Tubulin alpha-1B chain
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–451 链 C; UniProt 1–451 链 E; UniProt 1–451 链 G; UniProt 1–451 链 I; UniProt 1–451 链 K; UniProt 1–451 链 M; UniProt 1–451 链 O; UniProt 1–451 | 未记录 | Tubulin beta-3 chain × 8 (Q13509) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 YGY Cryptophycin 52 × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE | 分辨率 3.26 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 7LXB | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2E4H Solution structure of cytoskeletal protein in complex with tubulin tail 提交 2006-12-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
416–451(36 aa)
片段:C-tail, residues 416-451
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.9;303 K;压力 ambient
NMR样品组成
0.9mM U-15N,13C CLIP: Nonlabel tubulin; 30mM BisTris buffer K; 1mM DTT; 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.9mM U-15N CLIP: Nonlabel tubulin; 30mM BisTris buffer K; 1mM DTT; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.9mM U-15N,13C tubulin: Nonlabel CLIP; 30mM BisTris buffer K; 1mM DTT; 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.9mM U-15N tubulin: Nonlabel CLIP; 30mM BisTris buffer K; 1mM DTT; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 5IJ0 Cryo EM density of microtubule assembled from human TUBB3 提交 2016-03-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–437(437 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 5IJ9 Cryo EM density of microtubule assembled from human TUBB3-D417H mutant 提交 2016-03-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–437(437 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 5N5N Cryo-EM structure of tsA201 cell alpha1B and betaI and betaIVb microtubules 提交 2017-02-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 G
1–437(437 aa)
链 H
1–437(437 aa)
链 I
1–437(437 aa)
链 J
1–437(437 aa)
链 K
1–437(437 aa)
链 L
1–437(437 aa)
|
未记录 | G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6 MG MAGNESIUM ION × 12 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 with GMPCPP (80mM PIPES, 2mM MgCl2, 1mM EGTA, 1mM DTT, 1mM GMPCPP)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6E7B 13-pf 3-start GMPCPP-human alpha1B/beta3 microtubules 提交 2018-07-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–437(437 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6E7C 14-pf 3-start GMPCPP-human alpha1B/beta2B microtubules 提交 2018-07-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–437(437 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.65 Å |
| 6I2I Refined 13pf Hela Cell Tubulin microtubule (EML4-NTD decorated) 提交 2018-11-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;25mM PIPES, 1.5mM MgCl2, 1mM EGTA, 1mM DTT, 30mM NaCl,1mM GMPCPP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 6J4V Structural basis of tubulin detyrosination by vasohibins-SVBP enzyme complex and functional implications 提交 2019-01-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
431–451(21 aa)
|
突变:E450C | PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 8.2;293 K;For crystallization of V2c-SVBP C58S in complex with the maTail peptide the components were mixed in a 1:3 molar ratio and incubated at room temperature for 24 h before setting up crystallization trials. The resulting V2c-SVBP S58C-maTail complex was crystallized in 1.4 M sodium/potassium phosphate, pH 8.2.
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.200 |
| 6QUS HsCKK (human CAMSAP1) decorated 13pf taxol-GDP microtubule 提交 2019-02-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 O
1–451(451 aa)
链 X
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB20
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6QUY NgCKK (N.Gruberi CKK) decorated 13pf taxol-GDP microtubule 提交 2019-02-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB20
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6QVE NgCKK (Naegleria Gruberi CKK) decorated 14pf taxol-GDP microtubule 提交 2019-03-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB20
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6QVJ HsCKK (human CAMSAP1) decorated 14pf taxol-GDP microtubule 提交 2019-03-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 O
1–451(451 aa)
链 X
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB20
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6S8L Structure, Thermodynamics, and Kinetics of Plinabulin Binding to two Tubulin Isotypes 提交 2019-07-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 PN6 (3Z,6Z)-3-benzylidene-6-[(5-tert-butyl-1H-imidazol-4-yl)methylidene]piperazine-2,5-dione × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;100 mM Bis-TrisMethane, pH 5.5, supplemented with 200 mM ammonium sulfate and 25% PEG3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.266 |
| 7M18 HeLa-tubulin in complex with cryptophycin 1 提交 2021-03-12 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 G
1–451(451 aa)
链 I
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 M
1–451(451 aa)
链 O
1–451(451 aa)
|
未记录 | YNP Cryptophycin 1 × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.38 Å |
| 7M20 18-mer HeLa-tubulin rings in complex with Cryptophycin 1 提交 2021-03-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 G
1–451(451 aa)
链 I
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 M
1–451(451 aa)
链 O
1–451(451 aa)
链 Q
1–451(451 aa)
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 YNP Cryptophycin 1 × 9 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.84 Å |
| 7PJF Inhibiting parasite proliferation using a rationally designed anti-tubulin agent 提交 2021-08-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.5;293 K;100 mM Bis-TrisMethane, pH 5.5, supplemented with 200 mM ammonium sulfate and 25% PEG3350
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.218 |
| 7SJ7 Undecorated 13pf wildtype microtubule from recombinant human tubulin 提交 2021-10-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 5 mM MgCl2, 2 mM GTP, pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7SJ8 13pf wildtype microtubule from recombinant human tubulin decorated with kinesin 提交 2021-10-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 5 mM MgCl2, 2 mM GTP, pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;30 second adsorption time onto grid. blot force 15, 4 second blot time, 37 degrees, and 100 percent humidity. 0.5 second drain time.
|
分辨率 3.60 Å |
| 7SJ9 13pf E254A microtubule from recombinant human tubulin decorated with EB3 提交 2021-10-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
突变:E254A 突变:E254A 突变:E254A 突变:E254A 突变:E254A 突变:E254A | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 5 mM MgCl2, 2 mM GTP, pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7SJA Undecorated 13pf E254N microtubule from recombinant human tubulin 提交 2021-10-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
突变:E254N 突变:E254N 突变:E254N 突变:E254N 突变:E254N 突变:E254N | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 5 mM MgCl2, 2 mM GTP, pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7Z6S MATCAP bound to a human 14 protofilament microtubule 提交 2022-03-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:Hexameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7ZCW Cryo-EM structure of GMPCPP-microtubules in complex with VASH2-SVBP 提交 2022-03-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8T42 Model of TTLL6 MTBH1-2 bound to microtubule 提交 2023-06-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 F
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;The sample was blotted with Whatman #5 blotting paper on both sides of the grid for 3 s with a blot offset of -1 using a Vitrobot Mark IV (Thermo Fisher Scientific) with a chamber set to 30C at 100% humidity and subsequently plunged into liquid ethane.
|
分辨率 3.60 Å |
| 8U3Z Model of TTLL6 bound to microtubule from composite map 提交 2023-09-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 F
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8V2J Structure of alpha1B and betaI/IVb microtubule bound to GDP 提交 2023-11-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 D
1–451(451 aa)
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;5 ul of microtubules were applied to glow-discharged cryo-EM grid and allowed to absorb for 30 sec.
|
分辨率 2.90 Å |
| 8VA2 Symmetry expanded map of 2 gamma-tubulins bound to 2 alpha tubulins in gamma tubulin ring complex capped microtubule end. 提交 2023-12-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 a
1–451(451 aa)
链 b
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 8VRJ Rigid body fitted model for gamma tubulin ring complex capped microtubule 提交 2024-01-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric |
链 1
1–451(451 aa)
链 O
1–451(451 aa)
链 P
1–451(451 aa)
链 Q
1–451(451 aa)
链 R
1–451(451 aa)
链 S
1–451(451 aa)
链 T
1–451(451 aa)
链 U
1–451(451 aa)
链 V
1–451(451 aa)
链 W
1–451(451 aa)
链 X
1–451(451 aa)
链 Y
1–451(451 aa)
链 Z
1–451(451 aa)
|
突变:E254D 突变:E254D 突变:E254D 突变:E254D 突变:E254D 突变:E254D 突变:E254D 突变:E254D 突变:E254D 突变:E254D 突变:E254D 突变:E254D 突变:E254D | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.70 Å |
| 8VRK Rigid body fitted model for refined density map of gamma tubulin ring complex capped microtubule 提交 2024-01-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric |
链 1
1–451(451 aa)
链 O
1–451(451 aa)
链 P
1–451(451 aa)
链 Q
1–451(451 aa)
链 R
1–451(451 aa)
链 S
1–451(451 aa)
链 T
1–451(451 aa)
链 U
1–451(451 aa)
链 V
1–451(451 aa)
链 W
1–451(451 aa)
链 X
1–451(451 aa)
链 Y
1–451(451 aa)
链 Z
1–451(451 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.50 Å |
| 8VT7 Structure of the gamma tubulin ring complex nucleated microtubule protofilament. 提交 2024-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.66 Å |
| 9BP6 Structure of alpha1B and betaI/IVb microtubule bound to GMPCPP 提交 2024-05-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 I
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Double-cycled GMPCPP microtubules were diluted to 2.5uM in Brb80 buffer. 5 ul of microtubules were applied to glow-discharged cryo-EM grid and allowed to absorb for 30 sec.
|
分辨率 3.10 Å |
| 9CMM Two protofilament structure of alpha1B and betaI/IVb microtubule bound to GMPCPP 提交 2024-07-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 I
1–451(451 aa)
|
未记录 | G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Double-cycled GMPCPP microtubules were diluted to 2.5uM in Brb80 buffer. 5 ul of microtubules were applied to glow-discharged cryo-EM grid and allowed to absorb for 30 sec.
|
分辨率 3.10 Å |
| 9COC Two protofilament structure of alpha1B and betaI/IVb microtubule bound to GDP 提交 2024-07-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 D
1–451(451 aa)
链 I
1–451(451 aa)
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;5 ul of microtubules were applied to glow-discharged electron microscopy grids and allowed to absorb for 30 sec.
|
分辨率 2.90 Å |
| 9F3B Undecorated 13pf E254Q microtubule from recombinant human tubulin 提交 2024-04-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric |
链 A
1–42(42 aa)
链 A
47–441(395 aa)
链 C
1–42(42 aa)
链 C
47–441(395 aa)
链 E
1–42(42 aa)
链 E
47–441(395 aa)
链 G
1–42(42 aa)
链 G
47–441(395 aa)
链 I
1–42(42 aa)
链 I
47–441(395 aa)
链 K
1–42(42 aa)
链 K
47–441(395 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9F3H Undecorated 13pf mosaic 20%E254Q - 80% E254QN microtubule from recombinant human tubulin 提交 2024-04-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric |
链 A
47–441(395 aa)
链 C
47–441(395 aa)
链 E
47–441(395 aa)
链 G
47–441(395 aa)
链 I
47–441(395 aa)
链 K
47–441(395 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 9F3R 13pf E254Q microtubule from recombinant human tubulin decorated with EB3 提交 2024-04-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:14-meric |
链 A
1–42(42 aa)
链 A
47–441(395 aa)
链 C
1–42(42 aa)
链 C
47–441(395 aa)
链 E
1–42(42 aa)
链 E
47–441(395 aa)
链 G
1–42(42 aa)
链 G
47–441(395 aa)
链 I
1–42(42 aa)
链 I
47–441(395 aa)
链 K
1–42(42 aa)
链 K
47–441(395 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 9F3S 13pf mosaic 20%E254Q - 80% E254N microtubule from recombinant human tubulin decorated with EB3 提交 2024-04-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:14-meric |
链 A
1–42(42 aa)
链 A
47–441(395 aa)
链 C
1–42(42 aa)
链 C
47–441(395 aa)
链 E
1–42(42 aa)
链 E
47–441(395 aa)
链 G
1–42(42 aa)
链 G
47–441(395 aa)
链 I
1–42(42 aa)
链 I
47–441(395 aa)
链 K
1–42(42 aa)
链 K
47–441(395 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 9HQ4 TTLL11 bound to microtubule 提交 2024-12-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录 | G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 TA1 TAXOL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7;40 mM Tris-HCl, pH 7.0, 1 mM TCEP, 1 mM MgCl2, 5 % glycerol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.28 Å |
| 9SMX CM1-activated gTuRC in complex with nascent alpha-E254D mutant microtubules 提交 2025-09-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 73 PDB 声明:73-meric |
链 BA
1–451(451 aa)
链 CA
1–451(451 aa)
链 DA
1–451(451 aa)
链 EA
1–451(451 aa)
链 FA
1–451(451 aa)
链 GA
1–451(451 aa)
链 HA
1–451(451 aa)
链 IA
1–451(451 aa)
链 JA
1–451(451 aa)
链 KA
1–451(451 aa)
链 LA
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.67 Å |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | TBA1B_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451 作者链 C; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451 作者链 E; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451 作者链 G; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451 作者链 I; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451 作者链 K; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451 作者链 M; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451 作者链 O; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451 |