7nti

Structure of TAK1 in complex with compound 22

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 69.0 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mitogen-activated protein kinase 7,TGF-beta-activated kinase 1 and MAP3K7-binding protein 1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 31–303	未记录	GOL GLYCEROL × 5 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 UWZ ~{N}-[[2-[bis(fluoranyl)methoxy]phenyl]methyl]-~{N}-[2-(methylamino)-2-oxidanylidene-ethyl]-2-pyrrolidin-1-ylcarbonyl-1~{H}-imidazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；293 K；0.60 M Sodium Chloride, 0.60 M Sodium Citrate, 0.10 M Tris-HCl pH 7.9	分辨率 1.98 Å R-free 0.249

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7NTI	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2EVA Structural Basis for the Interaction of TAK1 Kinase with its Activating Protein TAB1 提交 2005-10-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）链 A 468–497（30 aa）	未记录	ADN ADENOSINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.7M NaCitrate, 0.1M Tris-HCL, 0.2M NaCl, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.231
2YIY Crystal structure of compound 8 bound to TAK1-TAB 提交 2011-05-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 31-303, C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 468-497	未记录	YIY (1E)-1-[5-TERT-BUTYL-2-(3-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-3-YLIDENE]-3-(4-PYRIDIN-3-YLOXYPHENYL)UREA × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；0.1 M TRIS-HCL PH 7.5, 0.6 M SODIUM CITRATE, 0.2 M NACL, 10 MM DTT.	分辨率 2.49 Å R-free 0.245
4GS6 Irreversible Inhibition of TAK1 Kinase by 5Z-7-Oxozeaenol 提交 2012-08-27	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 1FM (3S,5Z,8S,9S,11E)-8,9,16-trihydroxy-14-methoxy-3-methyl-3,4,9,10-tetrahydro-1H-2-benzoxacyclotetradecine-1,7(8H)-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.55-0.75 M sodium citrate, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris, and 5mM adenosine. Adenosine bound crystals are backsoaked with inhibitor, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.245
4L3P Crystal Structure of 2-(1-benzothiophen-7-yl)-4-[1-(piperidin-4-yl)-1H-pyrazol-4-yl]furo[2,3-c]pyridin-7-amine bound to TAK1-TAB1 提交 2013-06-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）片段：SEE REMARK 999	未记录	1UH 2-(1-benzothiophen-7-yl)-4-[1-(piperidin-4-yl)-1H-pyrazol-4-yl]furo[2,3-c]pyridin-7-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.75 M sodium citrate, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M Tris, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.68 Å R-free 0.268
4L52 Crystal Structure of 1-(4-{4-[7-amino-2-(1,2,3-benzothiadiazol-7-yl)furo[2,3-c]pyridin-4-yl]-1H-pyrazol-1-yl}piperidin-1-yl)ethan-1-one bound to TAK1-TAB1 提交 2013-06-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）片段：SEE REMARK 999	未记录	1UL 1-(4-{4-[7-amino-2-(1,2,3-benzothiadiazol-7-yl)furo[2,3-c]pyridin-4-yl]-1H-pyrazol-1-yl}piperidin-1-yl)ethanone × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.75 M sodium citrate, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M TRIS, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.54 Å R-free 0.230
4L53 Crystal Structure of (1R,4R)-4-{4-[7-amino-2-(1,2,3-benzothiadiazol-7-yl)-3-chlorofuro[2,3-c]pyridin-4-yl]-1H-pyrazol-1-yl}cyclohexan-1-ol bound to TAK1-TAB1 提交 2013-06-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）片段：SEE REMARK 999	未记录	1UO trans-4-{4-[7-amino-2-(1,2,3-benzothiadiazol-7-yl)-3-chlorofuro[2,3-c]pyridin-4-yl]-1H-pyrazol-1-yl}cyclohexanol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.75 M sodium citrate, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M TRIS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.55 Å R-free 0.238
4O91 Crystal Structure of type II inhibitor NG25 bound to TAK1-TAB1 提交 2013-12-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）片段：KINASE DOMAIN OF TAK1 (UNP O43318 RESIDUES 31-303) AND RESIDUES 468-504 OF TAB1 (UNP Q15750)	未记录	NG2 N-{4-[(4-ethylpiperazin-1-yl)methyl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}-4-methyl-3-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yloxy)benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.65-0.75 M sodium citrate, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris, and 5mM adenosine. Adenosine bound TAK1-TAB1 crystals are backsoaked with inhibitor, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.39 Å R-free 0.207
4O91 Crystal Structure of type II inhibitor NG25 bound to TAK1-TAB1 提交 2013-12-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 31–303（273 aa）片段：KINASE DOMAIN OF TAK1 (UNP O43318 RESIDUES 31-303) AND RESIDUES 468-504 OF TAB1 (UNP Q15750)	未记录	NG2 N-{4-[(4-ethylpiperazin-1-yl)methyl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}-4-methyl-3-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yloxy)benzamide × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.65-0.75 M sodium citrate, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris, and 5mM adenosine. Adenosine bound TAK1-TAB1 crystals are backsoaked with inhibitor, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.39 Å R-free 0.207
5E7R Crystal structure of TL10-81 bound to TAK1-TAB1 提交 2015-10-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）片段：UNP O43318 residues 31-303, UNP Q15750 residues 468-504	未记录	5KW 2-chloro-N-{2-[(5-chloro-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)oxy]phenyl}acetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.65-0.75 M sodium citrate pH 7.0, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris pH 7.0, and 5mM adenosine. Adenosine bound TAK1-TAB1 crystals are backsoaked with inhibitor	分辨率 2.11 Å R-free 0.246
5GJD Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with ligand 2 提交 2016-06-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）片段：UNP residues 31-303,UNP residues 468-504	未记录	6V3 1-(4-((1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)oxy)phenyl)-3-(5-(4-methylpiperazin-1-yl)naphthalen-2-yl)urea × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.7；293 K；1.7M sodium potassium phosphate, 20%(v/v) Glycerol as cryoprotectant	分辨率 2.79 Å R-free 0.245
5GJF Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with ligand 3 提交 2016-06-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）片段：UNP residues 31-303,UNP residues 468-504	未记录	6V4 N-(2-isopropoxy-4-(4-methylpiperazine-1-carbonyl)phenyl)-2-(3-(3-phenylureido)phenyl)thiazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；1.94M sodium potassium phosphate, 20%(v/v) Glycerol as cryoprotectant	分辨率 2.89 Å R-free 0.234
5GJG Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with ligand 4 提交 2016-06-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）片段：UNP residues 31-303,UNP residues 468-504	未记录	6V5 N-(2-isopropoxy-4-(4-methylpiperazine-1-carbonyl)phenyl)-2-(3-(phenylcarbamoyl)phenyl)thiazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.7；294 K；1.7M sodium potassium phosphate, 20%(v/v) Glycerol as cryoprotectant	分辨率 2.61 Å R-free 0.221
5J7S Crystal structure of SM1-71 bound to TAK1-TAB1 提交 2016-04-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）片段：UNP O43318 residues 31-303, Q15750 residues 468-504	未记录	6H3 N-{2-[(5-chloro-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]phenyl}propanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.75M NaCitrate, 0.1M Tris-HCL, 0.2M NaCl, pH 7.0, 5mM Adenosine; Adenosine bound TAK1-TAB1 crystals are backsoaked with inhibitor.	分辨率 2.37 Å R-free 0.240
5J8I Crystal structure of TL11-113 bound to TAK1-TAB1 提交 2016-04-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）片段：UNP O43318 residues 31-303, Q15750 residues 468-504	未记录	6H4 N-{2-[(5-chloro-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)oxy]phenyl}prop-2-enamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.75M NaCitrate, 0.1M Tris-HCL, 0.2M NaCl, pH 7.0, 5mM Adenosine;	分辨率 2.40 Å R-free 0.244
5J9L Crystal structure of CPT1691 bound to TAK1-TAB1 提交 2016-04-10	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）	未记录	6HF N-(4-((2-((4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl)amino)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)oxy)phenyl)acrylamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.75M NaCitrate, 0.1M Tris-HCL, 0.2M NaCl, pH 7.0, 5mM Adenosine	分辨率 2.75 Å R-free 0.243
5JGA Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with ligand 11c 提交 2016-04-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）片段：UNP residues 31-303,UNP residues 468-504	未记录	6KC N-[5-(4-methylpiperazine-1-carbonyl)[1,1'-biphenyl]-2-yl]-4-oxo-3,4-dihydrothieno[3,2-d]pyrimidine-7-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.7；294 K；1.7M sodium potassium phosphate, 20%(v/v) Glycerol as cryoprotectant	分辨率 2.00 Å R-free 0.221
5JGB Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with ligand 10 提交 2016-04-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）片段：UNP residues 31-303,UNP residues 468-504	未记录	6JV N-(2-methoxy-4-{[3-(4-methylpiperazin-1-yl)propyl]carbamoyl}phenyl)-4-oxo-3,4-dihydrothieno[3,2-d]pyrimidine-7-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.7；293 K；1.7M sodium potassium phosphate, 20%(v/v) Glycerol as cryoprotectant	分辨率 2.80 Å R-free 0.244
5JGD Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with ligand 12 提交 2016-04-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）片段：UNP residues 31-303,UNP residues 468-504	未记录	6KD N-(2-isopropoxy-3-(4-methylpiperazine-1-carbonyl)phenyl)-4-oxo-3,4-dihydrothieno[3,2-d]pyrimidine-7-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；1.7M sodium potassium phosphate, 20%(v/v) Glycerol as cryoprotectant	分辨率 3.10 Å R-free 0.215
5JH6 Crystal structure of TL10-92 bound to TAK1-TAB1 提交 2016-04-20	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）	未记录	T92 2-[(5-chloro-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]phenyl prop-2-enoate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.65-0.75 M sodium citrate, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris, and 5mM adenosine. Adenosine bound TAK1-TAB1 crystals are backsoaked with inhibitor	分辨率 2.37 Å R-free 0.253
5JK3 Crystal structure of TL11-128 bound to TAK1-TAB1 提交 2016-04-25	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）	未记录	6L4 ~{N}-[2-[5-chloranyl-2-[(1-methylpyrazol-4-yl)amino]pyrimidin-4-yl]oxyphenyl]prop-2-enamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.65-0.75 M sodium citrate, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris, and 5mM adenosine. Adenosine bound TAK1-TAB1 crystals are backsoaked with inhibitor, pH 7.0	分辨率 2.37 Å R-free 0.266
5V5N Crystal structure of Takinib bound to TAK1 提交 2017-03-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）	未记录	EDH N~1~-(1-propyl-1,3-dihydro-2H-benzimidazol-2-ylidene)benzene-1,3-dicarboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.75M NaCitrate, 0.1M Tris-HCL, 0.2M NaCl, pH 7.0, 10mM DTT. 20% Ethyleneglycol as cryoprotectant.	分辨率 2.01 Å R-free 0.222
7NTH Structure of TAK1 in complex with compound 54 提交 2021-03-09	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 URW 2-[[5-[[2-[bis(fluoranyl)methoxy]phenyl]methyl-[(2~{R})-1-(methylamino)-1-oxidanylidene-propan-2-yl]carbamoyl]-1~{H}-imidazol-2-yl]carbonyl]isoindole-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；293 K；0.30 M Sodium Chloride, 0.60 M Sodium Citrate, 0.10 M Tris-HCl pH 7.6	分辨率 1.97 Å R-free 0.225
8GW3 Crystal structure of human TAK1 kinase domain fused with TAB1 提交 2022-09-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 15–303（289 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；2% (v/v) Tacsimate pH7.0, 0.1M HEPES pH 7.5, 20%(w/v) PEG3350	分辨率 2.05 Å R-free 0.258
8GW3 Crystal structure of human TAK1 kinase domain fused with TAB1 提交 2022-09-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 15–303（289 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；2% (v/v) Tacsimate pH7.0, 0.1M HEPES pH 7.5, 20%(w/v) PEG3350	分辨率 2.05 Å R-free 0.258
8GW3 Crystal structure of human TAK1 kinase domain fused with TAB1 提交 2022-09-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 15–303（289 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；2% (v/v) Tacsimate pH7.0, 0.1M HEPES pH 7.5, 20%(w/v) PEG3350	分辨率 2.05 Å R-free 0.258
8GW3 Crystal structure of human TAK1 kinase domain fused with TAB1 提交 2022-09-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 15–303（289 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；2% (v/v) Tacsimate pH7.0, 0.1M HEPES pH 7.5, 20%(w/v) PEG3350	分辨率 2.05 Å R-free 0.258
9FPD Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with compound S1 提交 2024-06-13	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–303（273 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	A1IED 6-[5-[6-(4-oxidanylcyclohexyl)oxy-1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl]-1,2-oxazol-3-yl]pyridine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Tris HCl pH 7.25, 0.9 M Tri-sodium citrate, 0.2 M sodium chloride, 10 mM DTT	分辨率 2.40 Å R-free 0.222
9NXF Crystal structure of CN:Tak1 complex 提交 2025-03-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 422–442（21 aa）	突变：Q441R,D442P 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	FE FE (III) ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；298 K；200 mM Sodium citrate tribasic pH 8.4, 22% PEG 3350, 3% ethanol. Microseeding	分辨率 3.13 Å R-free 0.295
9NXF Crystal structure of CN:Tak1 complex 提交 2025-03-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 422–442（21 aa）	突变：Q441R,D442P 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	FE FE (III) ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；298 K；200 mM Sodium citrate tribasic pH 8.4, 22% PEG 3350, 3% ethanol. Microseeding	分辨率 3.13 Å R-free 0.295

共 24 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	M3K7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 6–278； UniProt 31–303

Mitogen-activated protein kinase 7,TGF-beta-activated kinase 1 and MAP3K7-binding protein 1

Homo sapiens

UniProt Q15750

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 468–504	未记录	GOL GLYCEROL × 5 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 UWZ ~{N}-[[2-[bis(fluoranyl)methoxy]phenyl]methyl]-~{N}-[2-(methylamino)-2-oxidanylidene-ethyl]-2-pyrrolidin-1-ylcarbonyl-1~{H}-imidazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；293 K；0.60 M Sodium Chloride, 0.60 M Sodium Citrate, 0.10 M Tris-HCl pH 7.9	分辨率 1.98 Å R-free 0.249

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7NTI	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2J4O Structure of TAB1 提交 2006-09-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–401（401 aa）片段：N-TERMINAL PP2C-LIKE DOMAIN, RESIDUES 1-401	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；TAB1, WAS CONCENTRATED TO 14.1 MG/ML, AND CRYSTALLISED BY VAPOUR DIFFUSION. 1 MICROL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 1 MICROL OF MOTHER LIQUOR (100 MM HEPES PH 7.5, 1.5 M LI2SO4) AND 0.25 MICROL 100 MM BACL2. HEXAGONALLY-SHAPED CRYSTALS APPEARED WITHIN THREE DAYS.	分辨率 2.25 Å R-free 0.236
2POM TAB1 with manganese ion 提交 2007-04-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–370（370 aa）片段：N-TERMINAL PP2C-LIKE DOMAIN, RESIDUES 1-370	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；1.5M Li2SO4, 0.1M Hepes, 1mM MnCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.27 Å R-free 0.233
2POP The Crystal Structure of TAB1 and BIR1 complex 提交 2007-04-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–132（132 aa）片段：N-TERMINAL PP2C-LIKE DOMAIN, RESIDUES 1-370 链 A 152–370（219 aa）片段：N-TERMINAL PP2C-LIKE DOMAIN, RESIDUES 1-370 链 C 1–132（132 aa）片段：N-TERMINAL PP2C-LIKE DOMAIN, RESIDUES 1-370 链 C 152–370（219 aa）片段：N-TERMINAL PP2C-LIKE DOMAIN, RESIDUES 1-370	突变：Residues 133-151 were deleted 突变：Residues 133-151 were deleted 突变：Residues 133-151 were deleted 突变：Residues 133-151 were deleted	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；295 K；8.5% PEG8000, 4% ethylene glycol, 100mM Hepes, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 3.10 Å R-free 0.254
2YDS CpOGA D298N in complex with TAB1-derived O-GlcNAc peptide 提交 2011-03-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 T 392–398（7 aa）片段：RESIDUES 392-398	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CD CADMIUM ION × 19	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5	分辨率 2.55 Å R-free 0.238
2YIY Crystal structure of compound 8 bound to TAK1-TAB 提交 2011-05-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–497（30 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 31-303, C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 468-497	未记录	YIY (1E)-1-[5-TERT-BUTYL-2-(3-FLUOROPHENYL)-1H-PYRAZOL-3-YLIDENE]-3-(4-PYRIDIN-3-YLOXYPHENYL)UREA × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；0.1 M TRIS-HCL PH 7.5, 0.6 M SODIUM CITRATE, 0.2 M NACL, 10 MM DTT.	分辨率 2.49 Å R-free 0.245
4AY6 Human O-GlcNAc transferase (OGT) in complex with UDP-5SGlcNAc and substrate peptide 提交 2012-06-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 389–401（13 aa）片段：RESIDUES 389-401	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 12V (2S,3R,4R,5S,6R)-3-(acetylamino)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)tetrahydro-2H-thiopyran-2-yl [(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9.3；1.45 M K2HPO4, 10 MM EDTA, 1 % XYLITOL, pH 9.3	分辨率 3.30 Å R-free 0.272
4AY6 Human O-GlcNAc transferase (OGT) in complex with UDP-5SGlcNAc and substrate peptide 提交 2012-06-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 389–401（13 aa）片段：RESIDUES 389-401	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 12V (2S,3R,4R,5S,6R)-3-(acetylamino)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)tetrahydro-2H-thiopyran-2-yl [(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9.3；1.45 M K2HPO4, 10 MM EDTA, 1 % XYLITOL, pH 9.3	分辨率 3.30 Å R-free 0.272
4AY6 Human O-GlcNAc transferase (OGT) in complex with UDP-5SGlcNAc and substrate peptide 提交 2012-06-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 389–401（13 aa）片段：RESIDUES 389-401	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 12V (2S,3R,4R,5S,6R)-3-(acetylamino)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)tetrahydro-2H-thiopyran-2-yl [(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9.3；1.45 M K2HPO4, 10 MM EDTA, 1 % XYLITOL, pH 9.3	分辨率 3.30 Å R-free 0.272
4AY6 Human O-GlcNAc transferase (OGT) in complex with UDP-5SGlcNAc and substrate peptide 提交 2012-06-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 389–401（13 aa）片段：RESIDUES 389-401	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 12V (2S,3R,4R,5S,6R)-3-(acetylamino)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)tetrahydro-2H-thiopyran-2-yl [(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9.3；1.45 M K2HPO4, 10 MM EDTA, 1 % XYLITOL, pH 9.3	分辨率 3.30 Å R-free 0.272
4GS6 Irreversible Inhibition of TAK1 Kinase by 5Z-7-Oxozeaenol 提交 2012-08-27	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–504（37 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 1FM (3S,5Z,8S,9S,11E)-8,9,16-trihydroxy-14-methoxy-3-methyl-3,4,9,10-tetrahydro-1H-2-benzoxacyclotetradecine-1,7(8H)-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.55-0.75 M sodium citrate, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris, and 5mM adenosine. Adenosine bound crystals are backsoaked with inhibitor, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.245
4KA3 Structure of MAP kinase in complex with a docking peptide 提交 2013-04-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 395–415（21 aa）片段：UNP residues 395-415	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.86；294 K；100mM Hepes, 22% polyacrylic acid 5100, pH 7.86, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.71 Å R-free 0.267
4L3P Crystal Structure of 2-(1-benzothiophen-7-yl)-4-[1-(piperidin-4-yl)-1H-pyrazol-4-yl]furo[2,3-c]pyridin-7-amine bound to TAK1-TAB1 提交 2013-06-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–504（37 aa）片段：SEE REMARK 999	未记录	1UH 2-(1-benzothiophen-7-yl)-4-[1-(piperidin-4-yl)-1H-pyrazol-4-yl]furo[2,3-c]pyridin-7-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.75 M sodium citrate, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M Tris, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.68 Å R-free 0.268
4L52 Crystal Structure of 1-(4-{4-[7-amino-2-(1,2,3-benzothiadiazol-7-yl)furo[2,3-c]pyridin-4-yl]-1H-pyrazol-1-yl}piperidin-1-yl)ethan-1-one bound to TAK1-TAB1 提交 2013-06-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–496（29 aa）片段：SEE REMARK 999	未记录	1UL 1-(4-{4-[7-amino-2-(1,2,3-benzothiadiazol-7-yl)furo[2,3-c]pyridin-4-yl]-1H-pyrazol-1-yl}piperidin-1-yl)ethanone × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.75 M sodium citrate, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M TRIS, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.54 Å R-free 0.230
4L53 Crystal Structure of (1R,4R)-4-{4-[7-amino-2-(1,2,3-benzothiadiazol-7-yl)-3-chlorofuro[2,3-c]pyridin-4-yl]-1H-pyrazol-1-yl}cyclohexan-1-ol bound to TAK1-TAB1 提交 2013-06-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–496（29 aa）片段：SEE REMARK 999	未记录	1UO trans-4-{4-[7-amino-2-(1,2,3-benzothiadiazol-7-yl)-3-chlorofuro[2,3-c]pyridin-4-yl]-1H-pyrazol-1-yl}cyclohexanol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.75 M sodium citrate, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M TRIS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.55 Å R-free 0.238
4O91 Crystal Structure of type II inhibitor NG25 bound to TAK1-TAB1 提交 2013-12-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–504（37 aa）片段：KINASE DOMAIN OF TAK1 (UNP O43318 RESIDUES 31-303) AND RESIDUES 468-504 OF TAB1 (UNP Q15750)	未记录	NG2 N-{4-[(4-ethylpiperazin-1-yl)methyl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}-4-methyl-3-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yloxy)benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.65-0.75 M sodium citrate, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris, and 5mM adenosine. Adenosine bound TAK1-TAB1 crystals are backsoaked with inhibitor, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.39 Å R-free 0.207
4O91 Crystal Structure of type II inhibitor NG25 bound to TAK1-TAB1 提交 2013-12-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 468–504（37 aa）片段：KINASE DOMAIN OF TAK1 (UNP O43318 RESIDUES 31-303) AND RESIDUES 468-504 OF TAB1 (UNP Q15750)	未记录	NG2 N-{4-[(4-ethylpiperazin-1-yl)methyl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}-4-methyl-3-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yloxy)benzamide × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.65-0.75 M sodium citrate, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris, and 5mM adenosine. Adenosine bound TAK1-TAB1 crystals are backsoaked with inhibitor, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.39 Å R-free 0.207
5DIY Thermobaculum terrenum O-GlcNAc hydrolase mutant - D120N 提交 2015-09-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 392–398（7 aa）片段：UNP residues 392-398	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；38% PEG-4000, 400 mM sodium acetate, 0.1 M Tris-HCl	分辨率 2.06 Å R-free 0.236
5DIY Thermobaculum terrenum O-GlcNAc hydrolase mutant - D120N 提交 2015-09-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Q 392–398（7 aa）片段：UNP residues 392-398	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；38% PEG-4000, 400 mM sodium acetate, 0.1 M Tris-HCl	分辨率 2.06 Å R-free 0.236
5E7R Crystal structure of TL10-81 bound to TAK1-TAB1 提交 2015-10-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–504（37 aa）片段：UNP O43318 residues 31-303, UNP Q15750 residues 468-504	未记录	5KW 2-chloro-N-{2-[(5-chloro-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)oxy]phenyl}acetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.65-0.75 M sodium citrate pH 7.0, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris pH 7.0, and 5mM adenosine. Adenosine bound TAK1-TAB1 crystals are backsoaked with inhibitor	分辨率 2.11 Å R-free 0.246
5GJD Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with ligand 2 提交 2016-06-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–504（37 aa）片段：UNP residues 31-303,UNP residues 468-504	未记录	6V3 1-(4-((1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)oxy)phenyl)-3-(5-(4-methylpiperazin-1-yl)naphthalen-2-yl)urea × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.7；293 K；1.7M sodium potassium phosphate, 20%(v/v) Glycerol as cryoprotectant	分辨率 2.79 Å R-free 0.245
5GJF Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with ligand 3 提交 2016-06-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–504（37 aa）片段：UNP residues 31-303,UNP residues 468-504	未记录	6V4 N-(2-isopropoxy-4-(4-methylpiperazine-1-carbonyl)phenyl)-2-(3-(3-phenylureido)phenyl)thiazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；1.94M sodium potassium phosphate, 20%(v/v) Glycerol as cryoprotectant	分辨率 2.89 Å R-free 0.234
5GJG Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with ligand 4 提交 2016-06-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–504（37 aa）片段：UNP residues 31-303,UNP residues 468-504	未记录	6V5 N-(2-isopropoxy-4-(4-methylpiperazine-1-carbonyl)phenyl)-2-(3-(phenylcarbamoyl)phenyl)thiazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.7；294 K；1.7M sodium potassium phosphate, 20%(v/v) Glycerol as cryoprotectant	分辨率 2.61 Å R-free 0.221
5J7S Crystal structure of SM1-71 bound to TAK1-TAB1 提交 2016-04-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–504（37 aa）片段：UNP O43318 residues 31-303, Q15750 residues 468-504	未记录	6H3 N-{2-[(5-chloro-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]phenyl}propanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.75M NaCitrate, 0.1M Tris-HCL, 0.2M NaCl, pH 7.0, 5mM Adenosine; Adenosine bound TAK1-TAB1 crystals are backsoaked with inhibitor.	分辨率 2.37 Å R-free 0.240
5J8I Crystal structure of TL11-113 bound to TAK1-TAB1 提交 2016-04-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–504（37 aa）片段：UNP O43318 residues 31-303, Q15750 residues 468-504	未记录	6H4 N-{2-[(5-chloro-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)oxy]phenyl}prop-2-enamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.75M NaCitrate, 0.1M Tris-HCL, 0.2M NaCl, pH 7.0, 5mM Adenosine;	分辨率 2.40 Å R-free 0.244
5J9L Crystal structure of CPT1691 bound to TAK1-TAB1 提交 2016-04-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–497（30 aa）	未记录	6HF N-(4-((2-((4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl)amino)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)oxy)phenyl)acrylamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.75M NaCitrate, 0.1M Tris-HCL, 0.2M NaCl, pH 7.0, 5mM Adenosine	分辨率 2.75 Å R-free 0.243
5JGA Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with ligand 11c 提交 2016-04-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–504（37 aa）片段：UNP residues 31-303,UNP residues 468-504	未记录	6KC N-[5-(4-methylpiperazine-1-carbonyl)[1,1'-biphenyl]-2-yl]-4-oxo-3,4-dihydrothieno[3,2-d]pyrimidine-7-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.7；294 K；1.7M sodium potassium phosphate, 20%(v/v) Glycerol as cryoprotectant	分辨率 2.00 Å R-free 0.221
5JGB Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with ligand 10 提交 2016-04-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–504（37 aa）片段：UNP residues 31-303,UNP residues 468-504	未记录	6JV N-(2-methoxy-4-{[3-(4-methylpiperazin-1-yl)propyl]carbamoyl}phenyl)-4-oxo-3,4-dihydrothieno[3,2-d]pyrimidine-7-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.7；293 K；1.7M sodium potassium phosphate, 20%(v/v) Glycerol as cryoprotectant	分辨率 2.80 Å R-free 0.244
5JGD Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with ligand 12 提交 2016-04-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–504（37 aa）片段：UNP residues 31-303,UNP residues 468-504	未记录	6KD N-(2-isopropoxy-3-(4-methylpiperazine-1-carbonyl)phenyl)-4-oxo-3,4-dihydrothieno[3,2-d]pyrimidine-7-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；1.7M sodium potassium phosphate, 20%(v/v) Glycerol as cryoprotectant	分辨率 3.10 Å R-free 0.215
5JH6 Crystal structure of TL10-92 bound to TAK1-TAB1 提交 2016-04-20	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–504（37 aa）	未记录	T92 2-[(5-chloro-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]phenyl prop-2-enoate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.65-0.75 M sodium citrate, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris, and 5mM adenosine. Adenosine bound TAK1-TAB1 crystals are backsoaked with inhibitor	分辨率 2.37 Å R-free 0.253
5JK3 Crystal structure of TL11-128 bound to TAK1-TAB1 提交 2016-04-25	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–504（37 aa）	未记录	6L4 ~{N}-[2-[5-chloranyl-2-[(1-methylpyrazol-4-yl)amino]pyrimidin-4-yl]oxyphenyl]prop-2-enamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.65-0.75 M sodium citrate, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris, and 5mM adenosine. Adenosine bound TAK1-TAB1 crystals are backsoaked with inhibitor, pH 7.0	分辨率 2.37 Å R-free 0.266
5NZZ Crystal structure of phosphorylated p38aMAPK in complex with TAB1 提交 2017-05-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–504（504 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；20% PEG3350, 0.1M magensium chloride, 0.1M magnesium sulphate, 0.1M Tris pH8.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.271
5NZZ Crystal structure of phosphorylated p38aMAPK in complex with TAB1 提交 2017-05-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–504（504 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 2 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；20% PEG3350, 0.1M magensium chloride, 0.1M magnesium sulphate, 0.1M Tris pH8.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.271
5NZZ Crystal structure of phosphorylated p38aMAPK in complex with TAB1 提交 2017-05-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–504（504 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 2 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；20% PEG3350, 0.1M magensium chloride, 0.1M magnesium sulphate, 0.1M Tris pH8.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.271
5NZZ Crystal structure of phosphorylated p38aMAPK in complex with TAB1 提交 2017-05-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–504（504 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；20% PEG3350, 0.1M magensium chloride, 0.1M magnesium sulphate, 0.1M Tris pH8.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.271
5O90 Crystal structure of a P38alpha T185G mutant in complex with TAB1 peptide. 提交 2017-06-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 386–414（29 aa）片段：UNP residues 386-414	未记录	SB4 4-(4-FLUOROPHENYL)-1-(4-PIPERIDINYL)-5-(2-AMINO-4-PYRIMIDINYL)-IMIDAZOLE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；20% PEG3350 0.2M Na/K Tartrate 0.1M pH7.0 Bis-Tris Propane	分辨率 2.49 Å R-free 0.275
5V5N Crystal structure of Takinib bound to TAK1 提交 2017-03-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–497（30 aa）	未记录	EDH N~1~-(1-propyl-1,3-dihydro-2H-benzimidazol-2-ylidene)benzene-1,3-dicarboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.75M NaCitrate, 0.1M Tris-HCL, 0.2M NaCl, pH 7.0, 10mM DTT. 20% Ethyleneglycol as cryoprotectant.	分辨率 2.01 Å R-free 0.222
7NTH Structure of TAK1 in complex with compound 54 提交 2021-03-09	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–504（37 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 URW 2-[[5-[[2-[bis(fluoranyl)methoxy]phenyl]methyl-[(2~{R})-1-(methylamino)-1-oxidanylidene-propan-2-yl]carbamoyl]-1~{H}-imidazol-2-yl]carbonyl]isoindole-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；293 K；0.30 M Sodium Chloride, 0.60 M Sodium Citrate, 0.10 M Tris-HCl pH 7.6	分辨率 1.97 Å R-free 0.225
8GW3 Crystal structure of human TAK1 kinase domain fused with TAB1 提交 2022-09-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–504（37 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；2% (v/v) Tacsimate pH7.0, 0.1M HEPES pH 7.5, 20%(w/v) PEG3350	分辨率 2.05 Å R-free 0.258
8GW3 Crystal structure of human TAK1 kinase domain fused with TAB1 提交 2022-09-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 468–504（37 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；2% (v/v) Tacsimate pH7.0, 0.1M HEPES pH 7.5, 20%(w/v) PEG3350	分辨率 2.05 Å R-free 0.258
8GW3 Crystal structure of human TAK1 kinase domain fused with TAB1 提交 2022-09-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 468–504（37 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；2% (v/v) Tacsimate pH7.0, 0.1M HEPES pH 7.5, 20%(w/v) PEG3350	分辨率 2.05 Å R-free 0.258
8GW3 Crystal structure of human TAK1 kinase domain fused with TAB1 提交 2022-09-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 468–504（37 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；2% (v/v) Tacsimate pH7.0, 0.1M HEPES pH 7.5, 20%(w/v) PEG3350	分辨率 2.05 Å R-free 0.258
8XI8 The Crystal Structure of TAB1 from Biortus. 提交 2023-12-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–370（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M Li2SO4, 0.1M Tris-HCl pH8.5, 16% PEG 4000	分辨率 3.35 Å R-free 0.252
9FPD Crystal structure of human TAK1/TAB1 fusion protein in complex with compound S1 提交 2024-06-13	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 468–504（37 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	A1IED 6-[5-[6-(4-oxidanylcyclohexyl)oxy-1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl]-1,2-oxazol-3-yl]pyridine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Tris HCl pH 7.25, 0.9 M Tri-sodium citrate, 0.2 M sodium chloride, 10 mM DTT	分辨率 2.40 Å R-free 0.222

共 32 个其他 PDB 条目、43 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TAB1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 279–315； UniProt 468–504

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7nti
沉积日期 deposition_date	2021-03-09
结构标题 title	Structure of TAK1 in complex with compound 22
关键词 keywords	Kinase, inhibitor, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	20.78 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	19.71 Å
零角强度 I(0) i0	19585500.00
分子量 molecular_weight	34130.0 kDa
排除体积 excluded_volume	42922 Å³
包络体积 envelope_volume	49744 Å³
水化壳体积 shell_volume	21009 Å³
包络直径 envelope_diameter	74.2 Å
壳层 Rg shell_rg	26.37 Å
包络 Rg envelope_rg	20.11 Å
形状 Rg shape_rg	19.71 Å
总 Rg total_rg	20.62 Å
总原子数 total_atoms	2395
残基数 n_residues	293
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	69.0 Å
Rg (实空间) rg_real	20.70 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.47 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.9590e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.4310e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	20.72 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	19590000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8041
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	26.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.271
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.294
角度范围 angular_range	— – 0.3800 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	5184000.0000
实空间数据点数 n_real_points	70
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.817; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.000

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Mitogen-activated protein kinase 7,TGF-beta-activated kinase 1 and MAP3K7-binding protein 1
分子量 formula_weight	35520.9 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.25
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2526

GSLHMIDYKEIEVEEVVGRGAFGVVCKAKWRAKDVAIKQIESESERKAFIVELRQLSRVNHPNIVKLYGACLNPVCLVMEYAEGGSLYNVLHGAEPLPYYTAAHAMSWCLQCSQGVAYLHSMQPKALIHRDLKPPNLLLVAGGTVLKICDFGTACDIQTHMTNNKGSAAWMAPEVFEGSNYSEKCDVFSWGIILWEVITRRKPFDEIGGPAFRIMWAVHNGTRPPLIKNLPKPIESLMTRCWSKDPSQRPSMEEIVKIMTHLMRYFPGADEPLQYPCQHSLPPGEDGRVEPYVDFAEFYRLWSVDHGEQSVVTAP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	DIMETHYL SULFOXIDE
分子量 formula_weight	78.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	;~{N}-[[2-[bis(fluoranyl)methoxy]phenyl]methyl]-~{N}-[2-(methylamino)-2-oxidanylidene-ethyl]-2-pyrrolidin-1-ylcarbonyl-1~{H}-imidazole-4-carboxamide ;
分子量 formula_weight	435.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	84

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	58.165 Å
晶胞边长 b length_b	134.542 Å
晶胞边长 c length_c	152.693 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	I 2 2 2
空间群编号 int_tables_number	23
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.980 Å
最低分辨率 resolution_low	28.600 Å
R 因子 r_factor	0.2219
R_work r_work	0.2205
R_free r_free	0.2491

fit	/app/data/saxs_computation/nt/7nti/7nti.fit
pddf	/app/data/pr_computation/nt/7nti/7nti.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/nt/7nti/7nti.dat

Structure of TAK1 in complex with compound 22

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mitogen-activated protein kinase 7,TGF-beta-activated kinase 1 and MAP3K7-binding protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Mitogen-activated protein kinase 7,TGF-beta-activated kinase 1 and MAP3K7-binding protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)