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7PVN
Crystal Structure of Human UBA6 in Complex with ATP
提交 2021-10-05
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
1–1052(1052 aa)
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突变:C625A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GOL GLYCEROL × 4
MG MAGNESIUM ION × 1
CA CALCIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M Na-cacodylate, 0.16 M Ca-acetate, 15% PEG 8000 and 16% Glycerol
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分辨率 2.71 Å
R-free 0.262
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7PVN
Crystal Structure of Human UBA6 in Complex with ATP
提交 2021-10-05
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 B
1–1052(1052 aa)
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突变:C625A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GOL GLYCEROL × 4
MG MAGNESIUM ION × 1
CA CALCIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M Na-cacodylate, 0.16 M Ca-acetate, 15% PEG 8000 and 16% Glycerol
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分辨率 2.71 Å
R-free 0.262
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7SOL
Crystal Structures of the bispecific ubiquitin/FAT10 activating enzyme, Uba6
提交 2021-10-31
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
37–1052(1016 aa)
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突变:C625A
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IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;20 % PEG 3350, 0.2 M NaF
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分辨率 2.25 Å
R-free 0.206
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7SOL
Crystal Structures of the bispecific ubiquitin/FAT10 activating enzyme, Uba6
提交 2021-10-31
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 C
37–1052(1016 aa)
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突变:C625A
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AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;20 % PEG 3350, 0.2 M NaF
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分辨率 2.25 Å
R-free 0.206
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9QGW
Consensus structure of UBA6-UbDha-BIRC6 trapped ternary complex (singly loaded)
提交 2025-03-14
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 B
1–1052(1052 aa)
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未记录
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IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.62 Å
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9QH5
Consensus structure of UBA6-UbDha-BIRC6 trapped ternary complex (doubly loaded)
提交 2025-03-14
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 B
1–1052(1052 aa)
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未记录
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IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.09 Å
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9QHI
Structure of UBA6-UbDha-BIRC6 trapped ternary complex (cluster 0)
提交 2025-03-15
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 B
1–1052(1052 aa)
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未记录
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IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.27 Å
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9QIA
Structure of UBA6-UbDha-BIRC6 trapped ternary complex (cluster 2)
提交 2025-03-18
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 B
1–1052(1052 aa)
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未记录
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IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.38 Å
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9QIC
Consensus structure of UBA6
提交 2025-03-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1–1052(1052 aa)
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未记录
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IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.29 Å
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9QIG
Structure of UBA6 (cluster 2)
提交 2025-03-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1–1052(1052 aa)
|
未记录
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IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.94 Å
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9QII
Structure of UBA6 (cluster 3)
提交 2025-03-17
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1–1052(1052 aa)
|
未记录
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IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.99 Å
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9QIM
Consensus structure of UBA6-BIRC6
提交 2025-03-17
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
1–1052(1052 aa)
|
未记录
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IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.57 Å
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9QIO
Structure of UBA6-BIRC6 (cluster 0)
提交 2025-03-17
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–1052(1052 aa)
|
未记录
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IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.22 Å
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9QIP
Structure of UBA6-BIRC6 (cluster 4)
提交 2025-03-17
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–1052(1052 aa)
|
未记录
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IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.15 Å
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9QIV
Consensus structure of UBA6-BIRC6 (alternative conformation)
提交 2025-03-17
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–1052(1052 aa)
|
未记录
|
IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.44 Å
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