7odv

Plant peptide hormone receptor complex H1LS1

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Receptor-like protein kinase HSL1

Arabidopsis thaliana

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 3 其他聚合物 6	Somatic embryogenesis receptor kinase 1 × 1 （Q94AG2） Protein IDA × 1 （Q8LAD7） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
2	其他组合	异源复合物	蛋白 3 其他聚合物 9	Somatic embryogenesis receptor kinase 1 × 1 （Q94AG2） Protein IDA × 1 （Q8LAD7） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 alpha-L-fucopyranose-(1-6)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 2 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HSL1_ARATH
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 AAA； PDB构建体 6–607； UniProt 17–618 作者链 DDD； PDB构建体 6–607； UniProt 17–618

Somatic embryogenesis receptor kinase 1

Arabidopsis thaliana

UniProt Q94AG2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 3 其他聚合物 6	Receptor-like protein kinase HSL1 × 1 （Q9SGP2） Protein IDA × 1 （Q8LAD7） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
2	其他组合	异源复合物	蛋白 3 其他聚合物 9	Receptor-like protein kinase HSL1 × 1 （Q9SGP2） Protein IDA × 1 （Q8LAD7） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 alpha-L-fucopyranose-(1-6)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 2 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SERK1_ARATH
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 BBB； PDB构建体 5–192； UniProt 24–211 作者链 EEE； PDB构建体 5–192； UniProt 24–211

Protein IDA

Arabidopsis thaliana

UniProt Q8LAD7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 3 其他聚合物 6	Receptor-like protein kinase HSL1 × 1 （Q9SGP2） Somatic embryogenesis receptor kinase 1 × 1 （Q94AG2） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
2	其他组合	异源复合物	蛋白 3 其他聚合物 9	Receptor-like protein kinase HSL1 × 1 （Q9SGP2） Somatic embryogenesis receptor kinase 1 × 1 （Q94AG2） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 alpha-L-fucopyranose-(1-6)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 2 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IDA_ARATH
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 CCC； PDB构建体 2–14； UniProt 57–69 作者链 FFF； PDB构建体 2–14； UniProt 57–69

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7odv
沉积日期 deposition_date	2021-04-30
结构标题 title	Plant peptide hormone receptor complex H1LS1
关键词 keywords	Plant receptor LRR pepide hormone, PEPTIDE BINDING PROTEIN Complex, PEPTIDE BINDING PROTEIN; PEPTIDE BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7odv__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7odv__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7odv__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	33.44 Å
Rg（电子密度）	32.65 Å
总 Rg	33.24 Å
原子数	6234
残基数	793
排除体积	110950 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7odv__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`7odv__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Receptor-like protein kinase HSL1
分子量 formula_weight	66569.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AAA,DDD
原子数 atom_count	12821

GSSMDNQDGFILQQVKLSLDDPDSYLSSWNSNDASPCRWSGVSCAGDFSSVTSVDLSSANLAGPFPSVICRLSNLAHLSLYNNSINSTLPLNIAACKSLQTLDLSQNLLTGELPQTLADIPTLVHLDLTGNNFSGDIPASFGKFENLEVLSLVYNLLDGTIPPFLGNISTLKMLNLSYNPFSPSRIPPEFGNLTNLEVMWLTECHLVGQIPDSLGQLSKLVDLDLALNDLVGHIPPSLGGLTNVVQIELYNNSLTGEIPPELGNLKSLRLLDASMNQLTGKIPDELCRVPLESLNLYENNLEGELPASIALSPNLYEIRIFGNRLTGGLPKDLGLNSPLRWLDVSENEFSGDLPADLCAKGELEELLIIHNSFSGVIPESLADCRSLTRIRLAYNRFSGSVPTGFWGLPHVNLLELVNNSFSGEISKSIGGASNLSLLILSNNEFTGSLPEEIGSLDNLNQLSASGNKFSGSLPDSLMSLGELGTLDLHGNQFSGELTSGIKSWKKLNELNLADNEFTGKIPDEIGSLSVLNYLDLSGNMFSGKIPVSLQSLKLNQLNLSYNRLSGDLPPSLAKDMYKNSFIGNPGLCGDIKGLCGSENEAKKRGYVLEGSENLYFQ

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	Mouse-ear cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Somatic embryogenesis receptor kinase 1
分子量 formula_weight	21978.7 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.10.1,2.7.11.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	BBB,EEE

GSSMASANLEGDALHTLRVTLVDPNNVLQSWDPTLVNPCTWFHVTCNNENSVIRVDLGNAELSGHLVPELGVLKNLQYLELYSNNITGPIPSNLGNLTNLVSLDLYLNSFSGPIPESLGKLSKLRFLRLNNNSLTGSIPMSLTNITTLQVLDLSNNRLSGSVPDNGSFSLFTPISFANNLDLCGPVTSHPCPLEGSLENLYFQ

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	Mouse-ear cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Protein IDA
分子量 formula_weight	1581.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	CCC,FFF

YVPIPPSAPSKRHN

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	Mouse-ear cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 4 Entity 4 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	11

实体 6 Entity 6 branched

描述 description	alpha-L-fucopyranose-(1-6)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	367.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

实体 10 Entity 10 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	362

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晶胞边长 a length_a	97.332 Å
晶胞边长 b length_b	145.878 Å
晶胞边长 c length_c	169.539 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.310 Å
最低分辨率 resolution_low	110.580 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2546
R_free r_free	0.2750

Plant peptide hormone receptor complex H1LS1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Receptor-like protein kinase HSL1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Somatic embryogenesis receptor kinase 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein IDA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7odv__assembly_2__model_1

7odv__assembly_2__model_1 | I(q)

7odv__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 branched

实体 6 Entity 6 branched

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 non-polymer

实体 10 Entity 10 water

7. 引用文献 (1)

Plant peptide hormone receptor complex H1LS1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Receptor-like protein kinase HSL1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Somatic embryogenesis receptor kinase 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein IDA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7odv__assembly_2__model_1

7odv__assembly_2__model_1 | I(q)

7odv__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 branched

实体 6 Entity 6 branched

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 non-polymer

实体 10 Entity 10 water

7. 引用文献 (1)