7nnk

Crystal structure of S116A mutant of hydroxy ketone aldolase (SwHKA) from Sphingomonas wittichii RW1 in complex with hydroxypyruvate

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HpcH/HpaI aldolase

Sphingomonas wittichii (strain RW1 / DSM 6014 / JCM 10273)

UniProt A5VH82

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 6 3-HYDROXYPYRUVIC ACID × 3 MAGNESIUM ION × 6 water × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A5VH82_SPHWW
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–252; UniProt 2–251 作者链 B; PDB构建体 3–252; UniProt 2–251

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7nnk
沉积日期 deposition_date2021-02-25
结构标题 titleCrystal structure of S116A mutant of hydroxy ketone aldolase (SwHKA) from Sphingomonas wittichii RW1 in complex with hydroxypyruvate
关键词 keywordsClass II Pyruvate Aldolase, Metal Dependent, Aldol Reaction, Hydroxypyruvate, Pyruvate, Aldolase, Class II, LYASE; LYASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7nnk__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7nnk__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

7nnk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)33.11 Å
Rg(电子密度)31.65 Å
总 Rg32.30 Å
原子数22440
残基数1497
排除体积199090 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7nnk__assembly_1__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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7. 引用文献 (1)