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, and 0.3 M sodium acetate | 分辨率 2.00 Å R-free 0.207 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 7L4E | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1B3N BETA-KETOACYL CARRIER PROTEIN SYNTHASE AS A DRUG TARGET, IMPLICATIONS FROM THE CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX WITH THE INHIBITOR CERULENIN. 提交 1998-12-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–413(412 aa)
|
未记录 | CER (2S, 3R)-3-HYDROXY-4-OXO-7,10-TRANS,TRANS-DODECADIENAMIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8;5.6 MG/ML KAS-CERULENIN COMPLEX IN 0.3M
NACL, 25MM TRIS PH8.0, 5MM IMIDAZOLE AND
10% (V/V) GLYCEROL WERE MIXED (2+2UL) WITH
A 1000 UL RESERVOIR
SOLUTION CONSISTING OF 26% W/V PEG8000
0.1% V/V 2-MERCAPTOETHANOL AND WATER. CRYSTALS
APPEARED IN A FEW DAYS
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.270 |
| 1KAS BETA-KETOACYL-ACP SYNTHASE II FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1997-12-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–412(412 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.279 |
| 2GFV Structure of E. coli FabF (KASII) C163Q mutant 提交 2006-03-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–412(412 aa)
|
突变:C163Q | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;19-24% PEG 8000, 0.1M Tris, 10mM BME, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.247 |
| 2GFW Structure of wild type E. coli FabF (KASII) 提交 2006-03-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–412(412 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;19-24% PEG 8000, 0.1M Tris, 10mM BME, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.268 |
| 2GFX Structure of E. coli FabF(C163Q) in complex with Platensimycin 提交 2006-03-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–412(412 aa)
|
突变:C163Q | PMN PLATENSIMYCIN × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;19-24% PEG 8000, 0.1M Tris, 10mM BME, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.255 |
| 2GFY Structure of E. coli FabF(K335A) mutant with covalently linked dodecanoic acid 提交 2006-03-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–412(412 aa)
|
突变:K335A | DAO LAURIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;19-24% PEG 8000, 0.1M Tris, 10mM BME, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.243 |
| 3G0Y Structure of E. coli FabF(C163Q) in complex with dihydroplatensimycin 提交 2009-01-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–413(412 aa)
|
突变:C163Q | P9A 3-({3-[(1S,4aS,6S,7S,9S,9aR)-1,6-dimethyl-2-oxodecahydro-6,9-epoxy-4a,7-methanobenzo[7]annulen-1-yl]propanoyl}amino)-2,4-dihydroxybenzoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;19-24% PEG 8000, 0.1M Tris, 10mM BME, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.234 |
| 3G11 Structure of E. coli FabF(C163Q) in complex with dihydrophenyl platensimycin 提交 2009-01-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–413(412 aa)
|
突变:C163Q | P9C 3-({3-[(1S,4S,4aS,6S,7S,9S,9aR)-1,6-dimethyl-2-oxo-4-phenyldecahydro-6,9-epoxy-4a,7-methanobenzo[7]annulen-1-yl]propanoyl}amino)-2,4-dihydroxybenzoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;19-24% PEG 8000, 0.1M Tris, 10mM BME, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.204 |
| 3HNZ Structure of E. coli FabF(C163A) in Complex with Platensimycin 提交 2009-06-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–413(412 aa)
|
突变:C163A | PMN PLATENSIMYCIN × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.75 Å R-free 0.256 |
| 3HO2 Structure of E.coli FabF(C163A) in complex with Platencin 提交 2009-06-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–413(412 aa)
|
突变:C163A | N32 2,4-dihydroxy-3-({3-[(2S,4aS,8S,8aR)-8-methyl-3-methylidene-7-oxo-1,3,4,7,8,8a-hexahydro-2H-2,4a-ethanonaphthalen-8-yl]propanoyl}amino)benzoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.207 |
| 3HO9 Structure of E.coli FabF(C163A) in complex with Platencin A1 提交 2009-06-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–413(412 aa)
|
突变:C163A | N3A 2,4-dihydroxy-3-({3-[(2R,4aR,8S,8aR,9R)-9-hydroxy-8-methyl-3-methylidene-7-oxo-1,3,4,7,8,8a-hexahydro-2H-2,4a-ethanonap hthalen-8-yl]propanoyl}amino)benzoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.190 |
| 3I8P Crystal structure of E. coli FabF(C163A) in complex with Platensimycin A1 提交 2009-07-09 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–413(413 aa)
|
突变:C163A | 840 Platensimycin A1 × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;19-24% PEG 8000, 0.1M Tris-HCl, 10mM BME, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.182 |
| 6OKG Crosslinked Crystal Structure of Type II Fatty Acid Synthase Ketosynthase, FabF, and C16-crypto Acyl Carrier Protein, AcpP 提交 2019-04-12 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–413(413 aa)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 MU4 N-[2-(hexadecanoylamino)ethyl]-N~3~-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alaninamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;281 K;30 % PEG 8K, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, and 0.3 M sodium acetate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.228 |
| 6OLT Crosslinked Crystal Structure of Type II Fatty Acid Synthase Ketosynthase, FabF, and C12-crypto Acyl Carrier Protein, AcpP 提交 2019-04-17 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–413(413 aa)
|
未记录 | MRJ N-[2-(dodecanoylamino)ethyl]-N~3~-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alaninamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;281 K;30 % PEG 8K, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, and 0.3 M sodium acetate
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.239 |
| 7L4L Crosslinked Crystal Structure of Type II Fatty Acid Synthase Ketosynthase, FabF, and C8-crypto Acyl Carrier Protein, AcpP 提交 2020-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–413(413 aa)
链 B
1–413(413 aa)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 DYF [(3~{R})-2,2-dimethyl-4-[[3-[2-[[(~{E})-oct-2-enoyl]amino]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]amino]-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-butyl] dihydrogen phosphate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;281 K;30 % PEG 8K, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, and 0.3 M sodium acetate
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.267 |
| 9LPL E. coli FabF mutant -C163Q 提交 2025-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–413(412 aa)
链 B
2–413(412 aa)
|
突变:C163Q 突变:C163Q | A1EWE 3-(3-((2S,3S,5S,5aR,6S,12cR)-11-(tert-butyl)-2,6-dimethyl-7-oxo-1,2,3,4,5,5a,6,7-octahydro-2,5-epoxy-3,12c-methanobenzo[b]cyclohepta[5,6]benzo[1,2-d]thiophen-6-yl)propanamido)-2,4-dihydroxybenzoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;277 K;0.1 M BIS-Tris, 0.2 M Magnesium chloride, 20 % w/v polyethylene glycol (PEG) 3350
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.263 |
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| UniProt名称 | FABF_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–413; UniProt 1–413 |