7odd

Crystal structure of bovine Hsc70(aa1-554)E213A/D214A in complex with tricine

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 97.4 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Heat shock cognate 71 kDa protein

Bos taurus

UniProt P19120

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–554	突变：E213A, D214A	GOL GLYCEROL × 3 VLS N-[1,3-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)propan-2-yl]glycine × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：MICROBATCH；pH 7.5；291 K；PEG 8000, TMAO, HEPES-NaOH, glycerol	分辨率 1.98 Å R-free 0.245

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7ODD	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1ATR THREONINE 204 OF THE CHAPERONE PROTEIN HSC70 INFLUENCES THE STRUCTURE OF THE ACTIVE SITE BUT IS NOT ESSENTIAL FOR ATP HYDROLYSIS 提交 1993-08-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–386（386 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.34 Å
1ATS THREONINE 204 OF THE CHAPERONE PROTEIN HSC70 INFLUENCES THE STRUCTURE OF THE ACTIVE SITE BUT IS NOT ESSENTIAL FOR ATP HYDROLYSIS 提交 1993-08-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–386（386 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.43 Å
1BA0 HEAT-SHOCK COGNATE 70KD PROTEIN 44KD ATPASE N-TERMINAL 1NGE 3 提交 1998-04-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–386（386 aa）片段：44KD ATPASE N-TERMINAL FRAGMENT	突变：D206K	MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；20% PEG-8000 1.0M NACL 50MM CHES, PH 9 1MM MGATP, pH 9.0	分辨率 1.90 Å R-free 0.275
1BA1 HEAT-SHOCK COGNATE 70KD PROTEIN 44KD ATPASE N-TERMINAL MUTANT WITH CYS 17 REPLACED BY LYS 提交 1998-04-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–386（386 aa）片段：44KD ATPASE N-TERMINAL FRAGMENT	突变：C17K	MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；20% PEG-8000 1.0M NACL 50MM CHES, PH 9 1MM MGATP, pH 9.0	分辨率 1.70 Å R-free 0.244
1BUP T13S MUTANT OF BOVINE 70 KILODALTON HEAT SHOCK PROTEIN 提交 1998-09-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–386（386 aa）片段：ATPASE FRAGMENT	突变：T13S	MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；pH 9.0	分辨率 1.70 Å R-free 0.220
1HPM HOW POTASSIUM AFFECTS THE ACTIVITY OF THE MOLECULAR CHAPERONE HSC70. II. POTASSIUM BINDS SPECIFICALLY IN THE ATPASE ACTIVE SITE 提交 1995-03-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–386（386 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 K POTASSIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.70 Å
1HX1 CRYSTAL STRUCTURE OF A BAG DOMAIN IN COMPLEX WITH THE HSC70 ATPASE DOMAIN 提交 2001-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 4–381（378 aa）片段：ATPASE DOMAIN	未记录	TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；PEG3350, Tris, Na-K-tartrate, glycerol, DTT, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.279
1KAX 70KD HEAT SHOCK COGNATE PROTEIN ATPASE DOMAIN, K71M MUTANT 提交 1996-04-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–381（381 aa）片段：ATPASE DOMAIN	突变：K71M	CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.70 Å R-free 0.264
1KAY 70KD HEAT SHOCK COGNATE PROTEIN ATPASE DOMAIN, K71A MUTANT 提交 1996-04-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–381（381 aa）片段：ATPASE DOMAIN	突变：K71A	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 K POTASSIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.70 Å R-free 0.243
1KAZ 70KD HEAT SHOCK COGNATE PROTEIN ATPASE DOMAIN, K71E MUTANT 提交 1996-04-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–381（381 aa）片段：ATPASE DOMAIN	突变：K71E	MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.70 Å R-free 0.234
1NGA STRUCTURAL BASIS OF THE 70-KILODALTON HEAT SHOCK COGNATE PROTEIN ATP HYDROLYTIC ACTIVITY, II. STRUCTURE OF THE ACTIVE SITE WITH ADP OR ATP BOUND TO WILD TYPE AND MUTANT ATPASE FRAGMENT 提交 1994-05-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–386（386 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.18 Å
1NGB STRUCTURAL BASIS OF THE 70-KILODALTON HEAT SHOCK COGNATE PROTEIN ATP HYDROLYTIC ACTIVITY, II. STRUCTURE OF THE ACTIVE SITE WITH ADP OR ATP BOUND TO WILD TYPE AND MUTANT ATPASE FRAGMENT 提交 1994-05-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–386（386 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.18 Å
1NGC STRUCTURAL BASIS OF THE 70-KILODALTON HEAT SHOCK COGNATE PROTEIN ATP HYDROLYTIC ACTIVITY, II. STRUCTURE OF THE ACTIVE SITE WITH ADP OR ATP BOUND TO WILD TYPE AND MUTANT ATPASE FRAGMENT 提交 1994-05-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–386（386 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å
1NGD STRUCTURAL BASIS OF THE 70-KILODALTON HEAT SHOCK COGNATE PROTEIN ATP HYDROLYTIC ACTIVITY, II. STRUCTURE OF THE ACTIVE SITE WITH ADP OR ATP BOUND TO WILD TYPE AND MUTANT ATPASE FRAGMENT 提交 1994-05-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–386（386 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.18 Å
1NGE STRUCTURAL BASIS OF THE 70-KILODALTON HEAT SHOCK COGNATE PROTEIN ATP HYDROLYTIC ACTIVITY, II. STRUCTURE OF THE ACTIVE SITE WITH ADP OR ATP BOUND TO WILD TYPE AND MUTANT ATPASE FRAGMENT 提交 1994-05-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–386（386 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.05 Å
1NGF STRUCTURAL BASIS OF THE 70-KILODALTON HEAT SHOCK COGNATE PROTEIN ATP HYDROLYTIC ACTIVITY, II. STRUCTURE OF THE ACTIVE SITE WITH ADP OR ATP BOUND TO WILD TYPE AND MUTANT ATPASE FRAGMENT 提交 1994-05-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–386（386 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.17 Å
1NGG STRUCTURAL BASIS OF THE 70-KILODALTON HEAT SHOCK COGNATE PROTEIN ATP HYDROLYTIC ACTIVITY, II. STRUCTURE OF THE ACTIVE SITE WITH ADP OR ATP BOUND TO WILD TYPE AND MUTANT ATPASE FRAGMENT 提交 1994-05-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–386（386 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.19 Å
1NGH STRUCTURAL BASIS OF THE 70-KILODALTON HEAT SHOCK COGNATE PROTEIN ATP HYDROLYTIC ACTIVITY, II. STRUCTURE OF THE ACTIVE SITE WITH ADP OR ATP BOUND TO WILD TYPE AND MUTANT ATPASE FRAGMENT 提交 1994-05-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–386（386 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.23 Å
1NGI STRUCTURAL BASIS OF THE 70-KILODALTON HEAT SHOCK COGNATE PROTEIN ATP HYDROLYTIC ACTIVITY, II. STRUCTURE OF THE ACTIVE SITE WITH ADP OR ATP BOUND TO WILD TYPE AND MUTANT ATPASE FRAGMENT 提交 1994-05-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–386（386 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.15 Å
1NGJ STRUCTURAL BASIS OF THE 70-KILODALTON HEAT SHOCK COGNATE PROTEIN ATP HYDROLYTIC ACTIVITY, II. STRUCTURE OF THE ACTIVE SITE WITH ADP OR ATP BOUND TO WILD TYPE AND MUTANT ATPASE FRAGMENT 提交 1994-05-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–386（386 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å
1QQM D199S MUTANT OF BOVINE 70 KILODALTON HEAT SHOCK PROTEIN 提交 1999-06-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 4–381（378 aa）片段：HSC70 ATPASE FRAGMENT	突变：D199S	MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；277 K；POLYETHYLENE GLYCOL 8000, POTASSIUM CHLORIDE, pH 9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K	分辨率 1.90 Å R-free 0.234
1QQN D206S MUTANT OF BOVINE 70 KILODALTON HEAT SHOCK PROTEIN 提交 1999-06-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 4–381（378 aa）片段：HSC70 ATPASE FRAGMENT	突变：D206S	K POTASSIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；277 K；POLYETHYLENE GLYCOL 8000, POTASSIUM CHLORIDE, pH 9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K	分辨率 1.90 Å R-free 0.229
1QQO E175S MUTANT OF BOVINE 70 KILODALTON HEAT SHOCK PROTEIN 提交 1999-06-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 4–381（378 aa）	突变：E175S	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 K POTASSIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；277 K；POLYETHYLENE GLYCOL 8000, POTASSIUM CHLORIDE, pH 9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K	分辨率 1.90 Å R-free 0.239
1YUW crystal structure of bovine hsc70(aa1-554)E213A/D214A mutant 提交 2005-02-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–554（554 aa）	突变：E213A, D214A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 8；289 K；PEG8000,trimethyl amine oxide, pH 8.0, microbatch, temperature 289K	分辨率 2.60 Å R-free 0.297
2BUP T13G Mutant of the ATPASE fragment of Bovine HSC70 提交 1998-09-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–381（381 aa）片段：ATPASE	突变：T13G	PO4 PHOSPHATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；pH 9.0	分辨率 1.70 Å R-free 0.224
2QW9 Crystal structure of bovine hsc70 (1-394aa)in the apo state 提交 2007-08-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–394（394 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 microbatch under oil；pH 8；289 K；PEG3350, Calcium Acetate, pH 8.0, microbatch under oil, temperature 289K	分辨率 1.85 Å R-free 0.236
2QW9 Crystal structure of bovine hsc70 (1-394aa)in the apo state 提交 2007-08-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–394（394 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 microbatch under oil；pH 8；289 K；PEG3350, Calcium Acetate, pH 8.0, microbatch under oil, temperature 289K	分辨率 1.85 Å R-free 0.236
2QWL Crystal structure of bovine hsc70 (1-394aa)in the ADP state 提交 2007-08-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–394（394 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 microbatch under oil；pH 8；289 K；PEG3350, Calcium Acetate, pH 8.0, microbatch under oil, temperature 289K	分辨率 1.75 Å R-free 0.209
2QWL Crystal structure of bovine hsc70 (1-394aa)in the ADP state 提交 2007-08-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–394（394 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 microbatch under oil；pH 8；289 K；PEG3350, Calcium Acetate, pH 8.0, microbatch under oil, temperature 289K	分辨率 1.75 Å R-free 0.209
2QWM Crystal structure of bovine hsc70 (1-394aa)in the ADP*Vi state 提交 2007-08-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–394（394 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 2 VO4 VANADATE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 microbatch under oil；pH 8；289 K；PEG3350, Calcium Acetate, pH 8.0, microbatch under oil, temperature 289K	分辨率 1.86 Å R-free 0.224
2QWM Crystal structure of bovine hsc70 (1-394aa)in the ADP*Vi state 提交 2007-08-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–394（394 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 2 VO4 VANADATE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 microbatch under oil；pH 8；289 K；PEG3350, Calcium Acetate, pH 8.0, microbatch under oil, temperature 289K	分辨率 1.86 Å R-free 0.224
2QWN Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-386aa)R171C and bovine Auxilin (810-910aa)D876C in the ADP*Pi state 提交 2007-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–394（394 aa）	突变：R171C	PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 microbatch under oil；pH 8；289 K；PEG3350, Ammonium Acetate, pH 8.0, microbatch under oil, temperature 289K	分辨率 2.40 Å R-free 0.279
2QWO Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)R171C and bovine Auxilin (810-910aa)D876C in the ADP*Pi form #1 提交 2007-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–394（394 aa）	突变：R171C	PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACY ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 microbatch under oil；pH 8.5；289 K；PEG3350, Ammonium Acetate, pH 8.5, microbatch under oil, temperature 289K	分辨率 1.70 Å R-free 0.222
2QWP Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)R171C and bovine Auxilin (810-910aa)D876C in the ADP*Pi form #2 提交 2007-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–394（394 aa）	突变：R171C	PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACY ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 microbatch under oil；pH 8.5；289 K；PEG3350, Ammonium Acetate, pH 8.5, microbatch under oil, temperature 289K	分辨率 1.75 Å R-free 0.243
2QWQ Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)R171C and bovine Auxilin (810-910aa)D876C in the AMPPNP hydrolyzed form 提交 2007-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–394（394 aa）	突变：R171C	PO4 PHOSPHATE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACY ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 microbatch under oil；pH 8.5；289 K；PEG3350, Ammonium Acetate, pH 8.5, microbatch under oil, temperature 289K	分辨率 2.21 Å R-free 0.295
2QWR Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)R171C and bovine Auxilin (810-910aa)D876C in the AMPPNP intact form 提交 2007-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–394（394 aa）	突变：R171C	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ACY ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 microbatch under oil；pH 8.5；289 K；PEG3350, Ammonium Acetate, pH 8.5, microbatch under oil, temperature 289K	分辨率 2.21 Å R-free 0.294
3C7N Structure of the Hsp110:Hsc70 Nucleotide Exchange Complex 提交 2008-02-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–554（554 aa）片段：residues 1-554	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 CL CHLORIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；LiSO4, PEG 400, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.12 Å R-free 0.283
3HSC THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE ATPASE FRAGMENT OF A 70K HEAT-SHOCK COGNATE PROTEIN 提交 1995-03-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–386（386 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.93 Å
4FL9 Crystal Structure of bovine hsc70(aa1-554)E213A/D214A at 1.9A Resolution 提交 2012-06-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–554（554 aa）片段：UNP residues 1-554	突变：E213A, D214A	TMO trimethylamine oxide × 2 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；291 K；PEG8000,TRIMETHYL AMINE OXIDE , pH 7.5, Microbatch, temperature 291K	分辨率 1.90 Å R-free 0.232
6H54 CRYSTAL STRUCTURE OF BOVINE HSC70(AA1-554)E213A/D214A IN COMPLEX WITH INHIBITOR VER155008 提交 2018-07-23	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–554（554 aa）	未记录	TMO trimethylamine oxide × 1 3FD 4-[[(2R,3S,4R,5R)-5-[6-amino-8-[(3,4-dichlorophenyl)methylamino]purin-9-yl]-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxymethyl]benzonitrile × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；291 K；PEG 4000, TMAO, Glycerol	分辨率 2.02 Å R-free 0.258
7O6R Crystal structure of bovine Hsc70(aa1-554)E213A/D214A in complex with 1H-Indazole 提交 2021-04-12	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–554（554 aa）	突变：E213A, D214A	EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 LZ1 1H-indazole × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1 K POTASSIUM ION × 2 TMO trimethylamine oxide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；291 K；PEG 8000, TMAO, potassium chloride, HEPES-NaOH, glycerol	分辨率 2.00 Å R-free 0.244
7ODB Crystal structure of bovine Hsc70(aa1-554)E213A/D214A in complex with triazine-derivative 提交 2021-04-29	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–554（554 aa）	突变：E213A, D214A	EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 K POTASSIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 3 V8Q 6-methyl-5-sulfanylidene-2H-1,2,4-triazin-3-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；291 K；PEG 8000, TMAO. potassium chloride, HEPES-NaOH, glycerol	分辨率 1.66 Å R-free 0.208
7ODI Crystal structure of bovine Hsc70(aa1-554)E213A/D214A in complex with methanesulfonamide 提交 2021-04-29	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–554（554 aa）	突变：E213A, D214A	EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 V7Z methanesulfonamide × 2 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；291 K；PEG 8000, TMAO, HEPES-NaOH, glycerol	分辨率 1.83 Å R-free 0.245
7PLK Crystal structure bovine Hsc70(aa1-554)E213A/D214A in complex with nicotinic-acid-derivative 提交 2021-08-31	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–554（554 aa）	突变：E213A, D214A	7UE 5-pyrrol-1-ylpyridine-3-carboxylic acid × 1 K POTASSIUM ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；291 K；PEG 8000, TMAO, potassium chloride, HEPES-NaOH, glycerol	分辨率 2.49 Å R-free 0.286

共 41 个其他 PDB 条目、44 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HSP7C_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–554； UniProt 1–554

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7odd
沉积日期 deposition_date	2021-04-29
结构标题 title	Crystal structure of bovine Hsc70(aa1-554)E213A/D214A in complex with tricine
关键词 keywords	CHAPERONE; CHAPERONE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	28.65 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	28.24 Å
零角强度 I(0) i0	59379100.00
分子量 molecular_weight	59924.0 kDa
排除体积 excluded_volume	74985 Å³
包络体积 envelope_volume	93664 Å³
水化壳体积 shell_volume	29343 Å³
包络直径 envelope_diameter	104.0 Å
壳层 Rg shell_rg	33.55 Å
包络 Rg envelope_rg	28.36 Å
形状 Rg shape_rg	28.24 Å
总 Rg total_rg	28.74 Å
总原子数 total_atoms	4208
残基数 n_residues	539
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	97.4 Å
Rg (实空间) rg_real	28.80 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.87 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.9380e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	9.3850e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	28.74 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	59380000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8579
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	30.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.532
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.143
角度范围 angular_range	— – 0.2750 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	13350000.0000
实空间数据点数 n_real_points	56
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.800; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.858; Smooth: 0.891

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Heat shock cognate 71 kDa protein
分子量 formula_weight	60978.9 kDa
突变 mutation	E213A, D214A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4366

MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIAAGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVE

来源 Source

来源生物 organism	Bos taurus
通用名 common_name	Bovine
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9913
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	N-[1,3-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)propan-2-yl]glycine
分子量 formula_weight	179.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID
分子量 formula_weight	238.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	146

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	7oddA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	7oddA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	34 — Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	66.057 Å
晶胞边长 b length_b	49.073 Å
晶胞边长 c length_c	87.271 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	99.69 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	monoclinic

分辨率 resolution	1.984 Å
最低分辨率 resolution_low	42.630 Å
R 因子 r_factor	0.2262
R_work r_work	0.2251
R_free r_free	0.2452

fit	/app/data/saxs_computation/od/7odd/7odd.fit
pddf	/app/data/pr_computation/od/7odd/7odd.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/od/7odd/7odd.dat