SAXSdb — 7lhh

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

P fimbrial usher protein PapC

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Chaperone protein PapD × 1 （P15319） Fimbrial adapter PapK × 1 （P62532） P fimbria tip G-adhesin PapG-II × 1 （A0A798R8B8）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A773A954_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–809； UniProt 28–836

Chaperone protein PapD

Escherichia coli

UniProt P15319

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	P fimbrial usher protein PapC × 1 （A0A773A954） Fimbrial adapter PapK × 1 （P62532） P fimbria tip G-adhesin PapG-II × 1 （A0A798R8B8）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PAPD_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–218； UniProt 22–239

Fimbrial adapter PapK

Escherichia coli

UniProt P62532

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	P fimbrial usher protein PapC × 1 （A0A773A954） Chaperone protein PapD × 1 （P15319） P fimbria tip G-adhesin PapG-II × 1 （A0A798R8B8）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PAPK_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–178； UniProt 1–178

P fimbria tip G-adhesin PapG-II

Escherichia coli

UniProt A0A798R8B8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	P fimbrial usher protein PapC × 1 （A0A773A954） Chaperone protein PapD × 1 （P15319） Fimbrial adapter PapK × 1 （P62532）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A798R8B8_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–336； UniProt 1–336

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7lhh
沉积日期 deposition_date	2021-01-23
结构标题 title	Cryo-EM structure of E. coli P pilus tip assembly intermediate PapC-PapD-PapK-PapG in the second conformation
关键词 keywords	Cryo-EM, Uropathogenic Escherichia coli, chaperone-usher, P pilus, CHAPERONE; CHAPERONE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7lhh__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7lhh__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7lhh__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	43.73 Å
Rg（电子密度）	44.01 Å
总 Rg	44.02 Å
原子数	11520
残基数	1493
排除体积	203040 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7lhh__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	P fimbrial usher protein PapC
分子量 formula_weight	88746.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C
原子数 atom_count	11521

VEFNTDVLDAADKKNIDFTRFSEAGYVLPGQYLLDVIVNGQSISPASLQISFVEPQSSGDKAEKKLPQACLTSDMVRLMGLTAESLDKVVYWHDGQCADFHGLPGVDIRPDTGAGVLRINMPQARLEYSDATWLPPSRWDDGIPGLMLDYNLNGTVSRNYQGGDSHQFSYNGTVGGNLGPWRLRADYQGSQEQSRYNGEKTTNRNFTWSRFYLFRAIPRWRANLTLGENNINSDIFRSWSYTGASLESDDRMLPPRLRGYAPQITGIAETNARVVVSQQGRVLYDSMVPAGPFSIQDLDSSVRGRLDVEVIEQNGRKKTFQVDTASVPYLTRPGQVRYKLVSGRSRGYGHETEGPVFATGEASWGLSNQWSLYGGAVLAGDYNALAAGAGWDLGVPGTLSADITQSVARIEGERTFQGKSWRLSYSKRFDNADADITFAGYRFSERNYMTMEQYLNARYRNDYSSREKEMYTVTLNKNVADWNTSFNLQYSRQTYWDIRKTDYYTVSVNRYFNVFGLQGVAVGLSASRSKYLGRDNDSAYLRISVPLGTGTASYSGSMSNDRYVNMAGYTDTFNDGLDSYSLNAGLNSGGGLTSQRQINAYYSHRSPLANLSANIASLQKGYTSFGVSASGGATITGKDAALHAGGMSGGTRLLVDTDGVGGVPVDGGQVVTNRWGTGVVTDISSYYRNTTSVDLKRLPDDVEATRSVVESALTEGAIGYRKFSVLKGKRLFAILRLADGSQPPFGASVTSEKGRELGMVADEGLAWLSGVTPGETLSVNWDGKIQCQVNVPETAISDQQLLLPCTPQK

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Chaperone protein PapD
分子量 formula_weight	24589.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

AVSLDRTRAVFDGSEKSMTLDISNDNKQLPYLAQAWIENENQEKIITGPVIATPPVQRLEPGAKSMVRLSTTPDISKLPQDRESLFYFNLREIPPRSEKANVLQIALQTKIKLFYRPAAIKTRPNEVWQDQLILNKVSGGYRIENPTPYYVTVIGLGGSEKQAEEGEFETVMLSPRSEQTVKSANYNTPYLSYINDYGGRPVLSFICNGSRCSVKKEK

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Fimbrial adapter PapK
分子量 formula_weight	18895.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MIKSTGALLLFAALSAGQAIASDVAFRGNLLDRPCHVSGDSLNKHVVFKTRASRDFWYPPGRSPTESFVIRLENCHATAVGKIVTLTFKGTEEAALPGHLKVTGVNAGRLGIALLDTDGSSLLKPGTSHNKGQGEKVTGNSLELPFGAYVVATPEALRTKSVVPGDYEATATFELTYR

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	P fimbria tip G-adhesin PapG-II
分子量 formula_weight	37620.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MKKWFPALLFSLCVSGESSAWNNIVFYSLGDVNSYQGGNVVITQRPQFITSWRPGIATVTWNQCNGPGFADGFWAYYREYIAWVVFPKKVMTQNGYPLFIEVHNKGSWSEENTGDNDSYFFLKGYKWDERAFDAGNLCQKPGETTRLTEKFDDIIFKVALPADLPLGDYSVKIPYTSGMQRHFASYLGARFKIPYNVAKTLPRENEMLFLFKNIGGCRPSAQSLEIKHGDLSINSANNHYAAQTLSVSCDVPANIRFMLLRNTTPTYSHGKKFSVGLGHGWDSIVSVNGVDTGETTMRWYKAGTQNLTIGSRLYGESSKIQPGVLSGSATLLMILP

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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分辨率 resolution	7.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	131650

Cryo-EM structure of E. coli P pilus tip assembly intermediate PapC-PapD-PapK-PapG in the second conformation

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

P fimbrial usher protein PapC

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Chaperone protein PapD

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Fimbrial adapter PapK

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

P fimbria tip G-adhesin PapG-II

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7lhh__assembly_1__model_1

7lhh__assembly_1__model_1 | I(q)

7lhh__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Cryo-EM structure of E. coli P pilus tip assembly intermediate PapC-PapD-PapK-PapG in the second conformation

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

P fimbrial usher protein PapC

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chaperone protein PapD

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Fimbrial adapter PapK

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

P fimbria tip G-adhesin PapG-II

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7lhh__assembly_1__model_1

7lhh__assembly_1__model_1 | I(q)

7lhh__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)